Publications of Johannes Krause

Mann, A.; Sabin, S.; Ziesemer, K.; Vågene, Å. J.; Schroeder, H.; Ozga, A. T.; Sankaranarayanan, K.; Hofman, C. A.; Fellows Yates, J. A.; Salazar-García, D. C. et al.; Frohlich, B.; Aldenderfer, M.; Hoogland, M.; Read, C.; Milner, G. R.; Stone, A. C.; Lewis, C. M.; Krause, J.; Hofman, C.; Bos, K. I.; Warinner, C. G.: Differential preservation of endogenous human and microbial DNA in dental calculus and dentin. Scientific Reports 8 (1), 9822 (2018)

Schuenemann, V. J.; Lankapalli, A. K.; Barquera, R.; Nelson, E. A.; Iraíz Hernández, D.; Acuña Alonzo, V.; Bos, K. I.; Márquez Morfín, L.; Herbig, A.; Krause, J.: Historic Treponema pallidum genomes from Colonial Mexico retrieved from archaeological remains. PLOS Neglected Tropical Diseases 12 (6), e0006447 (2018)

Spyrou, M. A.; Tukhbatova, R. I.; Wang, C.-C.; Andrades Valtueña, A.; Lankapalli, A. K.; Kondrashin, V. V.; Tsybin, V. A.; Khokhlov, A.; Kühnert, D.; Herbig, A. et al.; Bos, K. I.; Krause, J.: Analysis of 3800-year-old Yersinia pestis genomes suggests Bronze Age origin for bubonic plague. Nature Communications 9, 2234 (2018)

Schuenemann, V. J.; Avanzi, C.; Krause-Kyora, B.; Seitz, A.; Herbig, A.; Inskip, S.; Bonazzi, M.; Reiter, E.; Urban, C.; Dangvard Pedersen, D. et al.; Taylor, G. M.; Singh, P.; Stewart, G. R.; Velemínský, P.; Likovsky, J.; Marcsik, A.; Molnár, E.; Pálfi, G.; Mariotti, V.; Riga, A.; Belcastro, M. G.; Boldsen, J. L.; Nebel, A.; Mays, S.; Donoghue, H. D.; Zakrzewski, S.; Benjak, A.; Nieselt, K.; Cole, S. T.; Krause, J.: Ancient genomes reveal a high diversity of Mycobacterium leprae in medieval Europe. PLoS Pathogens 14 (5), pp. 1 - 17 (2018)

Krause-Kyora, B.; Susat, J.; Key, F. M.; Kühnert, D.; Bosse, E.; Immel, A.; Rinne, C.; Kornell, S.-C.; Yepes, D.; Franzenburg, S. et al.; Heyne, H. O.; Meier, T.; Lösch, S.; Meller, H.; Friederich, S.; Nicklisch, N.; Alt, K. W.; Schreiber, S.; Tholey, A.; Herbig, A.; Nebel, A.; Krause, J.: Neolithic and medieval virus genomes reveal complex evolution of Hepatitis B. eLife 7, e36666 (2018)

Hajdinjak, M.; Fu, Q.; Hübner, A.; Petr, M.; Mafessoni, F.; Grote, S.; Skoglund, P.; Narasimham, V.; Rougier, H.; Crevecoeur, I. et al.; Semal, P.; Soressi, M.; Talamo, S.; Hublin, J.-J.; Gušić, I.; Kućan, Ž.; Rudan, P.; Golovanova, L. V.; Doronichev, V. B.; Posth, C.; Krause, J.; Korlević, P.; Nagel, S.; Nickel, B.; Slatkin, M.; Patterson, N.; Reich, D.; Prüfer, K.; Meyer, M.; Pääbo, S.; Kelso, J.: Reconstructing the genetic history of late Neanderthals. Nature 555, pp. 652 - 656 (2018)

