Publications of Stephan Schiffels

Papac, L.; Ernée, M.; Dobeš, M.; Langová, M.; Rohrlach, A. B.; Aron, F.; Neumann, G.; Spyrou, M. A.; Rohland, N.; Velemínský, P. et al.; Kuna, M.; Brzobohatá, H.; Culleton, B.; Daněček, D.; Danielisová, A.; Dobisíková, M.; Hložek, J.; Kennett, D. J.; Klementová, J.; Kostka, M.; Krištuf, P.; Kuchařík, M.; Hlavová, J. K.; Limburský, P.; Malyková, D.; Mattiello, L.; Petriščáková, M. P.; Průchová, E.; Stránská, P.; Smejtek, L.; Šumberová, J. Š.; Švejcar, O.; Trefný, M.; Vávra, M.; Kolář, J.; Volker , H.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Reich, D.; Schiffels, S.; Haak, W.: Dynamic changes in genomic and social structures in third millennium BCE central Europe. Science Advances 7 (35), 6941 (2021)

Freilich, S.; Ringbauer, H.; Los, D.; Novak, M.; Pavičić, D. T.; Schiffels, S.; Pinhasi, R.: Reconstructing genetic histories and social organisation in Neolithic and Bronze Age Croatia. Scientific Reports, 16729 (2021)

Schmid, C.; Schiffels, S.: bleiglas: An R package for interpolation and visualisation of spatiotemporal data with 3D tessellation. The Journal of Open Source Software 6 (60), 3092 (2021)

Wang, C.-C.; Yeh, H.-Y.; Popov, A. N.; Zhang, H.-Q.; Matsumura, H.; Sirak, K.; Cheronet, O.; Kovalev, A.; Rohland, N.; Kim, A. M. et al.; Mallick, S.; Bernardos, R.; Tumen, D.; Zhao, J.; Liu, Y.-C.; Liu, J.-Y.; Mah, M.; Wang, K.; Zhang, Z.; Adamski, N.; Broomandkhoshbacht, N.; Callan, K.; Candilio, F.; Carlson, K. S. D.; Culleton, B. J.; Eccles, L.; Freilich, S.; Keating, D.; Lawson, A. M.; Mandl, K.; Michel, M.; Oppenheimer, J.; Özdoğan, K. T.; Stewardson, K.; Wen, S.; Yan, S.; Zalzala, F.; Chuang, R.; Huang, C.-J.; Looh, H.; Shiung, C.-C.; Nikitin, Y. G.; Tabarev, A. V.; Tishkin, A. A.; Lin, S.; Sun, Z.-Y.; Wu, X.-M.; Yang, T.-L.; Hu, X.; Chen, L.; Du, H.; Bayarsaikhan, J.; Mijiddorj, E.; Erdenebaatar, D.; Iderkhangai, T.-O.; Myagmar, E.; Kanzawa-Kiriyama, H.; Nishino, M.; Shinoda, K.-i.; Shubina, O. A.; Guo, J.; Cai, W.; Deng, Q.; Kang, L.; Li, D.; Li, D.; Lin, R.; Nini; Shrestha, R.; Wang, L.-X.; Wei, L.; Xie, G.; Yao, H.; Zhang, M.; He, G.; Yang, X.; Hu, R.; Robbeets, M.; Schiffels, S.; Kennett, D. J.; Jin, L.; Li, H.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Reich, D.: Genomic Insights into the Formation of Human Populations in East Asia. Nature, s41586-021-03336-2 (2021)

Bleasdale, M.; Richter, K. K.; Janzen, A.; Brown, S.; Scott, A.; Zech, J.; Wilkin, S.; Wang, K.; Schiffels, S.; Desideri, J. et al.; Besse, M.; Reinold, J.; Saad, M.; Babiker, H.; Power, R. C.; Ndiema, E.; Ogola, C.; Manthi, F. K.; Zahir, M.; Petraglia, M. D.; Trachsel, C.; Nanni, P.; Grossmann, J.; Hendy, J.; Crowther, A.; Roberts, P.; Goldstein, S. T.; Boivin, N. L.: Ancient proteins provide evidence of dairy consumption in eastern Africa. Nature Communications 12, 632 (2021)

