Publications of Johannes Krause

Mittnik, A.; Wang, C.-C.; Pfrengle, S.; Daubaras, M.; Zariņa, G.; Hallgren, F.; Allmäe, R.; Khartanovich, V.; Moiseyev, V.; Tõrv, M. et al.; Furtwängler, A.; Andrades Valtueña, A.; Feldman, M.; Economou, C.; Oinonen, M.; Vasks, A.; Balanovska, E.; Reich, D.; Jankauskas, R.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.: The genetic prehistory of the Baltic Sea region. Nature Communications 9, 442 (2018)

Gaunitz, C.; Fages, A.; Hanghøj, K.; Albrechtsen, A.; Khan, N.; Schubert, M.; Seguin-Orlando, A.; Owens, I. J.; Felkel, S.; Bignon-Lau, O. et al.; Barros Damgaard de, P.; Mittnik, A.; Mohaseb, A. F.; Davoudi, H.; Alquraishi, S.; Alfarhan, A. H.; Al-Rasheid, K. A. S.; Crubézy, E.; Benecke, N.; Olsen, S.; Brown, D.; Anthony, D.; Massy, K.; Pitulko, V.; Kasparov, A.; Brem, G.; Hofreiter, M.; Mukhtarova, G.; Baimukhanov, N.; Lõugas, L.; Onar, V.; Stockhammer, P. W.; Krause, J.; Boldgiv, B.; Undrakhbold, S.; Erdenebaatar, D.; Lepetz, S.; Mashkour, M.; Ludwig, A.; Wallner, B.; Merz, V.; Merz, I.; Zaibert, V.; Willerslev, E.; Librado, P.; Outram, A. K.; Orlando, L.: Ancient genomes revisit the ancestry of domestic and Przewalski’s horses. Science 360 (6384), pp. 111 - 114 (2018)

Schuenemann, V. J.; Avanzi, C.; Krause-Kyora, B.; Seitz, A.; Herbig, A.; Inskip, S.; Bonazzi, M.; Reiter, E.; Urban, C.; Dangvard Pedersen, D. et al.; Taylor, G. M.; Singh, P.; Stewart, G. R.; Velemínský, P.; Likovsky, J.; Marcsik, A.; Molnár, E.; Pálfi, G.; Mariotti, V.; Riga, A.; Belcastro, M. G.; Boldsen, J. L.; Nebel, A.; Mays, S.; Donoghue, H. D.; Zakrzewski, S.; Benjak, A.; Nieselt, K.; Cole, S. T.; Krause, J.: Ancient genomes reveal a high diversity of Mycobacterium leprae in medieval Europe. PLoS Pathogens 14 (5), e1006997 (2018)

Fellows Yates, J. A.; Drucker, D. G.; Reiter, E.; Heumos, S.; Welker, F.; Münzel, S. C.; Wojtal, P.; Lázničková-Galetová, M.; Conard, N. J.; Herbig, A. et al.; Bocherens, H.; Krause, J.: Central European Woolly Mammoth population dynamics: Insights from Late Pleistocene Mitochondrial Genomes. Scientific Reports 7, 17714 (2017)

Szécsényi-Nagy, .; Roth, C.; Brandt, G.; Rihuete-Herrada, C.; Tejedor-Rodríguez, C.; Held, P.; García-Martínez-de-Lagrán, Í.; Magallón, H. A.; Zesch, S.; Knipper, C. et al.; Bánffy, E.; Friederich, S.; Meller, H.; Ramírez, P. B.; Bermejo, R. B.; de Behrmann, R. B.; Herrero-Corral, A. M.; Fernández, R. F.; Fernández, C. A.; Echevarria, J. J.; Rindlisbacher, L.; Oliart, C.; Fregeiro, M.-I.; Soriano, I.; Vicente, O.; Micó, R.; Lull, V.; Díaz, J. S.; Padilla, J. A. L.; de Muñoz, C. R. T.; Pérez, M. S. H.; Maestre, F. J. J.; Maurandi, J. L.; Fernández, A. A.; Lillios, K. T.; Silva, A. M.; Ramalho, M. M.; Oosterbeek, L. M.; Cunha, C.; Waterman, A. J.; Buxó, J. R.; Martínez, A.; Martínez, J. P.; Ortiz, M. H.; Mejías-García, J. C.; Espín, J. C. P.; Briones, R. C.-A.; Tomé, T.; Ballestero, E. C.; Cardoso, J. L.; Araújo, A. C.; von Lettow-Vorbeck, C. L.; Bosqued, C. B.; Mendoza, P. R.; Pujante, A.; Royo-Guillén, J. I.; Beviá, M. A. E.; Goncalves, . M. D. S.; Parreira, R.; Hernández, E. M.; Izquierdo, E. M.; Miguel, J. V. y.; García, R. M.; Calvo, V. M.; Jiménez, O. L.; Krause, J.; Pichler, S. L.; Garrido-Pena, R.; Kunst, M.; Risch, R.; Rojo-Guerra, M. A.; Haak, W.; Alt, K. W.: The maternal genetic make-up of the Iberian Peninsula between the Neolithic and the Early Bronze Age. Scientific Reports 7, 15644 (2017)

