Publications of Maria A. Spyrou

Journal Article (23)

1.
Journal Article
Neumann, G. U.; Skourtanioti, E.; Burri Promerová, M.; Nelson, E. A.; Michel, M.; Hiss, A. N.; McGeorge, P. J.P.; Betancourt, P. P.; Spyrou, M. A.; Krause, J. et al.; Stockhammer, P. W.: Ancient Yersinia pestis and Salmonella enterica genomes from Bronze Age Crete. Current Biology 32 (16), 094, pp. 3641 - 3649.e8 (2022)
2.
Journal Article
Spyrou, M. A.; Musralina, L.; Gnecchi Ruscone, G. A.; Kocher, A.; Borbone, P.-G.; Khartanovich, V. I.; Buzhilova, A.; Djansugurova, L.; Bos, K. I.; Kühnert, D. et al.; Haak, W.; Slavin, P.; Krause, J.: The source of the Black Death in fourteenth-century central Eurasia. Nature 606 (7915), s41586-022-04800-3, pp. 718 - 724 (2022)
3.
Journal Article
Immel, A.; Key, F. M.; Szolek, A.; Barquera, R.; Robinson, M. K.; Harrison, G. F.; Palmer, W. H.; Spyrou, M. A.; Susat, J.; Krause-Kyora, B. et al.; Bos, K. I.; Forrest, S.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Sauter, J.; Solloch, U.; Schmidt, A. H.; Schuenemann, V. J.; Reiter, E.; Kairies, M. S.; Weiß, R.; Arnold, S.; Wahl, J.; Hollenbach, J. A.; Kohlbacher, O.; Herbig, A.; Norman, P. J.; Krause, J.: Analysis of genomic DNA from medieval plague victims suggests long-term effect of Yersinia pestis on human immunity genes. Molecular Biology and Evolution 38 (10), msab147, pp. 4059 - 4076 (2021)
4.
Journal Article
Kocher, A.; Papac, L.; Barquera Lozano, R. J.; Key, F. M.; Spyrou, M. A.; Hübler, R.; Rohrlach, A. B.; Aron, F.; Stahl, R.; Wissgott, A. et al.; van Bömmel, F.; Pfefferkorn, M.; Mittnik, A.; Villalba-Mouco, V.; Neumann, G.; Rivollat, M.; Loosdrecht, M. S. v. d.; Majander, K.; Tukhbatova, R. I.; Musralina, L.; Ghalichi, A.; Penske, S. E.; Sabin, S.; Michel, M.; Gretzinger, J.; Nelson, E. A.; Ferraz da Silva, T.; Nägele, K.; Parker, C. E.; Keller, M.; Guevara, E.; Feldman, M.; Eisenmann, S.; Skourtanioti, E.; Giffin, K.; Gnecchi Ruscone, G. A.; Friederich, S.; Schimmenti, V.; Khartanovich, V.; Karapetian, M. K.; Chaplygin, M. S.; Kufterin, V. V.; Khokhlov, A. A.; Chizhevsky, A. A.; Stashenkov, D. A.; Kochkina, A. F.; Tejedor-Rodríguez, C.; de Lagrán, Í. G.-M.; Arcusa-Magallón, H.; Garrido-Pena, R.; Royo-Guillén, J. I.; Novácek, J.; Rottier, S.; Kacki, S.; Saintot, S.; Kaverzneva, E.; Belinskiy, A. B.; Velemínský, P.; Limburský, P.; Kostka, M.; Loe, L.; Popescu, E.; Clarke, R.; Lyons, A.; Mortimer, R.; Sajantila, A.; de Armas, Y. C.; Godoy, S. T. H.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Pearson, J.; Binder, D.; Lefranc, P.; Kantorovich, A. R.; Maslov, V. E.; Lai, L.; Zoledziewska, M.; Beckett, J. F.; Langová, M.; Danielisová, A.; Ingman, T.; Atiénzar, G. G.; de Ibáñez, M. P. M.; Romero, A.; Sperduti, A.; Beckett, S.; Salter, S. J.; Zilivinskaya, E. D.; Vasilev, D. V.; von Heyking, K.; Burger, R. L.; Salazar, L. C.; Amkreutz, L.; Navruzbekov, M.; Rosenstock, E.; Alonso-Fernández, C.; Slavchev, V.; Kalmykov, A. A.; Atabiev, B. C.; Batieva, E.; Calmet, M. A.; Llamas, B.; Schultz, M.; Krauß, R.; Jiménez-Echevarría, J.; Francken, M.; Shnaider, S.; de Knijff, P.; Altena, E.; de Vijver, K. V.; Fehren-Schmitz, L.; Tung, T. A.; Lösch, S.; Dobrovolskaya, M.; Makarov, N.; Read, C.; Twest, M. V.; Sagona, C.; Ramsl, P. C.; Akar, M.; Yener, K. A.; Ballestero, E. C.; Cucca, F.; Mazzarello, V.; Utrilla, P.; Rademaker, K.; Fernández-Domínguez, E.; Baird, D.; Semal, P.; Márquez-Morfín, L.; Roksandic, M.; Steiner, H.; