Publications of Johannes Krause

Journal Article (180)

121.
Journal Article
Bos, K.; Herbig, A.; Sahl, J.; Waglechner, N.; Fourment, M.; Forrest, S. A.; Klunk, J.; Schuenemann, V. J.; Poinar, D.; Kuch, M. et al.; Golding, G. B.; Dutour, O.; Keim, P.; Wagner, D. M.; Holmes, E. C.; Krause, J.; Poinar, H. N.: Eighteenth century Yersinia pestis genomes reveal the long-term persistence of an historical plague focus. eLife 5, e12994 (2016)
122.
Journal Article
Maixner, F.; Krause-Kyora, B.; Turaev, D.; Herbig, A.; Hoopmann, M. R.; Hallows, J. L.; Kusebauch, U.; Vigl, E. E.; Malfertheiner, P.; Megraud, F. et al.; O’Sullivan, N.; Cipollini, G.; Coia, V.; Samadelli, M.; Engstrand, L.; Linz, B.; Moritz, R. L.; Grimm, R.; Krause, J.; Nebel, A.; Moodley, Y.; Rattei, T.; Zink, A.: The 5300-year-old Helicobacter pylori genome of the Iceman. Science 351 (6269), pp. 162 - 165 (2016)
123.
Journal Article
Mascher, M.; Schuenemann, V.J.; Davidovich, U.; Marom, N.; Himmelbach, A.; Hübner, S.; Korol, A.; David, M.; Reiter, E.; Riehl, S. et al.; Schreiber, M.; Vohr, S.H.; Green, R.E.; Dawson, I.K.; Russell, J.; Kilian, B.; Muehlbauer, G.J.; Waugh, R.; Fahima, T.; Krause, J.; Weiss, E.; Stein, N.: Genomic analysis of 6,000-year-old cultivated grain illuminates the domestication history of barley. Nature Genetics 48 (9), pp. 1089 - 1095 (2016)
124.
Journal Article
Peltzer, A.; Jager, G.; Herbig, A.; Seitz, A.; Kniep, C.; Krause, J.; Nieselt, K.: EAGER: efficient ancient genome reconstruction. Genome Biology 17, 60 (2016)
125.
Journal Article
Mathieson, I.; Lazaridis, I.; Rohland, N.; Mallick, S.; Patterson, N.; Roodenberg, S. A.; Harney, E.; Stewardson, K.; Fernandes, D.; Novak, M. et al.; Sirak, K.; Gamba, C.; Jones, E. R.; Llamas, B.; Dryomov, S.; Pickrell, J.; Arsuaga, J. L.; de Castro, J. M. B.; Carbonell, E.; Gerritsen, F.; Khokhlov, A.; Kuznetsov, P.; Lozano, M.; Meller, H.; Mochalov, O.; Moiseyev, V.; Guerra, M. A. R.; Roodenberg, J.; Vergès, J. M.; Krause, J.; Cooper, A.; Alt, K. W.; Brown, D.; Anthony, D.; Lalueza-Fox, C.; Haak, W.; Pinhas, R.; Reich, D.: Genome-wide patterns of selection in 230 ancient Eurasians. Nature 528, pp. 499 - 503 (2015)
126.
Journal Article
Stockhammer, P. W.; Massy, K.; Knipper, C.; Friedrich, R.; Kromer, B.; Lindauer, S.; Radosavljević, J.; Wittenborn, F.; Krause, J.: Rewriting the Central European Early Bronze Age chronology: Evidence from large-scale radiocarbon dating. PLoS One, e0139705 (2015)
127.
Journal Article
Haak, W.; Lazaridis, I.; Patterson, N.; Rohland, N.; Mallick, S.; Llamas, B.; Brandt, G.; Nordenfelt, S.; Harney, E.; Stewardson, K. et al.; Fu, Q.; Mittnik, A.; Bánffy, E.; Economou, C.; Francken, M.; Friederich, S.; Pena, R. G.; Hallgren, F.; Khartanovich, V.; Khokhlov, A.; Kunst, M.; Kuznetsov, P.; Meller, H.; Mochalov, O.; Moiseyev, V.; Nicklisch, N.; Pichler, S. L.; Risch, R.; Guerra, M. A. R.; Roth, C.; Szécsényi-Nagy, A.; Wahl, J.; Meyer, M.; Krause, J.; Brown, D.; Anthony, D.; Cooper, A.; Alt, K. W.; Reich, D.: Massive migration from the steppe was a source for Indo-European languages in Europe. Nature 522 (7555), pp. 207 - 211 (2015)
128.
