Publications of Stephan Schiffels

Journal Article (28)

1.
Journal Article
Alpaslan-Roodenberg, S.; Anthony, D.; Babiker, H.; Bánffy, E.; Booth, T.; Capone, P.; Deshpande-Mukherjee, A.; Eisenmann, S.; Fehren-Schmitz, L.; Frachetti, M. et al.; Fujita, R.; Frieman, C. J.; Fu, Q.; Gibbon, V.; Haak, W.; Hajdinjak, M.; Hofmann, K. P.; Holguin, B.; Inomata, T.; Kanzawa-Kiriyama, H.; Keegan, W.; Kelso, J.; Krause, J.; Kumaresan, G.; Kusimba, C.; Kusimba, S.; Lalueza-Fox, C.; Llamas, B.; MacEachern, S.; Mallick, S.; Matsumura, H.; Morales-Arce, A. Y.; Matuzeviciute, G. M.; Mushrif-Tripathy, V.; Nakatsuka, N.; Nores, R.; Ogola, C.; Okumura, M.; Patterson, N.; Pinhasi, R.; Prasad, S. P. R.; Prendergast, M. E.; Punzo, J. L.; Reich, D.; Sawafuji, R.; Sawchuk, E.; Schiffels, S.; Sedig, J.; Shnaider, S.; Sirak, K.; Skoglund, P.; Slon, V.; Snow, M.; Soressi, M.; Spriggs, M.; Stockhammer, P. W.; Szécsényi-Nagy, A.; Thangaraj, K.; Tiesler, V.; Tobler, R.; Wang, C.-C.; Warinner, C.; Yasawardene, S.; Zahir, M.: Ethics of DNA research on human remains: five globally applicable guidelines. Nature 599, s41586-021-04008-x, pp. 41 - 46 (2021)
2.
Journal Article
Kocher, A.; Papac, L.; Barquera Lozano, R. J.; Key, F. M.; Spyrou, M. A.; Hübler, R.; Rohrlach, A. B.; Aron, F.; Stahl, R.; Wissgott, A. et al.; van Bömmel, F.; Pfefferkorn, M.; Mittnik, A.; Villalba-Mouco, V.; Neumann, G.; Rivollat, M.; Loosdrecht, M. S. v. d.; Majander, K.; Tukhbatova, R. I.; Musralina, L.; Ghalichi, A.; Penske, S. E.; Sabin, S.; Michel, M.; Gretzinger, J.; Nelson, E. A.; Ferraz da Silva, T.; Nägele, K.; Parker, C. E.; Keller, M.; Guevara, E.; Feldman, M.; Eisenmann, S.; Skourtanioti, E.; Giffin, K.; Gnecchi Ruscone, G. A.; Friederich, S.; Schimmenti, V.; Khartanovich, V.; Karapetian, M. K.; Chaplygin, M. S.; Kufterin, V. V.; Khokhlov, A. A.; Chizhevsky, A. A.; Stashenkov, D. A.; Kochkina, A. F.; Tejedor-Rodríguez, C.; de Lagrán, Í. G.-M.; Arcusa-Magallón, H.; Garrido-Pena, R.; Royo-Guillén, J. I.; Novácek, J.; Rottier, S.; Kacki, S.; Saintot, S.; Kaverzneva, E.; Belinskiy, A. B.; Velemínský, P.; Limburský, P.; Kostka, M.; Loe, L.; Popescu, E.; Clarke, R.; Lyons, A.; Mortimer, R.; Sajantila, A.; de Armas, Y. C.; Godoy, S. T. H.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Pearson, J.; Binder, D.; Lefranc, P.; Kantorovich, A. R.; Maslov, V. E.; Lai, L.; Zoledziewska, M.; Beckett, J. F.; Langová, M.; Danielisová, A.; Ingman, T.; Atiénzar, G. G.; de Ibáñez, M. P. M.; Romero, A.; Sperduti, A.; Beckett, S.; Salter, S. J.; Zilivinskaya, E. D.; Vasilev, D. V.; von Heyking, K.; Burger, R. L.; Salazar, L. C.; Amkreutz, L.; Navruzbekov, M.; Rosenstock, E.; Alonso-Fernández, C.; Slavchev, V.; Kalmykov, A. A.; Atabiev, B. C.; Batieva, E.; Calmet, M. A.; Llamas, B.; Schultz, M.; Krauß, R.; Jiménez-Echevarría, J.; Francken, M.; Shnaider, S.; de Knijff, P.; Altena, E.; de Vijver, K. V.; Fehren-Schmitz, L.; Tung, T. A.; Lösch, S.; Dobrovolskaya, M.; Makarov, N.; Read, C.; Twest, M. V.; Sagona, C.; Ramsl, P. C.; Akar, M.; Yener, K. A.; Ballestero, E. C.; Cucca, F.; Mazzarello, V.; Utrilla, P.; Rademaker, K.; Fernández-Domínguez, E.; Baird, D.; Semal, P.; Márquez-Morfín, L.; Roksandic, M.; Steiner, H.; Salazar-García, D. C.; Shishlina, N.; Erdal, Y. S.; Hallgren, F.; Boyadzhiev, Y.; Boyadzhiev, K.; Küßner, M.; Sayer, D.; Onkamo, P.; Skeates, R.; Rojo-Guerra, M.; Buzhilova, A.; Khussainova, E.; Djansugurova, L. B.; Beisenov, A. Z.; Samashev, Z.; Massy, K.; Mannino, M.; Moiseyev, V.; Mannermaa, K.; Balanovsky, O.; Deguilloux, M.