Publications of Johannes Krause

Journal Article (183)

101.
Journal Article
Prendergast, M. E.; Buckley, M.; Crowther, A.; Frantz, L.; Eager, H.; Lebrasseur, O.; Hutterer, R.; Hulme-Beaman, A.; Neer, W. v.; Douka, K. et al.; Veall, M.-A.; Morales, E. M. Q.; Schuenemann, V. J.; Reiter, E.; Allen, R.; Dimopoulos, E. A.; Helm, R. M.; Shipton, C.; Mwebi, O.; Denys, C.; Horton, M.; Wynne-Jones, S.; Fleisher, J.; Radimilahy, C.; Wright, H.; Searle, J. B.; Krause, J.; Larson, G.; Boivin, N. L.: Reconstructing Asian faunal introductions to eastern Africa from multi-proxy biomolecular and archaeological datasets. PLoS One 12 (8), e0182565 (2017)
102.
Journal Article
Swarts, K.; Gutaker, R. M.; Benz, B.; Blake, M.; Bukowski, R.; Holland, J.; Kruse-Peeples, M.; Lepak, N.; Prim, L.; Romay, M. C. et al.; Ross-Ibarra, J.; Sanchez-Gonzalez, J. J. d.; Schmidt, C.; Schuenemann, V. J.; Krause, J.; Matson, R. G.; Weigel, D.; Buckler, E. S.; Burbano, H. A.: Genomic estimation of complex traits reveals ancient maize adaptation to temperate North America. Science 357 (6350), pp. 512 - 515 (2017)
103.
Journal Article
Key, F. M.; Posth, C.; Krause, J.; Herbig, A.; Bos, K. I.: Mining metagenomic data sets for ancient DNA: Recommended protocols for authentication. Trends in Genetics 33 (8), pp. 508 - 520 (2017)
104.
Journal Article
Warinner, C. G.; Herbig, A.; Mann, A.; Fellows Yates, J. A.; Weiß, C. L.; Burbano, H. A.; Orlando, L.; Krause, J.: A robust framework for microbial archaeology. Annual Review of Genomics and Human Genetics 18, pp. 321 - 356 (2017)
105.
Journal Article
Posth, C.; Wißing, C.; Kitagawa, K.; Pagani, L.; Holstein, L. v.; Racimo, F.; Wehrberger, K.; Conard, N. J.; Kind, C. J.; Bocherens, H. et al.; Krause, J.: Deeply divergent archaic mitochondrial genome provides lower time boundary for African gene flow into Neanderthals. Nature Communications 8, 16046 (2017)
106.
Journal Article
Schuenemann, V. J.; Peltzer, A.; Welte, B.; Pelt, W. P. v.; Molak, M.; Wang, C.-C.; Furtwängler, A.; Urban, C.; Reiter, E.; Nieselt, K. et al.; Teßmann, B.; Francken, M.; Harvati, K.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.: Ancient Egyptian mummy genomes suggest an increase of Sub-Saharan African ancestry in post-Roman periods. Nature Communications 8, 15694 (2017)
107.
Journal Article
Yao, H.-B.; Wang, C.-C.; Wang, J.; Tao, X.; Shang, L.; Wen, S.-Q.; Du, Q.; Deng, Q.; Xu, B.; Huang, Y. et al.; Wang, H.-D.; Li, S.; Cong, B.; Ma, L.; Jin, L.; Krause, J.; Li, H.: Genetic structure of Tibetan populations in Gansu revealed by forensic STR loci. Scientific Reports 7, 41195 (2017)
108.
Journal Article
Andrades Valtueña, A.; Mittnik, A.; Key, F. M.; Haak, W.; Allmäe, R.; Belinskij, A.; Daubaras, M.; Feldman, M.; Jankauskas, R.; Janković, I. et al.; Massy, K.; Novak, M.; Pfrengle, S.; Reinhold, S.; Šlaus, M.; Spyrou, M. A.; Szécsényi-Nagy, A.; Tõrv, M.; Hansen, S.; Bos, K. I.; Stockhammer, P. W.; Herbig, A.; Krause, J.: The Stone Age plague and its persistence in Eurasia. Current Biology 27 (23), pp. 3683 - 3691 (2017)
109.
Journal Article
Lazaridis, I.; Mittnik, A.; Patterson, N.; Mallick, S.; Rohland, N.; Pfrengle, S.; Furtwängler, A.; Peltzer, A.; Posth, C.; Vasilakis, A. et al.; McGeorge, P. J. P.; Konsolaki-Yannopoulou, E.; Korres, G.; Martlew, H.; Michalodimitrakis, M.; Özsait, M.; Özsait, N.; Papathanasiou, A.; Richards, M.; Roodenberg, S. A.; Tzedakis, Y.; Arnott, R.; Fernandes, D. M.; Hughey, J. R.; Lotakis, D. M.; Navas, P. A.; Maniatis, Y.; Stamatoyannopoulos, J. A.; Stewardson, K.; Stockhammer, P. W.; Pinhasi, R.; Reich, D.; Krause, J.; Stamatoyannopoulos, G.: Genetic origins of the Minoans and Mycenaeans. Nature 548, 23310, pp. 212 - 218 (2017)
110.
Journal Article
Arora, N.; Schuenemann, V. J.; Jäger, G.; Peltzer, A.; Seitz, A.; Herbig, A.; Strouhal, M.; Grillová, L.; Sánchez-Busó, L.; Kühnert, D. et al.; Bos, K. I.; Davis, L. R.; Mikalová, L.; Bruisten, S.; Komericki, P.; French, P.; Grant, P. R.; Pando, M. A.; Vaulet, L. G.; Fermepin, M. R.; Martinez, A.; Centurion Lara, A.; Giacani, L.; Norris, S. J.; Šmajs, D.; Bosshard, P. P.; González-Candelas, F.; Nieselt, K.; Krause, J.; Bagheri, H. C.: Origin of modern syphilis and emergence of a pandemic Treponema pallidum cluster. Nature Microbiology 2, 16245 (2016)
111.
Journal Article
Feldman, M.; Harbeck, M.; Keller, M.; Spyrou, M. A.; Rott, A.; Trautmann, B.; Scholz, H. C.; Päffgen, B.; Peters, J.; McCormick, M. et al.; Bos, K. I.; Herbig, A.; Krause, J.: A high-coverage Yersinia pestis genome from a 6th-century Justinianic plague victim. Molecular Biology and Evolution 33 (11), pp. 2911 - 2923 (2016)
112.
Journal Article
Gogarten , J. F.; Düx, A.; Schuenemann, V. J.; Nowak, K.; Boesch, C.; Wittig, R. M.; Krause, J.; Calvignac-Spencer, S.; Leendertz, F. H.: Tools for opening new chapters in the book of Treponema pallidum evolutionary history. Clinical Microbiology and Infection 22 (11), pp. 916 - 921 (2016)
113.
Journal Article
Skoglund, P.; Posth, C.; Sirak, K.; Spriggs, M.; Valentin, F.; Bedford, S.; Clark, G. A.; Reepmeyer, C.; Petchey, F.; Fernandes, D. et al.; Fu, Q.; Harney, E.; Lipson, M.; Mallick, S.; Novak, M.; Rohland, N.; Stewardson, K.; Abdullah, S.; Cox, M. P.; Friedlaender, F. R.; Friedlaender, J. S.; Kivisild, T.; Koki, G.; Kusuma, P.; Merriwether, D. A.; Ricaut, F.-X.; Wee, J. T. S.; Patterson, N.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Reich, D.: Genomic insights into the peopling of the Southwest Pacific. Nature 538 (7626), 19844, pp. 510 - 518 (2016)
114.
Journal Article
Soubrier, J.; Gower, G.; Chen, K.; Richards, S. M.; Llamas, B.; Mitchell, K. J.; Ho, S. Y. W.; Kosintsev, P.; Lee, M. S. Y.; Baryshnikov, G. et al.; Bollongino, R.; Bover, P.; Burger, J.; Chivall, D.; Crégut-Bonnoure, E.; Decker, J. E.; Doronichev, V. B.; Douka, K.; Fordham, D. A.; Fontana, F.; Fritz, C.; Glimmerveen, J.; Golovanova, L. V.; Groves, C.; Guerreschi, A.; Haak, W.; Higham, T.; Hofman-Kamińska, E.; Immel, A.; Julien, M.-A.; Krause, J.; Krotova, O.; Langbein, F.; Larson, G.; Rohrlach, A.; Scheu, A.; Schnabel, R. D.; Taylor, J. F.; Tokarska, M.; Tosello, G.; Plicht, J. v. d.; Loenen, A. v.; Vigne, J.-D.; Wooley, O.; Orlando, L.; Kowalczyk, R.; Shapiro, B.; Cooper, A.: Early cave art and ancient DNA record the origin of European bison. Nature Communications 7, 13158 (2016)
115.
Journal Article
Mittnik, A.; Wang, C.-C.; Svoboda, J.; Krause, J.: A molecular approach to the sexing of the triple burial at the upper paleolithic site of Dolní Věstonice. PLoS One 11 (10), e0163019 (2016)
116.