Jeong, C.; Wang, K.; Wilkin, S.; Taylor, W. T. T.; Miller, B. K.; Bemmann, J. H.; Stahl, R.; Chiovelli, C.; Knolle, F.; Ulziibayar, S. et al.; Khatanbaatar, D.; Erdenebaatar, D.; Erdenebat, U.; Ochir, A.; Ankhsanaa, G.; Vanchigdash, C.; Ochir, B.; Munkhbayar, C.; Tumen, D.; Kovalev, A.; Kradin, N.; Bazarov, B. A.; Miyagashev, D. A.; Konovalov, P. B.; Zhambaltarova, E.; Ventresca Miller, A. R.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.; Boivin, N. L.; Erdene, M.; Hendy, J.; Warinner, C. G.: A dynamic 6,000-year genetic history of Eurasia’s eastern steppe. Cell 183 (4), pp. 890 - 904.e29 (2020)

Wang, K.; Goldstein, S. T.; Bleasdale, M.; Clist, B.; Bostoen, K.; Bakwa-Lufu, P.; Buck, L. T.; Crowther, A.; Dème, A.; McIntosh, R. J. et al.; Mercader, J.; Ogola, C.; Power, R. C.; Sawchuk, E. A.; Robertshaw, P.; Wilmsen, E. N.; Petraglia, M. D.; Ndiema, E.; Manthi, F. K.; Krause, J.; Roberts, P.; Boivin, N. L.; Schiffels, S.: Ancient genomes reveal complex patterns of population movement, interaction, and replacement in sub-Saharan Africa. Science Advances 6 (24), eaaz0183 (2020)

Rivollat, M.; Jeong, C.; Schiffels, S.; Kücükkalıpcı, İ.; Pemonge, M.-H.; Rohrlach, A. B.; Alt, K. W.; Binder, D.; Friederich, S.; Ghesquière, E. et al.; Gronenborn, D.; Laporte, L.; Lefranc, P.; Meller, H.; Réveillas, H.; Rosenstock, E.; Rottier, S.; Scarre, C.; Soler, L.; Wahl, J.; Krause, J.; Deguilloux, M.-F.; Haak, W.: Ancient genome-wide DNA from France highlights the complexity of interactions between Mesolithic hunter-gatherers and Neolithic farmers. Science Advances 6 (22), eaaz5344 , pp. 1 - 16 (2020)

Furtwängler, A.; Rohrlach, A. B.; Lamnidis, T. C.; Papac, L.; Neumann, G.; Siebke, I.; Reiter, E.; Steuri, N.; Hald, J.; Denaire, A. et al.; Schnitzler, B.; Wahl, J.; Ramstein, M.; Schuenemann, V. J.; Stockhammer, P. W.; Hafner, A.; Lösch, S.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.: Ancient genomes reveal social and genetic structure of Late Neolithic Switzerland. Nature Communications 11, 1915 (2020)

Wang, K.; Mathieson, I.; O'Connell, J.; Schiffels, S.: Tracking human population structure through time from whole genome sequences. PLoS Genetics 16 (3), e1008552, pp. 1 - 24 (2020)

Mittnik, A.; Massy, K.; Knipper, C.; Wittenborn, F.; Pfrengle, S.; Carlichi-Witjes, N.; Deeg, H.; Furtwängler, A.; Harbeck, M.; von Heyking, K. et al.; Kociumaka, C.; Kucukkalipci, I.; Lindauer, S.; Metz, S.; Staskiewicz, A.; Thiel, A.; Wahl, J.; Haak, W.; Pernicka, E.; Schiffels, S.; Stockhammer, P. W.; Krause, J.: Kinship-based social inequality in Bronze Age Europe. Science 366 (6466), aax6219 , pp. 731 - 734 (2019)