-F.; Reinhold, S.; Hansen, S.; Kitov, E. P.; Dobeš, M.; Ernée, M.; Meller, H.; Alt, K. W.; Prüfer, K.; Warinner, C. G.; Schiffels, S.; Stockhammer, P. W.; Bos, K. I.; Posth, C.; Herbig, A.; Haak, W.; Krause, J.; Kühnert, D.: Ten millennia of hepatitis B virus evolution. Science 374 (6564), abi5658, pp. 182 - 188 (2021)
3.
Journal Article
Papac, L.; Ernée, M.; Dobeš, M.; Langová, M.; Rohrlach, A. B.; Aron, F.; Neumann, G.; Spyrou, M. A.; Rohland, N.; Velemínský, P. et al.; Kuna, M.; Brzobohatá, H.; Culleton, B.; Daněček, D.; Danielisová, A.; Dobisíková, M.; Hložek, J.; Kennett, D. J.; Klementová, J.; Kostka, M.; Krištuf, P.; Kuchařík, M.; Hlavová, J. K.; Limburský, P.; Malyková, D.; Mattiello, L.; Petriščáková, M. P.; Průchová, E.; Stránská, P.; Smejtek, L.; Šumberová, J. Š.; Švejcar, O.; Trefný, M.; Vávra, M.; Kolář, J.; Volker , H.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Reich, D.; Schiffels, S.; Haak, W.: Dynamic changes in genomic and social structures in third millennium BCE central Europe. Science Advances 7 (35), 6941 (2021)
4.
Journal Article
Freilich, S.; Ringbauer, H.; Los, D.; Novak, M.; Pavičić, D. T.; Schiffels, S.; Pinhasi, R.: Reconstructing genetic histories and social organisation in Neolithic and Bronze Age Croatia. Scientific Reports, 16729 (2021)
5.
Journal Article
Schmid, C.; Schiffels, S.: bleiglas: An R package for interpolation and visualisation of spatiotemporal data with 3D tessellation. The Journal of Open Source Software 6 (60), 3092 (2021)
6.
Journal Article
Wang, C.-C.; Yeh, H.-Y.; Popov, A. N.; Zhang, H.-Q.; Matsumura, H.; Sirak, K.; Cheronet, O.; Kovalev, A.; Rohland, N.; Kim, A. M. et al.; Mallick, S.; Bernardos, R.; Tumen, D.; Zhao, J.; Liu, Y.-C.; Liu, J.-Y.; Mah, M.; Wang, K.; Zhang, Z.; Adamski, N.; Broomandkhoshbacht, N.; Callan, K.; Candilio, F.; Carlson, K. S. D.; Culleton, B. J.; Eccles, L.; Freilich, S.; Keating, D.; Lawson, A. M.; Mandl, K.; Michel, M.; Oppenheimer, J.; Özdoğan, K. T.; Stewardson, K.; Wen, S.; Yan, S.; Zalzala, F.; Chuang, R.; Huang, C.-J.; Looh, H.; Shiung, C.-C.; Nikitin, Y. G.; Tabarev, A. V.; Tishkin, A. A.; Lin, S.; Sun, Z.-Y.; Wu, X.-M.; Yang, T.-L.; Hu, X.; Chen, L.; Du, H.; Bayarsaikhan, J.; Mijiddorj, E.; Erdenebaatar, D.; Iderkhangai, T.-O.; Myagmar, E.; Kanzawa-Kiriyama, H.; Nishino, M.; Shinoda, K.-i.; Shubina, O. A.; Guo, J.; Cai, W.; Deng, Q.; Kang, L.; Li, D.; Li, D.; Lin, R.; Nini; Shrestha, R.; Wang, L.-X.; Wei, L.; Xie, G.; Yao, H.; Zhang, M.; He, G.; Yang, X.; Hu, R.; Robbeets, M.; Schiffels, S.; Kennett, D. J.; Jin, L.; Li, H.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Reich, D.: Genomic Insights into the Formation of Human Populations in East Asia. Nature, s41586-021-03336-2 (2021)
7.