Journal Article
Immel, A.; Le Cabec, A.; Bonazzi, M.; Herbig, A.; Temming, H.; Schuenemann, V. J.; Bos, K. I.; Langbein, F.; Harvati, K.; Bridault, A. et al.; Pion, G.; Julien, M.-A.; Krotova, O.; Conard, N. J.; Münzel, S. C.; Drucker, D. G.; Viola, B.; Hublin, J.-J.; Tafforeau, P.; Krause, J.: Effect of X-ray irradiation on ancient DNA in sub-fossil bones: guidelines for safe X-ray imaging. Scientific Reports 6, 32969 (2016)
117.
Journal Article
Lazaridis, I.; Nadel, D.; Rollefson, G.; Merrett, D. C.; Rohland, N.; Mallick, S.; Fernandes, D.; Novak, M.; Gamarra, B.; Sirak, K. et al.; Connell, S.; Stewardson, K.; Harney, E.; Fu, Q.; Gonzalez-Fortes, G.; Jones, E. R.; Roodenberg, S. A.; Lengyel, G.; Bocquentin, F.; Gasparian, B.; Monge, J. M.; Gregg, M.; Eshed, V.; Mizrahi, A.-S.; Meiklejohn, C.; Gerritsen, F.; Bejenaru, L.; Blüher, M.; Campbell, A.; Cavalleri, G.; Comas, D.; Froguel, P.; Gilbert, E.; Kerr, S. M.; Kovacs, P.; Krause, J.; McGettigan, D.; Merrigan, M.; Merriwether, D. A.; O'Reilly, S.; Richards, M. B.; Semino, O.; Shamoon-Pour, M.; Stefanescu, G.; Stumvoll, M.; Tönjes, A.; Torroni, A.; Wilson, J. F.; Yengo, L.; Hovhannisyan, N. A.; Patterson, N.; Pinhasi, R.; Reich, .: Genomic insights into the origin of farming in the ancient Near East. Nature 536 (7617), pp. 419 - 424 (2016)
118.
Journal Article
Rougier, H.; Crevecoeur, I.; Beauval, C.; Posth, C.; Flas, D.; Wissing, C.; Furtwängler, A.; Germonpré, M.; Gómez-Olivencia, A.; Semal, P. et al.; Plicht, J. v. d.; Bocherens, H.; Krause, J.: Neandertal cannibalism and Neandertal bones used as tools in Northern Europe. Scientific Reports 6, 29005 (2016)
119.
Journal Article
Weiß, C. L.; Schuenemann, V. J.; Devos, J.; Shirsekar, G.; Reiter, E.; Gould, B. A.; Stinchcombe, J. R.; Krause, J.; Burbano, H. A.: Temporal patterns of damage and decay kinetics of DNA retrieved from plant herbarium specimens. Royal Society Open Science 3 (6), 160239 (2016)
120.
Journal Article
Fu, Q.; Posth, C.; Hajdinjak, M.; Petr, M.; Mallick, S.; Fernandes , D.; Furtwängler , A.; Haak, W.; Meyer, M.; Mittnik, A. et al.; Nickel, B.; Peltzer, A.; Rohland, N.; Slon, V.; Talamo, S.; Lazaridis, I.; Lipson, M.; Mathieson, I.; Schiffels, S.; Skoglund, P.; Derevianko, A. P.; Drozdov, N.; Slavinsky, V.; Tsybankov, A.; Cremonesi, R. G.; Mallegni, F.; Gély, B.; Vacca, E.; Morales, M. R. G.; Straus, L. G.; Neugebauer-Maresch, C.; Teschler-Nicola, M.; Constantin, S.; Moldovan, O. T.; Benazzi, S.; Peresani, M.; Coppola, D.; Lari, M.; Ricci, S.; Ronchitelli, A.; Valentin, F.; Thevenet, C.; Wehrberger, K.; Grigorescu, K.; Rougier, H.; Crevecoeur, I.; Flas, D.; Semal, P.; Mannino, M. A.; Cupillard, C.; Bocherens, H.; Conard, N. J.; Harvati, K.; Moiseyev, V.; Drucker, D. G.; Svoboda, J.; Richards, M. P.; Caramelli, D.; Pinhasi, R.; Kelso, J.; Patterson, N.; Krause, J.; Pääbo, S.; Reich, D.: The genetic history of Ice Age Europe. Nature 534 (7606), 17993, pp. 200 - 205 (2016)
Go to Editor View