Olalde, I.; Brace, S.; Allentoft, M. E.; Armit, I.; Kristiansen, K.; Booth, T.; Rohland, N.; Mallick, S.; Szécsényi-Nagy, A.; Mittnik, A. et al.; Altena, E.; Lipson, M.; Lazaridis, I.; Harper, T. K.; Patterson, N.; Broomandkhoshbacht, N.; Diekmann, Y.; Faltyskova, Z.; Fernandes, D.; Ferry, M.; Harney, E.; de Knijff, P.; Michel, M.; Oppenheimer, J.; Stewardson, K.; Barclay, A.; Alt, K. W.; Liesau, C.; Ríos, P.; Blasco, C.; Miguel, J. V.; García, R. M.; Fernández, A. A.; Bánffy, E.; Bernabò-Brea, M.; Billoin, D.; Bonsall, C.; Bonsall, L.; Allen, T.; Büster, L.; Carver, S.; Navarro, L. C.; Craig, O. E.; Cook, G. T.; Cunliffe, B.; Denaire, A.; Dinwiddy, K. E.; Dodwell, N.; Ernée, M.; Evans, C.; Kuchařík, M.; Farré, J. F.; Fowler, C.; Gazenbeek, M.; Pena, R. G.; Haber-Uriarte, M.; Haduch, E.; Hey, G.; Jowett, N.; Knowles, T.; Massy, K.; Pfrengle, S.; Lefranc, P.; Lemercier, O.; Lefebvre, A.; Martínez, C. H.; Olmo, V. G.; Ramírez, A. B.; Maurandi, J. L.; Majó, T.; McKinley, J. I.; McSweeney, K.; Mende, B. G.; Mod, A.; Kulcsár, G.; Kiss, V.; Czene, A.; Patay, R.; Endrődi, A.; Köhler, K.; Hajdu, T.; Szeniczey, T.; Dani, J.; Bernert, Z.; Hoole, M.; Cheronet, O.; Keating, D.; Velemínský, P.; Dobeš, M.; Candilio, F.; Brown, F.; Fernández, R. F.; Herrero-Corral, A.-M.; Tusa, S.; Carnieri, E.; Lentini, L.; Valenti, A.; Zanini, A.; Waddington, C.; Delibes, G.; Guerra-Doce, E.; Neil, B.; Brittain, M.; Luke, M.; Mortimer, R.; Desideri, J.; Besse, M.; Brücken, G.; Furmanek, M.; Hałuszko, A.; Mackiewicz, M.; Rapiński, A.; Leach, S.; Soriano, I.; Lillios, K. T.; Cardoso, J. L.; Pearson, M. P.; Włodarczak, P.; Price, T. D.; Prieto, P.; Rey, P.-J.; Risch, R.; Guerra, R.; A., M.; Schmitt, A.; Serralongue, J.; Silva, A. M.; Smrčka, V.; Vergnaud, L.; Zilhão, J.; Caramelli, D.; Higham, T.; Thomas, M. G.; Kennett, D. J.; Fokkens, H.; Heyd, V.; Sheridan, A.; Sjögren, K.-G.; Stockhammer, P. W.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Haak, W.; Barnes, I.; Lalueza-Fox, C.; Reich, D.: The Beaker phenomenon and the genomic transformation of northwest Europe. Nature 555, pp. 190 - 196 (2018)

Loosdrecht, M. S. v. d.; Bouzouggar, A.; Humphrey, L.; Posth, C.; Barton, N.; Aximu-Petri, A.; Nickel, B.; Nagel, S.; Talbi, E. H.; Hajraoui, M. A. E. et al.; Amzazi, S.; Hublin, J.-J.; Pääbo, S.; Schiffels, S.; Meyer, M.; Haak, W.; Jeong, C.; Krause, J.: Pleistocene North African genomes link near Eastern and sub-Saharan African human populations. Science 360 (6388), pp. 548 - 552 (2018)

Vågene, Å. J.; Herbig, A.; Campana, M. G.; García, R.; M., N.; Warinner, C.; Sabin, S.; Spyrou, M. A.; Andrades Valtueña, A.; Huson, D. et al.; Tuross, N.; Bos, K. I.; Krause, J.: Salmonella enterica genomes from victims of a major sixteenth-century epidemic in Mexico. Nature Ecology & Evolution 2 (3), pp. 520 - 528 (2018)

Posth, C.; Nägele, K.; Colleran, H.; Valentin, F.; Bedford, S.; Kami, K. W.; Shing, R.; Buckley, H.; Kinaston, R.; Walworth, M. et al.; Clark, G. R.; Reepmeyer, C.; Flexner, J.; Maric, T.; Moser, J.; Gresky, J.; Kiko, L.; Robson, K. J.; Auckland, K.; Oppenheimer, S. J.; Hill, A. V. S.; Mentzer, A. J.; Zech, J.; Petchey, F.; Roberts, P.; Jeong, C.; Gray, R. D.; Krause, J.; Powell, A.: Language continuity despite population replacement in Remote Oceania. Nature Ecology & Evolution 2 (4), pp. 731 - 740 (2018)

Exposito-Alonso, M.; Becker, C.; Schuenemann, V. J.; Reiter, E.; Setzer, C.; Slovak, R.; Brachi, B.; Hagmann, J.; Grimm, D. G.; Chen, J. et al.; Busch, W.; Bergelson, J.; Ness, R. W.; Krause, J.; Burbano, H. A.; Weigel, D.: The rate and potential relevance of new mutations in a colonizing plant lineage. PLoS Genetics 14 (2), e1007155 (2018)