Journal Article
Bleasdale, M.; Richter, K. K.; Janzen, A.; Brown, S.; Scott, A.; Zech, J.; Wilkin, S.; Wang, K.; Schiffels, S.; Desideri, J. et al.; Besse, M.; Reinold, J.; Saad, M.; Babiker, H.; Power, R. C.; Ndiema, E.; Ogola, C.; Manthi, F. K.; Zahir, M.; Petraglia, M. D.; Trachsel, C.; Nanni, P.; Grossmann, J.; Hendy, J.; Crowther, A.; Roberts, P.; Goldstein, S. T.; Boivin, N. L.: Ancient proteins provide evidence of dairy consumption in eastern Africa. Nature Communications 12, 632 (2021)
8.
Journal Article
Jeong, C.; Wang, K.; Wilkin, S.; Taylor, W. T. T.; Miller, B. K.; Bemmann, J. H.; Stahl, R.; Chiovelli, C.; Knolle, F.; Ulziibayar, S. et al.; Khatanbaatar, D.; Erdenebaatar, D.; Erdenebat, U.; Ochir, A.; Ankhsanaa, G.; Vanchigdash, C.; Ochir, B.; Munkhbayar, C.; Tumen, D.; Kovalev, A.; Kradin, N.; Bazarov, B. A.; Miyagashev, D. A.; Konovalov, P. B.; Zhambaltarova, E.; Ventresca Miller, A. R.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.; Boivin, N. L.; Erdene, M.; Hendy, J.; Warinner, C. G.: A dynamic 6,000-year genetic history of Eurasia’s eastern steppe. Cell 183 (4), pp. 890 - 904.e29 (2020)
9.
Journal Article
Wang, K.; Goldstein, S. T.; Bleasdale, M.; Clist, B.; Bostoen, K.; Bakwa-Lufu, P.; Buck, L. T.; Crowther, A.; Dème, A.; McIntosh, R. J. et al.; Mercader, J.; Ogola, C.; Power, R. C.; Sawchuk, E. A.; Robertshaw, P.; Wilmsen, E. N.; Petraglia, M. D.; Ndiema, E.; Manthi, F. K.; Krause, J.; Roberts, P.; Boivin, N. L.; Schiffels, S.: Ancient genomes reveal complex patterns of population movement, interaction, and replacement in sub-Saharan Africa. Science Advances 6 (24), eaaz0183 (2020)
10.
Journal Article
Rivollat, M.; Jeong, C.; Schiffels, S.; Kücükkalıpcı, İ.; Pemonge, M.-H.; Rohrlach, A. B.; Alt, K. W.; Binder, D.; Friederich, S.; Ghesquière, E. et al.; Gronenborn, D.; Laporte, L.; Lefranc, P.; Meller, H.; Réveillas, H.; Rosenstock, E.; Rottier, S.; Scarre, C.; Soler, L.; Wahl, J.; Krause, J.; Deguilloux, M.-F.; Haak, W.: Ancient genome-wide DNA from France highlights the complexity of interactions between Mesolithic hunter-gatherers and Neolithic farmers. Science Advances 6 (22), eaaz5344 , pp. 1 - 16 (2020)
11.
Journal Article
Furtwängler, A.; Rohrlach, A. B.; Lamnidis, T. C.; Papac, L.; Neumann, G.; Siebke, I.; Reiter, E.; Steuri, N.; Hald, J.; Denaire, A. et al.; Schnitzler, B.; Wahl, J.; Ramstein, M.; Schuenemann, V. J.; Stockhammer, P. W.; Hafner, A.; Lösch, S.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.: Ancient genomes reveal social and genetic structure of Late Neolithic Switzerland. Nature Communications 11, 1915 (2020)
12.