Journal Article
Immel, A.; Drucker, D. G.; Bonazzi, M.; Jahnke, T. K.; Munzel, S. C.; Schuenemann, V. J.; Herbig, A.; Kind, C.-J.; Krause, J.: Mitochondrial genomes of giant deers suggest their late survival in Central Europe. Scientific Reports 5, 10853 (2015)
129.
Journal Article
Singh, P.; Benjak, A.; Schuenemann, V. J.; Herbig, A.; Avanzi, C.; Busso, P.; Nieselt, K.; Krause, J.; Vera-Cabrera, L.; Cole, S. T.: Insight into the evolution and origin of leprosy bacilli from the genome sequence of Mycobacterium lepromatosis. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA 112 (14), pp. 4459 - 4464 (2015)
130.
Journal Article
Shafer, A. B. A.; Wolf, J. B. W.; Alves, P. C.; Bergstrom, L.; Bruford, M. W.; Brannstrom, I.; Colling, G.; Dalen, L.; De Meester, L.; Ekblom, R. et al.; Fawcett, K. D.; Fior, S.; Hajibabaei, M.; Hill, J. A.; Hoezel, A. R.; Hoglund, J.; Jensen, E. L.; Krause, J.; Kristensen, T. N.; Kruetzen, M.; McKay, J. K.; Norman, A. J.; Ogden, R.; Osterling, E. M.; Ouborg, N. J.; Piccolo, J.; Popovic, D.; Primmer, C. R.; Reed, F. A.; Roumet, M.; Salmona, J.; Schenekar, T.; Schwartz, M. K.; Segelbacher, G.; Senn, H.; Thaulow, J.; Valtonen, M.; Veale, A.; Vergeer, P.; Vijay, N.; Vila, C.; Weissensteiner, M.; Wennerstrom, L.; Wheat, C. W.; Zielinski, P.: Genomics and the challenging translation into conservation practice. Trends in Ecology and Evolution 30 (2), pp. 78 - 87 (2015)
131.
Journal Article
Bos, K. I.; Jaeger, G.; Schuenemann, V. J.; Vågene, Å. J.; Spyrou, M. A.; Herbig, A.; Nieselt, K.; Krause, J.: Parallel detection of ancient pathogens via array-based DNA capture. Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B: Biological Sciences 370 (1660), 20130375 (2015)
132.
Journal Article
Harkins, K. M.; Buikstra, J. E.; Campbell, T.; Bos, K. I.; Johnson, E. D.; Krause, J.; Stone, A. C.: Screening ancient tuberculosis with qPCR: challenges and opportunities. Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B: Biological Sciences 370 (1660), 20130622 (2015)
133.
Journal Article
Krause, J.: Ancient human migrations. Die Kunde 64, pp. 87 - 99 (2015)
134.
Journal Article
Zink, A.; Wann, L. S.; Thompson, R. C.; Keller, A.; Maixner, F.; Allam, A. H.; Finch, C. E.; Frohlich, B.; Kaplan, H.; Lombardi, G. P. et al.; Sutherland, M. L.; Sutherland, J. D.; Watson, L.; Cox, S. L.; Miyamoto, M. I.; Narula, J.; Stewart, A. F.R.; Thomas, G. S.; Krause, J.: Genomic correlates of atherosclerosis in ancient humans. Global Heart 9 (2), pp. 203 - 209 (2014)
135.
Journal Article
Mendum, T. A.; Schuenemann, V. J.; Roffey, S.; Taylor, G. M.; Wu, H.; Singh, P.; Tucker, K.; Hinds, J.; Cole, S. T.; Kierzek, A. M. et al.; Nieselt, K.; Krause, J.; Stewart, G. R.: Mycobacterium leprae genomes from a British medieval leprosy hospital: towards understanding an ancient epidemic. BMC Genomics 15, 270 (2014)
136.