Mathieson, I.; Alpaslan-Roodenberg, S.; Posth, C.; Szécsényi-Nagy, A.; Rohland, N.; Mallick, S.; Olalde, I.; Broomandkhoshbacht, N.; Candilio, F.; Cheronet, O. et al.; Fernandes, D.; Ferry, M.; Gamarra, B.; Fortes, G. G.; Haak, W.; Harney, E.; Jones, E.; Keating, D.; Krause-Kyora, B.; Kucukkalipci, I.; Michel, M.; Mittnik, A.; Nägele, K.; Novak, M.; Oppenheimer, J.; Patterson, N.; Pfrengle, S.; Sirak, K.; Stewardson, K.; Vai, S.; Alexandrov, S.; Alt, K. W.; Andreescu, R.; Antonović, D.; Ash, A.; Atanassova, N.; Bacvarov, K.; Gusztáv, M. B.; Bocherens, H.; Bolus, M.; Boroneanţ, A.; Boyadzhiev, Y.; Budnik, A.; Burmaz, J.; Chohadzhiev, S.; Conard, N. J.; Cottiaux, R.; Čuka, M.; Cupillard, C.; Drucker, D. G.; Elenski, N.; Francken, M.; Galabova, B.; Ganetsovski, G.; Gély, B.; Hajdu, T.; Handzhyiska, V.; Harvati, K.; Higham, T.; Iliev, S.; Janković, I.; Karavanić, I.; Kennett, D. J.; Komšo, D.; Kozak, A.; Labuda, D.; Lari, M.; Lazar, C.; Leppek, M.; Leshtakov, K.; Vetro, D. L.; Los, D.; Lozanov, I.; Malina, M.; Martini, F.; McSweeney, K.; Meller, H.; Menđušić, M.; Mirea, P.; Moiseyev, V.; Petrova, V.; Price, T. D.; Simalcsik, A.; Sineo, L.; Šlaus, M.; Slavchev, V.; Stanev, P.; Starović, A.; Szeniczey, T.; Talamo, S.; Teschler-Nicola, M.; Thevenet, C.; Valchev, I.; Valentin, F.; Vasilyev, S.; Veljanovska, F.; Venelinova, S.; Veselovskaya, E.; Viola, T.; Virag, C.; Zaninović, J.; Zäuner, S.; Stockhammer, P. W.; Catalano, G.; Krauß, R.; Caramelli, D.; Zariņa, G.; Gaydarska, B.; Lillie, M.; Nikitin, A. G.; Potekhina, I.; Papathanasiou, A.; Borić, D.; Bonsall, C.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Reich, D.: The genomic history of southeastern Europe. Nature 555, pp. 197 - 203 (2018)

Peltzer, A.; Mittnik, A.; Wang, C.-C.; Begg, T.; Posth, C.; Nieselt, K.; Krause, J.: Inferring genetic origins and phenotypic traits of George Bähr, the architect of the Dresden Frauenkirche. Scientific Reports 8, 2115 (2018)

Mittnik, A.; Wang, C.-C.; Pfrengle, S.; Daubaras, M.; Zariņa, G.; Hallgren, F.; Allmäe, R.; Khartanovich, V.; Moiseyev, V.; Tõrv, M. et al.; Furtwängler, A.; Andrades Valtueña, A.; Feldman, M.; Economou, C.; Oinonen, M.; Vasks, A.; Balanovska, E.; Reich, D.; Jankauskas, R.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.: The genetic prehistory of the Baltic Sea region. Nature Communications 9, 442 (2018)

Gaunitz, C.; Fages, A.; Hanghøj, K.; Albrechtsen, A.; Khan, N.; Schubert, M.; Seguin-Orlando, A.; Owens, I. J.; Felkel, S.; Bignon-Lau, O. et al.; Barros Damgaard de, P.; Mittnik, A.; Mohaseb, A. F.; Davoudi, H.; Alquraishi, S.; Alfarhan, A. H.; Al-Rasheid, K. A. S.; Crubézy, E.; Benecke, N.; Olsen, S.; Brown, D.; Anthony, D.; Massy, K.; Pitulko, V.; Kasparov, A.; Brem, G.; Hofreiter, M.; Mukhtarova, G.; Baimukhanov, N.; Lõugas, L.; Onar, V.; Stockhammer, P. W.; Krause, J.; Boldgiv, B.; Undrakhbold, S.; Erdenebaatar, D.; Lepetz, S.; Mashkour, M.; Ludwig, A.; Wallner, B.; Merz, V.; Merz, I.; Zaibert, V.; Willerslev, E.; Librado, P.; Outram, A. K.; Orlando, L.: Ancient genomes revisit the ancestry of domestic and Przewalski’s horses. Science 360 (6384), pp. 111 - 114 (2018)