Journal Article
Wang, K.; Mathieson, I.; O'Connell, J.; Schiffels, S.: Tracking human population structure through time from whole genome sequences. PLoS Genetics 16 (3), e1008552, pp. 1 - 24 (2020)
13.
Journal Article
Mittnik, A.; Massy, K.; Knipper, C.; Wittenborn, F.; Pfrengle, S.; Carlichi-Witjes, N.; Deeg, H.; Furtwängler, A.; Harbeck, M.; von Heyking, K. et al.; Kociumaka, C.; Kucukkalipci, I.; Lindauer, S.; Metz, S.; Staskiewicz, A.; Thiel, A.; Wahl, J.; Haak, W.; Pernicka, E.; Schiffels, S.; Stockhammer, P. W.; Krause, J.: Kinship-based social inequality in Bronze Age Europe. Science 366 (6466), aax6219 , pp. 731 - 734 (2019)
14.
Journal Article
Flegontov, P.; Altınışık, N. E.; Changmai, P.; Rohland, N.; Mallick, S.; Adamski, N.; Bolnick, D. A.; Broomandkhoshbacht, N.; Candilio, F.; Culleton, B. J. et al.; Flegontova, O.; Friesen, T. M.; Jeong, C.; Harper, T. K.; Keating, D.; Kennett, D. J.; Kim, A. M.; Lamnidis, T. C.; Lawson, A. M.; Olalde, I.; Oppenheimer, J.; Potter, B. A.; Raff, J.; Sattler, R. A.; Skoglund, P.; Stewardson, K.; Vajda, E. J.; Vasilyev, S.; Veselovskaya, E.; O’Rourke, M. G. H. D. H.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Schiffels, S.: Palaeo-Eskimo genetic ancestry and the peopling of Chukotka and North America. Nature 570, pp. 236 - 240 (2019)
15.
Journal Article
Jeong, C.; Balanovsky, O.; Lukianova, E.; Kahbatkyzy, N.; Flegontov, P.; Zaporozhchenko, V.; Immel, A.; Wang, C.-C.; Ixan, O.; Khussainova, E. et al.; Bekmanov, B.; Zaibert, V.; Lavryashina, M.; Pocheshkhova, E.; Yusupov, Y.; Agdzhoyan, A.; Koshel, S.; Bukin, A.; Nymadawa, P.; Turdikulova, S.; Dalimova, D.; Churnosov, M.; Skhalyakho, R.; Daragan, D.; Bogunov, Y.; Bogunova, A.; Shtrunov, A.; Dubova, N.; Zhabagin, M.; Yepiskoposyan, L.; Churakov, V.; Pislegin, N.; Damba, L.; Saroyants, L.; Dibirova, K.; Atramentova, L.; Utevska, O.; Idrisov, E.; Kamenshchikova, E.; Evseeva, I.; Metspalu, M.; Outram, A. K.; Robbeets, M.; Djansugurova, L.; Balanovska, E.; Schiffels, S.; Haak, W.; Reich, D.; Krause, J.: The genetic history of admixture across inner Eurasia. Nature Ecology & Evolution 3, pp. 966 - 976 (2019)
16.
Journal Article
Villalba-Mouco, V.; Loosdrecht, M. S. v. d.; Posth, C.; Mora, R.; Martínez-Moreno, J.; Rojo-Guerra, M.; Salazar-García, D. C.; Royo-Guillén, J. I.; Kunst, M.; Rougier, H. et al.; Crevecoeur, I.; Arcusa-Magallón, H.; Tejedor-Rodríguez, C.; de Lagrán, I. G.-M.; Garrido-Pena, R.; Alt, K. W.; Jeong, C.; Schiffels, S.; Utrilla, P.; Krause, J.; Haak, W.: Survival of Late Pleistocene Hunter-Gatherer ancestry in the Iberian Peninsula. Current Biology 29 (7), pp. 1169 - 1177 (2019)
17.
Journal Article
Wang, C.-C.; Reinhold, S.; Kalmykov, A.; Wissgott, A.; Brandt, G.; Jeong, C.; Cheronet, O.; Ferry, M.; Harney, E.; Keating, D. et al.; Mallick, S.; Rohland, N.; Stewardson, K.; Kantorovich, A. R.; Maslov, V. E.; Petrenko, V. G.; Erlikh, V. R.; Atabiev, B. C.; Magomedov, R. G.; Kohl, P. L.; Alt, K. W.; Pichler, S. L.; Gerling, C.; Meller, H.; Vardanyan, B.; Yeganyan, L.; Rezepkin, A. D.; Mariaschk, D.; Berezina, N.; Gresky, J.; Fuchs, K.; Knipper, C.; Schiffels, S.; Balanovska, E.; Balanovsky, O.; Mathieson, I.; Higham, T.; Berezin, Y. B.; Buzhilova, A.; Trifonov, V.; Pinhasi, R.; Belinskij, A. B.; Reich, D.; Hansen, S.; Krause, J.; Haak, W.: Ancient human genome-wide data from a 3000-year interval in the Caucasus corresponds with eco-geographic regions. Nature Communications 10 (1), 590 (2019)
18.