Journal Article
Bos, K. I.; Harkins, K. M.; Herbig, A.; Coscolla, M.; Weber, N.; Comas, I.; Forrest, S. A.; Bryant, J. M.; Harris, S. R.; Schuenemann, V. J. et al.; Campbell, T. J.; Majander, K.; Wilbur, A. K.; Guichon, R. A.; Steadman, D. L. W.; Cook, D. C.; Niemann, S.; Behr, M. A.; Zumarraga, M.; Bastida, R.; Huson, D.; Nieselt, K.; Young, D.; Parkhill, J.; Buikstra, J. E.; Gagneux, S.; Stone, A. C.; Krause, J.: Pre-Columbian mycobacterial genomes reveal seals as a source of New World human tuberculosis. Nature 514 (7523), pp. 494 - 497 (2014)
137.
Journal Article
Krause, J.: Die molekulare Stammesgeschichte des Menschen: Steckt in uns allen ein kleiner Neandertaler? Senckenberg: Natur, Forschung, Museum; das Senckenberg-Wissenschaftsmagazin 144 (7/8), pp. 274 - 277 (2014)
138.
Journal Article
Lazaridis, I.; Patterson, N.; Mittnik, A.; Renaud , G.; Mallick, S.; Kirsanow, K.; Sudmant, P. H.; Schraiber, J. G.; Castellano, S.; Lipson, M. et al.; Berger, B.; Economou, C.; Bollongino, R.; Fu, Q.; Bos, K. I.; Nordenfelt, S.; Li, H.; De Filippo, C.; Pruefer, K.; Sawyer, S.; Posth, C.; Haak, W.; Hallgren, F.; Fornander, E.; Rohland, N.; Delsate, D.; Francken, M.; Guinet, J.-M.; Wahl, J.; Ayodo, G.; Babiker, H. A.; Bailliet, G.; Balanovska, E.; Balanovsky, O.; Barrantes, R.; Bedoya, G.; Ben-Ami, H.; Bene, J.; Berrada, F.; Bravi, C. M.; Brisighelli, F.; Busby, G. B. J.; Cali, F.; Churnosov, M.; Cole, D. E. C.; Corach, D.; Damba, L.; van Driem, G.; Dryomov, S.; Dugoujon, J.-M.; Fedorova, S. A.; Romero, I. G.; Gubina, M.; Hammer, M.; Henn, B. M.; Hervig, T.; Hodoglugil, U.; Jha, A. R.; Karachanak-Yankova, S.; Khusainova, R.; Khusnutdinova, E.; Kittles, R.; Kivisild, T.; Klitz, W.; Kucinskas, V.; Kushniarevich, A.; Laredj, L.; Litvinov, S.; Loukidis, T.; Mahley, R. W.; Melegh, B.; Metspalu, E.; Molina, J.; Mountain, J.; Nakkalajarvi, K.; Nesheva, D.; Nyambo, T.; Osipova, L.; Parik, J.; Platonov, F.; Posukh, O.; Romano, V.; Rothhammer, F.; Rudan, I.; Ruizbakiev, R.; Sahakyan, H.; Sajantila, A.; Salas, A.; Starikovskaya, E. B.; Tarekegn, A.; Toncheva, D.; Turdikulova, S.; Uktveryte, I.; Utevska, O.; Vasquez, R.; Villena, M.; Voevoda, M.; Winkler, C. A.; Yepiskoposyan, L.; Zalloua, P.; Zemunik, T.; Cooper, A.; Capelli, C.; Thomas, M. G.; Ruiz-Linares, A.; Tishkoff, S. A.; Singh, L.; Thangaraj, K.; Villems, R.; Comas, D.; Sukernik, R.; Metspalu, M.; Meyer, M.; Eichler, E. E.; Burger, J.; Slatkin, M.; Paeaebo, S.; Kelso, J.; Reich, D.; Krause, J.: Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Nature 513 (7518), pp. 409 - 413 (2014)
139.
Journal Article
Schünemann, V. J.; Krause, J.: Wo der Mensch auf den Hund kam: Genetische Untersuchungen deuten darauf hin, dass der Ursprung der Domestikation in Europa liegt. Senckenberg: Natur, Forschung, Museum; das Senckenberg-Wissenschaftsmagazin 144 (7/8), pp. 278 - 281 (2014)
140.
Journal Article
Skoglund, P.; Northoff, B. H.; Shunkov, M. V.; Derevianko, A. P.; Paabo, S.; Krause, J.; Jakobsson, M.: Separating endogenous ancient DNA from modern day contamination in a Siberian Neandertal. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 111 (6), pp. 2229 - 2234 (2014)
Go to Editor View