Knipper, C.; Mittnik, A.; Massy, K.; Kociumaka, C.; Kucukkalipci, I.; Maus, M.; Wittenborn, F.; Metz, S. E.; Staskiewicz, A.; Krause, J. et al.; Stockhammer, P. W.: Female exogamy and gene pool diversification at the transition from the final neolithic to the early Bronze Age in central Europe. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 114 (38), pp. 10083 - 10088 (2017)

Skoglund, P.; Thompson, J. C.; Prendergast, M. E.; Mittnik, A.; Sirak, K.; Hajdinjak, M.; Salie, T.; Rohland, N.; Mallick, S.; Peltzer, A. et al.; Heinze, A.; Olalde, I.; Ferry, M.; Harney, E.; Michel, M.; Stewardson, K.; Cerezo-Román, J. I.; Chiumia, C.; Crowther, A.; Gomani-Chindebvu, E.; Gidna, A. O.; M.Grillo, K.; TaneliHelenius, I.; Hellenthal, G.; Helm, R.; Horton, M.; López, S.; Mabulla, A. Z. P.; Parkington, J.; Thomas, C. S. M. G.; Tibesasa, R.; Welling, M.; Hayes, V. M.; Kennett, D. J.; Ramesar, R.; Meyer, M.; Pääbo, S.; Patterson, N.; Morris, A. G.; Boivin, N. L.; Pinhasi, R.; Krause, J.; Reich, D.: Reconstructing prehistoric African population structure. Cell 171 (1), e21, pp. 59 - 71 (2017)

Prendergast, M. E.; Buckley, M.; Crowther, A.; Frantz, L.; Eager, H.; Lebrasseur, O.; Hutterer, R.; Hulme-Beaman, A.; Neer, W. v.; Douka, K. et al.; Veall, M.-A.; Morales, E. M. Q.; Schuenemann, V. J.; Reiter, E.; Allen, R.; Dimopoulos, E. A.; Helm, R. M.; Shipton, C.; Mwebi, O.; Denys, C.; Horton, M.; Wynne-Jones, S.; Fleisher, J.; Radimilahy, C.; Wright, H.; Searle, J. B.; Krause, J.; Larson, G.; Boivin, N. L.: Reconstructing Asian faunal introductions to eastern Africa from multi-proxy biomolecular and archaeological datasets. PLoS One 12 (8), e0182565 (2017)

Swarts, K.; Gutaker, R. M.; Benz, B.; Blake, M.; Bukowski, R.; Holland, J.; Kruse-Peeples, M.; Lepak, N.; Prim, L.; Romay, M. C. et al.; Ross-Ibarra, J.; Sanchez-Gonzalez, J. J. d.; Schmidt, C.; Schuenemann, V. J.; Krause, J.; Matson, R. G.; Weigel, D.; Buckler, E. S.; Burbano, H. A.: Genomic estimation of complex traits reveals ancient maize adaptation to temperate North America. Science 357 (6350), pp. 512 - 515 (2017)

Key, F. M.; Posth, C.; Krause, J.; Herbig, A.; Bos, K. I.: Mining metagenomic data sets for ancient DNA: Recommended protocols for authentication. Trends in Genetics 33 (8), pp. 508 - 520 (2017)

Warinner, C. G.; Herbig, A.; Mann, A.; Fellows Yates, J. A.; Weiß, C. L.; Burbano, H. A.; Orlando, L.; Krause, J.: A robust framework for microbial archaeology. Annual Review of Genomics and Human Genetics 18, pp. 321 - 356 (2017)

Posth, C.; Wißing, C.; Kitagawa, K.; Pagani, L.; Holstein, L. v.; Racimo, F.; Wehrberger, K.; Conard, N. J.; Kind, C. J.; Bocherens, H. et al.; Krause, J.: Deeply divergent archaic mitochondrial genome provides lower time boundary for African gene flow into Neanderthals. Nature Communications 8, 16046 (2017)

Schuenemann, V. J.; Peltzer, A.; Welte, B.; Pelt, W. P. v.; Molak, M.; Wang, C.-C.; Furtwängler, A.; Urban, C.; Reiter, E.; Nieselt, K. et al.; Teßmann, B.; Francken, M.; Harvati, K.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.: Ancient Egyptian mummy genomes suggest an increase of Sub-Saharan African ancestry in post-Roman periods. Nature Communications 8, 15694 (2017)