Journal Article
Gurdasani, D.; Carstensen, T.; Fatumo, S.; Chen, G.; Franklin, C. S.; Prado-Martinez, J.; Bouman, H.; Abascal, F.; Haber, M.; Tachmazidou, I. et al.; Mathieson, I.; Ekoru, K.; DeGorter, M. K.; Nsubuga, R. N.; Finan, C.; Wheeler, E.; Chen, L.; Cooper, D. N.; Schiffels, S.; Chen, Y.; Ritchie, G. R.S.; Pollard, M. O.; Fortune, M. D.; Mentzer, A. J.; Garrison, E.; Bergstrom, A.; Hatzikotoulas, K.; Adeyemo, A.; Doumatey, A.; Elding, H.; Wain, L. V.; Ehret, G.; Auer, P. L.; Kooperberg, C. L.; Reiner, A. P.; Franceschini, N.; Maher, D. P.; Montgomery, S. B.; Kadie, C.; Widmer, C.; Xue, Y.; Seeley, J.; Asiki, G.; Kamali, A.; Young, E. H.; Pomilla, C.; Soranzo, N.; Zeggini, E.; Pirie, F.; Morris, A. P.; Heckerman, D.; Tyler-Smith, C.; Motala, A.; Rotimi, C.; Kaleebu, P.; Barroso, I.; Sandhu, M. S.: Uganda genome resource enables insights into population history and genomic discovery in Africa. Cell 179 (4), pp. 984 - 1002.e36 (2019)
19.
Journal Article
Lamnidis, T. C.; Majander, K.; Jeong, C.; Salmela, E.; Wessman, A.; Moiseyev, V.; Khartanovich, V.; Balanovsky, O.; Ongyerth, M.; Weihmann, A. et al.; Sajantila, A.; Kelso, J.; Pääbo, S.; Onkamo, P.; Haak, W.; Krause, J.; Schiffels, S.: Ancient Fennoscandian genomes reveal origin and spread of Siberian ancestry in Europe. Nature Communications 9, 5018 (2018)
20.
Journal Article
Posth, C.; Nakatsuka, N.; Lazaridis, I.; Skoglund, P.; Mallick, S.; Lamnidis, T. C.; Rohland, N.; Nägele, K.; Adamski, N.; Bertolini, E. et al.; Broomandkhoshbacht, N.; Cooper, A.; Culleton, B. J.; Ferraz da Silva, T.; Ferry, M.; Furtwängler, A.; Haak, W.; Harkins, K.; Harper, T. K.; Hünemeier, T.; Lawson, A. M.; Llamas, B.; Michel, M.; Nelson, E. A.; Oppenheimer, J.; Patterson, N.; Schiffels, S.; Sedig, J.; Stewardson, K.; Talamo, S.; Wang, C.-C.; Hublin, J.-J.; Hubbe, M.; Harvati, K.; Delaunay, A. N.; Beier, J.; Francken, M.; Kaulicke, P.; Reyes-Centeno, H.; Rademaker, K.; Trask, W. R.; Robinson, M.; Gutierrez, S. M.; Prufer, K. M.; Salazar-García, D. C.; Chim, E. N.; Gomes, L. M. P.; Alves, M. L.; Liryo, A.; Inglez, M.; Oliveira, R. E.; Bernardo, D. V.; Barioni, A.; Wesolowski, V.; Scheifler, N. A.; Rivera, M. A.; Plens, C. R.; Messineo, P. G.; Figuti, L.; Corach, D.; Scabuzzo, C.; Eggers, S.; DeBlasis, P.; Reindel, M.; Méndez, C.; Politis, G.; Tomasto-Cagigao, E.; Kennett, D. J.; Strauss, A.; Fehren-Schmitz, L.; Krause, J.; Reich, D.: Reconstructing the deep population history of Central and South America. Cell 175 (5), e22, pp. 1185 - 1197 (2018)
Go to Editor View