Publications of Johannes Krause

Gogarten , J. F.; Düx, A.; Schuenemann, V. J.; Nowak, K.; Boesch, C.; Wittig, R. M.; Krause, J.; Calvignac-Spencer, S.; Leendertz, F. H.: Tools for opening new chapters in the book of Treponema pallidum evolutionary history. Clinical Microbiology and Infection 22 (11), pp. 916 - 921 (2016)

Skoglund, P.; Posth, C.; Sirak, K.; Spriggs, M.; Valentin, F.; Bedford, S.; Clark, G. A.; Reepmeyer, C.; Petchey, F.; Fernandes, D. et al.; Fu, Q.; Harney, E.; Lipson, M.; Mallick, S.; Novak, M.; Rohland, N.; Stewardson, K.; Abdullah, S.; Cox, M. P.; Friedlaender, F. R.; Friedlaender, J. S.; Kivisild, T.; Koki, G.; Kusuma, P.; Merriwether, D. A.; Ricaut, F.-X.; Wee, J. T. S.; Patterson, N.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Reich, D.: Genomic insights into the peopling of the Southwest Pacific. Nature 538 (7626), 19844, pp. 510 - 518 (2016)

Soubrier, J.; Gower, G.; Chen, K.; Richards, S. M.; Llamas, B.; Mitchell, K. J.; Ho, S. Y. W.; Kosintsev, P.; Lee, M. S. Y.; Baryshnikov, G. et al.; Bollongino, R.; Bover, P.; Burger, J.; Chivall, D.; Crégut-Bonnoure, E.; Decker, J. E.; Doronichev, V. B.; Douka, K.; Fordham, D. A.; Fontana, F.; Fritz, C.; Glimmerveen, J.; Golovanova, L. V.; Groves, C.; Guerreschi, A.; Haak, W.; Higham, T.; Hofman-Kamińska, E.; Immel, A.; Julien, M.-A.; Krause, J.; Krotova, O.; Langbein, F.; Larson, G.; Rohrlach, A.; Scheu, A.; Schnabel, R. D.; Taylor, J. F.; Tokarska, M.; Tosello, G.; Plicht, J. v. d.; Loenen, A. v.; Vigne, J.-D.; Wooley, O.; Orlando, L.; Kowalczyk, R.; Shapiro, B.; Cooper, A.: Early cave art and ancient DNA record the origin of European bison. Nature Communications 7, 13158 (2016)

Mittnik, A.; Wang, C.-C.; Svoboda, J.; Krause, J.: A molecular approach to the sexing of the triple burial at the upper paleolithic site of Dolní Věstonice. PLoS One 11 (10), e0163019 (2016)

Immel, A.; Le Cabec, A.; Bonazzi, M.; Herbig, A.; Temming, H.; Schuenemann, V. J.; Bos, K. I.; Langbein, F.; Harvati, K.; Bridault, A. et al.; Pion, G.; Julien, M.-A.; Krotova, O.; Conard, N. J.; Münzel, S. C.; Drucker, D. G.; Viola, B.; Hublin, J.-J.; Tafforeau, P.; Krause, J.: Effect of X-ray irradiation on ancient DNA in sub-fossil bones: guidelines for safe X-ray imaging. Scientific Reports 6, 32969 (2016)

Lazaridis, I.; Nadel, D.; Rollefson, G.; Merrett, D. C.; Rohland, N.; Mallick, S.; Fernandes, D.; Novak, M.; Gamarra, B.; Sirak, K. et al.; Connell, S.; Stewardson, K.; Harney, E.; Fu, Q.; Gonzalez-Fortes, G.; Jones, E. R.; Roodenberg, S. A.; Lengyel, G.; Bocquentin, F.; Gasparian, B.; Monge, J. M.; Gregg, M.; Eshed, V.; Mizrahi, A.-S.; Meiklejohn, C.; Gerritsen, F.; Bejenaru, L.; Blüher, M.; Campbell, A.; Cavalleri, G.; Comas, D.; Froguel, P.; Gilbert, E.; Kerr, S. M.; Kovacs, P.; Krause, J.; McGettigan, D.; Merrigan, M.; Merriwether, D. A.; O'Reilly, S.; Richards, M. B.; Semino, O.; Shamoon-Pour, M.; Stefanescu, G.; Stumvoll, M.; Tönjes, A.; Torroni, A.; Wilson, J. F.; Yengo, L.; Hovhannisyan, N. A.; Patterson, N.; Pinhasi, R.; Reich, .: Genomic insights into the origin of farming in the ancient Near East. Nature 536 (7617), pp. 419 - 424 (2016)