Flegontov, P.; Altınışık, N. E.; Changmai, P.; Rohland, N.; Mallick, S.; Adamski, N.; Bolnick, D. A.; Broomandkhoshbacht, N.; Candilio, F.; Culleton, B. J. et al.; Flegontova, O.; Friesen, T. M.; Jeong, C.; Harper, T. K.; Keating, D.; Kennett, D. J.; Kim, A. M.; Lamnidis, T. C.; Lawson, A. M.; Olalde, I.; Oppenheimer, J.; Potter, B. A.; Raff, J.; Sattler, R. A.; Skoglund, P.; Stewardson, K.; Vajda, E. J.; Vasilyev, S.; Veselovskaya, E.; O’Rourke, M. G. H. D. H.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Schiffels, S.: Palaeo-Eskimo genetic ancestry and the peopling of Chukotka and North America. Nature 570, pp. 236 - 240 (2019)

Jeong, C.; Balanovsky, O.; Lukianova, E.; Kahbatkyzy, N.; Flegontov, P.; Zaporozhchenko, V.; Immel, A.; Wang, C.-C.; Ixan, O.; Khussainova, E. et al.; Bekmanov, B.; Zaibert, V.; Lavryashina, M.; Pocheshkhova, E.; Yusupov, Y.; Agdzhoyan, A.; Koshel, S.; Bukin, A.; Nymadawa, P.; Turdikulova, S.; Dalimova, D.; Churnosov, M.; Skhalyakho, R.; Daragan, D.; Bogunov, Y.; Bogunova, A.; Shtrunov, A.; Dubova, N.; Zhabagin, M.; Yepiskoposyan, L.; Churakov, V.; Pislegin, N.; Damba, L.; Saroyants, L.; Dibirova, K.; Atramentova, L.; Utevska, O.; Idrisov, E.; Kamenshchikova, E.; Evseeva, I.; Metspalu, M.; Outram, A. K.; Robbeets, M.; Djansugurova, L.; Balanovska, E.; Schiffels, S.; Haak, W.; Reich, D.; Krause, J.: The genetic history of admixture across inner Eurasia. Nature Ecology & Evolution 3, pp. 966 - 976 (2019)

Villalba-Mouco, V.; Loosdrecht, M. S. v. d.; Posth, C.; Mora, R.; Martínez-Moreno, J.; Rojo-Guerra, M.; Salazar-García, D. C.; Royo-Guillén, J. I.; Kunst, M.; Rougier, H. et al.; Crevecoeur, I.; Arcusa-Magallón, H.; Tejedor-Rodríguez, C.; de Lagrán, I. G.-M.; Garrido-Pena, R.; Alt, K. W.; Jeong, C.; Schiffels, S.; Utrilla, P.; Krause, J.; Haak, W.: Survival of Late Pleistocene Hunter-Gatherer ancestry in the Iberian Peninsula. Current Biology 29 (7), pp. 1169 - 1177 (2019)

Wang, C.-C.; Reinhold, S.; Kalmykov, A.; Wissgott, A.; Brandt, G.; Jeong, C.; Cheronet, O.; Ferry, M.; Harney, E.; Keating, D. et al.; Mallick, S.; Rohland, N.; Stewardson, K.; Kantorovich, A. R.; Maslov, V. E.; Petrenko, V. G.; Erlikh, V. R.; Atabiev, B. C.; Magomedov, R. G.; Kohl, P. L.; Alt, K. W.; Pichler, S. L.; Gerling, C.; Meller, H.; Vardanyan, B.; Yeganyan, L.; Rezepkin, A. D.; Mariaschk, D.; Berezina, N.; Gresky, J.; Fuchs, K.; Knipper, C.; Schiffels, S.; Balanovska, E.; Balanovsky, O.; Mathieson, I.; Higham, T.; Berezin, Y. B.; Buzhilova, A.; Trifonov, V.; Pinhasi, R.; Belinskij, A. B.; Reich, D.; Hansen, S.; Krause, J.; Haak, W.: Ancient human genome-wide data from a 3000-year interval in the Caucasus corresponds with eco-geographic regions. Nature Communications 10 (1), 590 (2019)