Schuenemann, V. J.; Avanzi, C.; Krause-Kyora, B.; Seitz, A.; Herbig, A.; Inskip, S.; Bonazzi, M.; Reiter, E.; Urban, C.; Dangvard Pedersen, D. et al.; Taylor, G. M.; Singh, P.; Stewart, G. R.; Velemínský, P.; Likovsky, J.; Marcsik, A.; Molnár, E.; Pálfi, G.; Mariotti, V.; Riga, A.; Belcastro, M. G.; Boldsen, J. L.; Nebel, A.; Mays, S.; Donoghue, H. D.; Zakrzewski, S.; Benjak, A.; Nieselt, K.; Cole, S. T.; Krause, J.: Ancient genomes reveal a high diversity of Mycobacterium leprae in medieval Europe. PLoS Pathogens 14 (5), e1006997 (2018)

Fellows Yates, J. A.; Drucker, D. G.; Reiter, E.; Heumos, S.; Welker, F.; Münzel, S. C.; Wojtal, P.; Lázničková-Galetová, M.; Conard, N. J.; Herbig, A. et al.; Bocherens, H.; Krause, J.: Central European Woolly Mammoth population dynamics: Insights from Late Pleistocene Mitochondrial Genomes. Scientific Reports 7, 17714 (2017)

Szécsényi-Nagy, .; Roth, C.; Brandt, G.; Rihuete-Herrada, C.; Tejedor-Rodríguez, C.; Held, P.; García-Martínez-de-Lagrán, Í.; Magallón, H. A.; Zesch, S.; Knipper, C. et al.; Bánffy, E.; Friederich, S.; Meller, H.; Ramírez, P. B.; Bermejo, R. B.; de Behrmann, R. B.; Herrero-Corral, A. M.; Fernández, R. F.; Fernández, C. A.; Echevarria, J. J.; Rindlisbacher, L.; Oliart, C.; Fregeiro, M.-I.; Soriano, I.; Vicente, O.; Micó, R.; Lull, V.; Díaz, J. S.; Padilla, J. A. L.; de Muñoz, C. R. T.; Pérez, M. S. H.; Maestre, F. J. J.; Maurandi, J. L.; Fernández, A. A.; Lillios, K. T.; Silva, A. M.; Ramalho, M. M.; Oosterbeek, L. M.; Cunha, C.; Waterman, A. J.; Buxó, J. R.; Martínez, A.; Martínez, J. P.; Ortiz, M. H.; Mejías-García, J. C.; Espín, J. C. P.; Briones, R. C.-A.; Tomé, T.; Ballestero, E. C.; Cardoso, J. L.; Araújo, A. C.; von Lettow-Vorbeck, C. L.; Bosqued, C. B.; Mendoza, P. R.; Pujante, A.; Royo-Guillén, J. I.; Beviá, M. A. E.; Goncalves, . M. D. S.; Parreira, R.; Hernández, E. M.; Izquierdo, E. M.; Miguel, J. V. y.; García, R. M.; Calvo, V. M.; Jiménez, O. L.; Krause, J.; Pichler, S. L.; Garrido-Pena, R.; Kunst, M.; Risch, R.; Rojo-Guerra, M. A.; Haak, W.; Alt, K. W.: The maternal genetic make-up of the Iberian Peninsula between the Neolithic and the Early Bronze Age. Scientific Reports 7, 15644 (2017)

Knipper, C.; Mittnik, A.; Massy, K.; Kociumaka, C.; Kucukkalipci, I.; Maus, M.; Wittenborn, F.; Metz, S. E.; Staskiewicz, A.; Krause, J. et al.; Stockhammer, P. W.: Female exogamy and gene pool diversification at the transition from the final neolithic to the early Bronze Age in central Europe. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 114 (38), pp. 10083 - 10088 (2017)

Skoglund, P.; Thompson, J. C.; Prendergast, M. E.; Mittnik, A.; Sirak, K.; Hajdinjak, M.; Salie, T.; Rohland, N.; Mallick, S.; Peltzer, A. et al.; Heinze, A.; Olalde, I.; Ferry, M.; Harney, E.; Michel, M.; Stewardson, K.; Cerezo-Román, J. I.; Chiumia, C.; Crowther, A.; Gomani-Chindebvu, E.; Gidna, A. O.; M.Grillo, K.; TaneliHelenius, I.; Hellenthal, G.; Helm, R.; Horton, M.; López, S.; Mabulla, A. Z. P.; Parkington, J.; Thomas, C. S. M. G.; Tibesasa, R.; Welling, M.; Hayes, V. M.; Kennett, D. J.; Ramesar, R.; Meyer, M.; Pääbo, S.; Patterson, N.; Morris, A. G.; Boivin, N. L.; Pinhasi, R.; Krause, J.; Reich, D.: Reconstructing prehistoric African population structure. Cell 171 (1), e21, pp. 59 - 71 (2017)