Rougier, H.; Crevecoeur, I.; Beauval, C.; Posth, C.; Flas, D.; Wissing, C.; Furtwängler, A.; Germonpré, M.; Gómez-Olivencia, A.; Semal, P. et al.; Plicht, J. v. d.; Bocherens, H.; Krause, J.: Neandertal cannibalism and Neandertal bones used as tools in Northern Europe. Scientific Reports 6, 29005 (2016)

Weiß, C. L.; Schuenemann, V. J.; Devos, J.; Shirsekar, G.; Reiter, E.; Gould, B. A.; Stinchcombe, J. R.; Krause, J.; Burbano, H. A.: Temporal patterns of damage and decay kinetics of DNA retrieved from plant herbarium specimens. Royal Society Open Science 3 (6), 160239 (2016)

Fu, Q.; Posth, C.; Hajdinjak, M.; Petr, M.; Mallick, S.; Fernandes , D.; Furtwängler , A.; Haak, W.; Meyer, M.; Mittnik, A. et al.; Nickel, B.; Peltzer, A.; Rohland, N.; Slon, V.; Talamo, S.; Lazaridis, I.; Lipson, M.; Mathieson, I.; Schiffels, S.; Skoglund, P.; Derevianko, A. P.; Drozdov, N.; Slavinsky, V.; Tsybankov, A.; Cremonesi, R. G.; Mallegni, F.; Gély, B.; Vacca, E.; Morales, M. R. G.; Straus, L. G.; Neugebauer-Maresch, C.; Teschler-Nicola, M.; Constantin, S.; Moldovan, O. T.; Benazzi, S.; Peresani, M.; Coppola, D.; Lari, M.; Ricci, S.; Ronchitelli, A.; Valentin, F.; Thevenet, C.; Wehrberger, K.; Grigorescu, K.; Rougier, H.; Crevecoeur, I.; Flas, D.; Semal, P.; Mannino, M. A.; Cupillard, C.; Bocherens, H.; Conard, N. J.; Harvati, K.; Moiseyev, V.; Drucker, D. G.; Svoboda, J.; Richards, M. P.; Caramelli, D.; Pinhasi, R.; Kelso, J.; Patterson, N.; Krause, J.; Pääbo, S.; Reich, D.: The genetic history of Ice Age Europe. Nature 534 (7606), 17993, pp. 200 - 205 (2016)

Spyrou, M. A.; Tukhbatova, R. I.; Feldman, M.; Drath, J.; Kacki, S.; Heredia, J. B. d.; Arnold, S.; Sitdikov, A. G.; Castex, D.; Wahl, J. et al.; Gazimzyanov, I. R.; Nurgaliev, D. K.; Herbig, A.; Bos, K. I.; Krause, J.: Historical Y. pestis genomes reveal the European Black Death as the source of ancient and modern plague pandemics. Cell Host & Microbe 19 (6), pp. 874 - 881 (2016)

Krause, J.; Pääbo, S.: Genetic time travel. Genetics 203 (1), pp. 9 - 12 (2016)

Posth, C.; Renaud, G.; Mittnik, A.; Dorothée G., D.; Rougier, H.; Cupillard, C.; Valentin, F.; Thevenet, C.; Anja, F.; Wißing, C. et al.; Francken, M.; Malina, M.; Bolus, M.; Lari, M.; Gigli, E.; Capecchi, G.; Crevecoeur, I.; Beauval, C.; Flas, D.; Germonpré, M.; Plicht, J. v. d.; Cottiaux, R.; Gély, B.; Ronchitelli, A.; Wehrberger, K.; Grigourescu, D.; Svoboda, J.; Semal, P.; Caramelli, D.; HervéBocherens, H.; Harvati, K.; Conard, N. J.; Haak, W.; Powell, A.; Krause, J.: Pleistocene mitochondrial genomes suggest a single major dispersal of non-Africans and late glacial population turnover in Europe. Current Biology 26 (6), pp. 827 - 833 (2016)

Bos, K.; Herbig, A.; Sahl, J.; Waglechner, N.; Fourment, M.; Forrest, S. A.; Klunk, J.; Schuenemann, V. J.; Poinar, D.; Kuch, M. et al.; Golding, G. B.; Dutour, O.; Keim, P.; Wagner, D. M.; Holmes, E. C.; Krause, J.; Poinar, H. N.: Eighteenth century Yersinia pestis genomes reveal the long-term persistence of an historical plague focus. eLife 5, e12994 (2016)