Yao, H.-B.; Wang, C.-C.; Wang, J.; Tao, X.; Shang, L.; Wen, S.-Q.; Du, Q.; Deng, Q.; Xu, B.; Huang, Y. et al.; Wang, H.-D.; Li, S.; Cong, B.; Ma, L.; Jin, L.; Krause, J.; Li, H.: Genetic structure of Tibetan populations in Gansu revealed by forensic STR loci. Scientific Reports 7, 41195 (2017)

Andrades Valtueña, A.; Mittnik, A.; Key, F. M.; Haak, W.; Allmäe, R.; Belinskij, A.; Daubaras, M.; Feldman, M.; Jankauskas, R.; Janković, I. et al.; Massy, K.; Novak, M.; Pfrengle, S.; Reinhold, S.; Šlaus, M.; Spyrou, M. A.; Szécsényi-Nagy, A.; Tõrv, M.; Hansen, S.; Bos, K. I.; Stockhammer, P. W.; Herbig, A.; Krause, J.: The Stone Age plague and its persistence in Eurasia. Current Biology 27 (23), pp. 3683 - 3691 (2017)

Lazaridis, I.; Mittnik, A.; Patterson, N.; Mallick, S.; Rohland, N.; Pfrengle, S.; Furtwängler, A.; Peltzer, A.; Posth, C.; Vasilakis, A. et al.; McGeorge, P. J. P.; Konsolaki-Yannopoulou, E.; Korres, G.; Martlew, H.; Michalodimitrakis, M.; Özsait, M.; Özsait, N.; Papathanasiou, A.; Richards, M.; Roodenberg, S. A.; Tzedakis, Y.; Arnott, R.; Fernandes, D. M.; Hughey, J. R.; Lotakis, D. M.; Navas, P. A.; Maniatis, Y.; Stamatoyannopoulos, J. A.; Stewardson, K.; Stockhammer, P. W.; Pinhasi, R.; Reich, D.; Krause, J.; Stamatoyannopoulos, G.: Genetic origins of the Minoans and Mycenaeans. Nature 548, 23310, pp. 212 - 218 (2017)

Arora, N.; Schuenemann, V. J.; Jäger, G.; Peltzer, A.; Seitz, A.; Herbig, A.; Strouhal, M.; Grillová, L.; Sánchez-Busó, L.; Kühnert, D. et al.; Bos, K. I.; Davis, L. R.; Mikalová, L.; Bruisten, S.; Komericki, P.; French, P.; Grant, P. R.; Pando, M. A.; Vaulet, L. G.; Fermepin, M. R.; Martinez, A.; Centurion Lara, A.; Giacani, L.; Norris, S. J.; Šmajs, D.; Bosshard, P. P.; González-Candelas, F.; Nieselt, K.; Krause, J.; Bagheri, H. C.: Origin of modern syphilis and emergence of a pandemic Treponema pallidum cluster. Nature Microbiology 2, 16245 (2016)

Feldman, M.; Harbeck, M.; Keller, M.; Spyrou, M. A.; Rott, A.; Trautmann, B.; Scholz, H. C.; Päffgen, B.; Peters, J.; McCormick, M. et al.; Bos, K. I.; Herbig, A.; Krause, J.: A high-coverage Yersinia pestis genome from a 6th-century Justinianic plague victim. Molecular Biology and Evolution 33 (11), pp. 2911 - 2923 (2016)

Gogarten , J. F.; Düx, A.; Schuenemann, V. J.; Nowak, K.; Boesch, C.; Wittig, R. M.; Krause, J.; Calvignac-Spencer, S.; Leendertz, F. H.: Tools for opening new chapters in the book of Treponema pallidum evolutionary history. Clinical Microbiology and Infection 22 (11), pp. 916 - 921 (2016)

Skoglund, P.; Posth, C.; Sirak, K.; Spriggs, M.; Valentin, F.; Bedford, S.; Clark, G. A.; Reepmeyer, C.; Petchey, F.; Fernandes, D. et al.; Fu, Q.; Harney, E.; Lipson, M.; Mallick, S.; Novak, M.; Rohland, N.; Stewardson, K.; Abdullah, S.; Cox, M. P.; Friedlaender, F. R.; Friedlaender, J. S.; Kivisild, T.; Koki, G.; Kusuma, P.; Merriwether, D. A.; Ricaut, F.-X.; Wee, J. T. S.; Patterson, N.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Reich, D.: Genomic insights into the peopling of the Southwest Pacific. Nature 538 (7626), 19844, pp. 510 - 518 (2016)