Publications of Kay Prüfer

Yu, H.; Loosdrecht, M. S. v. d.; Mannino, M. A.; Talamo, S.; Rohrlach, A. B.; Childebayeva, A.; Villalba-Mouco, V.; Aron, F.; Brandt, G.; Burri, M. et al.; Freund, C.; Radzeviciute, R.; Stahl, R.; Wissgott, A.; Fewlass, H.; Tagliacozzo, A.; Piperno, M.; Tusa, S.; Collina, C.; Schimmenti, V.; Di Salvo, R.; Prüfer, K.; Posth, C.; Hublin, J.-J.; Gronenborn, D.; Binder, D.; Jeong, C.; Haak, W.; Krause, J.: Genomic and dietary discontinuities during the Mesolithic and Neolithic in Sicily. iScience 5 (25), 104244, pp. 1 - 28 (2022)

Kocher, A.; Papac, L.; Barquera Lozano, R. J.; Key, F. M.; Spyrou, M. A.; Hübler, R.; Rohrlach, A. B.; Aron, F.; Stahl, R.; Wissgott, A. et al.; van Bömmel, F.; Pfefferkorn, M.; Mittnik, A.; Villalba-Mouco, V.; Neumann, G.; Rivollat, M.; Loosdrecht, M. S. v. d.; Majander, K.; Tukhbatova, R. I.; Musralina, L.; Ghalichi, A.; Penske, S. E.; Sabin, S.; Michel, M.; Gretzinger, J.; Nelson, E. A.; Ferraz da Silva, T.; Nägele, K.; Parker, C. E.; Keller, M.; Guevara, E.; Feldman, M.; Eisenmann, S.; Skourtanioti, E.; Giffin, K.; Gnecchi Ruscone, G. A.; Friederich, S.; Schimmenti, V.; Khartanovich, V.; Karapetian, M. K.; Chaplygin, M. S.; Kufterin, V. V.; Khokhlov, A. A.; Chizhevsky, A. A.; Stashenkov, D. A.; Kochkina, A. F.; Tejedor-Rodríguez, C.; de Lagrán, Í. G.-M.; Arcusa-Magallón, H.; Garrido-Pena, R.; Royo-Guillén, J. I.; Novácek, J.; Rottier, S.; Kacki, S.; Saintot, S.; Kaverzneva, E.; Belinskiy, A. B.; Velemínský, P.; Limburský, P.; Kostka, M.; Loe, L.; Popescu, E.; Clarke, R.; Lyons, A.; Mortimer, R.; Sajantila, A.; de Armas, Y. C.; Godoy, S. T. H.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Pearson, J.; Binder, D.; Lefranc, P.; Kantorovich, A. R.; Maslov, V. E.; Lai, L.; Zoledziewska, M.; Beckett, J. F.; Langová, M.; Danielisová, A.; Ingman, T.; Atiénzar, G. G.; de Ibáñez, M. P. M.; Romero, A.; Sperduti, A.; Beckett, S.; Salter, S. J.; Zilivinskaya, E. D.; Vasilev, D. V.; von Heyking, K.; Burger, R. L.; Salazar, L. C.; Amkreutz, L.; Navruzbekov, M.; Rosenstock, E.; Alonso-Fernández, C.; Slavchev, V.; Kalmykov, A. A.; Atabiev, B. C.; Batieva, E.; Calmet, M. A.; Llamas, B.; Schultz, M.; Krauß, R.; Jiménez-Echevarría, J.; Francken, M.; Shnaider, S.; de Knijff, P.; Altena, E.; de Vijver, K. V.; Fehren-Schmitz, L.; Tung, T. A.; Lösch, S.; Dobrovolskaya, M.; Makarov, N.; Read, C.; Twest, M. V.; Sagona, C.; Ramsl, P. C.; Akar, M.; Yener, K. A.; Ballestero, E. C.; Cucca, F.; Mazzarello, V.; Utrilla, P.; Rademaker, K.; Fernández-Domínguez, E.; Baird, D.; Semal, P.; Márquez-Morfín, L.; Roksandic, M.; Steiner, H.; Salazar-García, D. C.; Shishlina, N.; Erdal, Y. S.; Hallgren, F.; Boyadzhiev, Y.; Boyadzhiev, K.; Küßner, M.; Sayer, D.; Onkamo, P.; Skeates, R.; Rojo-Guerra, M.; Buzhilova, A.; Khussainova, E.; Djansugurova, L. B.; Beisenov, A. Z.; Samashev, Z.; Massy, K.; Mannino, M.; Moiseyev, V.; Mannermaa, K.; Balanovsky, O.; Deguilloux, M.-F.; Reinhold, S.; Hansen, S.; Kitov, E. P.; Dobeš, M.; Ernée, M.; Meller, H.; Alt, K. W.; Prüfer, K.; Warinner, C. G.; Schiffels, S.; Stockhammer, P. W.; Bos, K. I.; Posth, C.; Herbig, A.; Haak, W.; Krause, J.; Kühnert, D.: Ten millennia of hepatitis B virus evolution. Science 374 (6564), abi5658, pp. 182 - 188 (2021)