Maixner, F.; Krause-Kyora, B.; Turaev, D.; Herbig, A.; Hoopmann, M. R.; Hallows, J. L.; Kusebauch, U.; Vigl, E. E.; Malfertheiner, P.; Megraud, F. et al.; O’Sullivan, N.; Cipollini, G.; Coia, V.; Samadelli, M.; Engstrand, L.; Linz, B.; Moritz, R. L.; Grimm, R.; Krause, J.; Nebel, A.; Moodley, Y.; Rattei, T.; Zink, A.: The 5300-year-old Helicobacter pylori genome of the Iceman. Science 351 (6269), pp. 162 - 165 (2016)

Mascher, M.; Schuenemann, V.J.; Davidovich, U.; Marom, N.; Himmelbach, A.; Hübner, S.; Korol, A.; David, M.; Reiter, E.; Riehl, S. et al.; Schreiber, M.; Vohr, S.H.; Green, R.E.; Dawson, I.K.; Russell, J.; Kilian, B.; Muehlbauer, G.J.; Waugh, R.; Fahima, T.; Krause, J.; Weiss, E.; Stein, N.: Genomic analysis of 6,000-year-old cultivated grain illuminates the domestication history of barley. Nature Genetics 48 (9), pp. 1089 - 1095 (2016)

Peltzer, A.; Jager, G.; Herbig, A.; Seitz, A.; Kniep, C.; Krause, J.; Nieselt, K.: EAGER: efficient ancient genome reconstruction. Genome Biology 17, 60 (2016)

Mathieson, I.; Lazaridis, I.; Rohland, N.; Mallick, S.; Patterson, N.; Roodenberg, S. A.; Harney, E.; Stewardson, K.; Fernandes, D.; Novak, M. et al.; Sirak, K.; Gamba, C.; Jones, E. R.; Llamas, B.; Dryomov, S.; Pickrell, J.; Arsuaga, J. L.; de Castro, J. M. B.; Carbonell, E.; Gerritsen, F.; Khokhlov, A.; Kuznetsov, P.; Lozano, M.; Meller, H.; Mochalov, O.; Moiseyev, V.; Guerra, M. A. R.; Roodenberg, J.; Vergès, J. M.; Krause, J.; Cooper, A.; Alt, K. W.; Brown, D.; Anthony, D.; Lalueza-Fox, C.; Haak, W.; Pinhas, R.; Reich, D.: Genome-wide patterns of selection in 230 ancient Eurasians. Nature 528 (7583), 16152, pp. 499 - 503 (2015)

Stockhammer, P. W.; Massy, K.; Knipper, C.; Friedrich, R.; Kromer, B.; Lindauer, S.; Radosavljević, J.; Wittenborn, F.; Krause, J.: Rewriting the Central European Early Bronze Age chronology: Evidence from large-scale radiocarbon dating. PLoS One, e0139705 (2015)

Haak, W.; Lazaridis, I.; Patterson, N.; Rohland, N.; Mallick, S.; Llamas, B.; Brandt, G.; Nordenfelt, S.; Harney, E.; Stewardson, K. et al.; Fu, Q.; Mittnik, A.; Bánffy, E.; Economou, C.; Francken, M.; Friederich, S.; Pena, R. G.; Hallgren, F.; Khartanovich, V.; Khokhlov, A.; Kunst, M.; Kuznetsov, P.; Meller, H.; Mochalov, O.; Moiseyev, V.; Nicklisch, N.; Pichler, S. L.; Risch, R.; Guerra, M. A. R.; Roth, C.; Szécsényi-Nagy, A.; Wahl, J.; Meyer, M.; Krause, J.; Brown, D.; Anthony, D.; Cooper, A.; Alt, K. W.; Reich, D.: Massive migration from the steppe was a source for Indo-European languages in Europe. Nature 522 (7555), pp. 207 - 211 (2015)

Immel, A.; Drucker, D. G.; Bonazzi, M.; Jahnke, T. K.; Munzel, S. C.; Schuenemann, V. J.; Herbig, A.; Kind, C.-J.; Krause, J.: Mitochondrial genomes of giant deers suggest their late survival in Central Europe. Scientific Reports 5, 10853 (2015)