Gurdasani, D.; Carstensen, T.; Fatumo, S.; Chen, G.; Franklin, C. S.; Prado-Martinez, J.; Bouman, H.; Abascal, F.; Haber, M.; Tachmazidou, I. et al.; Mathieson, I.; Ekoru, K.; DeGorter, M. K.; Nsubuga, R. N.; Finan, C.; Wheeler, E.; Chen, L.; Cooper, D. N.; Schiffels, S.; Chen, Y.; Ritchie, G. R.S.; Pollard, M. O.; Fortune, M. D.; Mentzer, A. J.; Garrison, E.; Bergstrom, A.; Hatzikotoulas, K.; Adeyemo, A.; Doumatey, A.; Elding, H.; Wain, L. V.; Ehret, G.; Auer, P. L.; Kooperberg, C. L.; Reiner, A. P.; Franceschini, N.; Maher, D. P.; Montgomery, S. B.; Kadie, C.; Widmer, C.; Xue, Y.; Seeley, J.; Asiki, G.; Kamali, A.; Young, E. H.; Pomilla, C.; Soranzo, N.; Zeggini, E.; Pirie, F.; Morris, A. P.; Heckerman, D.; Tyler-Smith, C.; Motala, A.; Rotimi, C.; Kaleebu, P.; Barroso, I.; Sandhu, M. S.: Uganda genome resource enables insights into population history and genomic discovery in Africa. Cell 179 (4), pp. 984 - 1002.e36 (2019)

Lamnidis, T. C.; Majander, K.; Jeong, C.; Salmela, E.; Wessman, A.; Moiseyev, V.; Khartanovich, V.; Balanovsky, O.; Ongyerth, M.; Weihmann, A. et al.; Sajantila, A.; Kelso, J.; Pääbo, S.; Onkamo, P.; Haak, W.; Krause, J.; Schiffels, S.: Ancient Fennoscandian genomes reveal origin and spread of Siberian ancestry in Europe. Nature Communications 9, 5018 (2018)

Posth, C.; Nakatsuka, N.; Lazaridis, I.; Skoglund, P.; Mallick, S.; Lamnidis, T. C.; Rohland, N.; Nägele, K.; Adamski, N.; Bertolini, E. et al.; Broomandkhoshbacht, N.; Cooper, A.; Culleton, B. J.; Ferraz da Silva, T.; Ferry, M.; Furtwängler, A.; Haak, W.; Harkins, K.; Harper, T. K.; Hünemeier, T.; Lawson, A. M.; Llamas, B.; Michel, M.; Nelson, E. A.; Oppenheimer, J.; Patterson, N.; Schiffels, S.; Sedig, J.; Stewardson, K.; Talamo, S.; Wang, C.-C.; Hublin, J.-J.; Hubbe, M.; Harvati, K.; Delaunay, A. N.; Beier, J.; Francken, M.; Kaulicke, P.; Reyes-Centeno, H.; Rademaker, K.; Trask, W. R.; Robinson, M.; Gutierrez, S. M.; Prufer, K. M.; Salazar-García, D. C.; Chim, E. N.; Gomes, L. M. P.; Alves, M. L.; Liryo, A.; Inglez, M.; Oliveira, R. E.; Bernardo, D. V.; Barioni, A.; Wesolowski, V.; Scheifler, N. A.; Rivera, M. A.; Plens, C. R.; Messineo, P. G.; Figuti, L.; Corach, D.; Scabuzzo, C.; Eggers, S.; DeBlasis, P.; Reindel, M.; Méndez, C.; Politis, G.; Tomasto-Cagigao, E.; Kennett, D. J.; Strauss, A.; Fehren-Schmitz, L.; Krause, J.; Reich, D.: Reconstructing the deep population history of Central and South America. Cell 175 (5), e22, pp. 1185 - 1197 (2018)

Haak, W.; Schiffels, S.: Möglichkeiten und Grenzen molekulargenetischer Untersuchungen in den Geschichtswissenschaften. NTM: Zeitschrift für Geschichte der Wissenschaften, Technik und Medizin 26 (3), pp. 310 - 324 (2018)

Potter, B. A.; Baichtal, J. F.; Beaudoin, A. B.; Fehren-Schmitz, L.; Haynes, C. V.; Holliday, V. T.; Holmes, C. E.; Ives, J. W.; Kelly, R. L.; Llamas, B. et al.; Malhi, R. S.; Miller, D. S.; Reich, D.; Reuther, J. D.; Schiffels, S.; Surovell, T. A.: Current evidence allows multiple models for the peopling of the Americas. Science Advances 4 (8), eaat5473 (2018)