Carlhoff, S.; Duli, A.; Nägele, K.; Nur, M.; Skov, L.; Sumantri, I.; Oktaviana, A. A.; Hakim, B.; Burhan, B.; Syahdar, F. A. et al.; McGahan, D. P.; Bulbeck, D.; Perston, Y. L.; Newman, K.; Saiful, A. M.; Ririmasse, M.; Chia, S.; Hasanuddin; Pulubuhu, D. A. T.; Suryatman; Supriadi; Jeong, C.; Peter, B.; Prüfer, K.; Powell, A.; Krause, J.; Posth, C.; Brumm, A.: Genome of a middle Holocene hunter-gatherer from Wallacea. Nature 596 (7873), pp. 543 - 547 (2021)

Prüfer, K.; Posth, C.; Yu, H.; Stoessel, A.; Spyrou, M. A.; Deviese, T.; Mattonai, M.; Ribechini, E.; Higham, T.; Velemínský, P. et al.; Brůžek, J.; Krause, J.: A genome sequence from a modern human skull over 45,000 years old from Zlatý kůň in Czechia. Nature Ecology & Evolution, s41559-021-01443-x (2021)

Peyrégne, S.; Prüfer, K.: Present-Day DNA Contamination in Ancient DNA Datasets. Bioessays 42 (9), 2000081 (2020)

Peyrégne, S.; Slon, V.; Mafessoni, F.; De Filippo, C.; Hajdinjak, M.; Nagel, S.; Nickel, B.; Essel, E.; Le Cabec, A.; Wehrberger, K. et al.; Conard, N. J.; Kind, C. J.; Posth, C.; Krause, J.; Abrams, G.; Bonjean, D.; Modica, K. D.; Toussaint, M.; Kelso, J.; Meyer, M.; Pääbo, S.; Prüfer, K.: Nuclear DNA from two early Neandertals reveals 80,000 years of genetic continuity in Europe. Science Advances 5 (6), eaaw5873 (2019)

Green, R. E.; Briggs, A. W.; Krause, J.; Pruefer, K.; Burbano, H. A.; Siebauer, M.; Lachmann, M.; Paeaebo, S.: The Neandertal genome and ancient DNA authenticity. EMBO Journal 28 (17), pp. 2494 - 2502 (2009)

Green, R. E.; Malaspinas, A.-S.; Krause, J.; Briggs, A. W.; Johnson, P. L. F.; Uhler, C.; Meyer, M.; Good, J. M.; Maricic, T.; Stenzel, U. et al.; Pruefer, K.; Siebauer, M.; Burbano, H. A.; Ronan, M.; Rothberg, J. M.; Egholm, M.; Rudan, P.; Brajkovic, D.; Kucan, Z.; Gusic, I.; Wikstrom, M.; Laakkonen, L.; Kelso, J.; Slatkin, M.; Paeaebo, S.: A complete Neandertal mitochondrial genome sequence determined by high-throughput sequencing. Cell 134 (3), pp. 416 - 426 (2008)

Krause, J.; Orlando, L.; Serre, D.; Viola, B.; Pruefer, K.; Richards, M. P.; Hublin, J.-J.; Haenni, C.; Derevianko, A. P.; Paeaebo, S.: Neanderthals in central Asia and Siberia. Nature 449 (7164), pp. 902 - 904 (2007)

Briggs, A. W.; Stenzel, U.; Johnson, P. L. F.; Green, R. E.; Kelso, J.; Pruefer, K.; Meyer, M.; Krause, J.; Ronan, M. T.; Lachmann, M. et al.; Paeaebo, S.: Patterns of damage in genomic DNA sequences from a Neandertal. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 104 (37), pp. 14616 - 14621 (2007)

Loosdrecht, M. S. v. d.; Mannino, M. A.; Talamo, S.; Villalba-Mouco, V.; Posth, C.; Aron, F.; Brandt, G.; Burri, M.; Freund, C.; Radzeviciute, R. et al.; Stahl, R.; Wissgott, A.; Klausnitzer, L.; Nagel, S.; Meyer, M.; Tagliacozzo, A.; Piperno, M.; Tusa, S.; Collina, C.; Schimmenti, V.; Salvo, R. D.; Prüfer, K.; Hublin, J.-J.; Schiffels, S.; Jeong, C.; Haak, W.; Krause, J.: Genomic and dietary transitions during the Mesolithic and Early Neolithic in Sicily, bioRxiv, (2020)

Childebayeva, A.; Rohrlach, A. B.; Barquera Lozano, R. J.; Rivollat, M.; Aron, F.; Szolek, A.; Kohlbacher, O.; Nicklisch, N.; Alt, K. W.; Gronenborn, D. et al.; Meller, H.; Friederich, S.; Prüfer, K.; Deguilloux, M.-F.; Krause, J.; Haak, W.: Population genetics and signatures of selection in Early Neolithic european farmers. (2022)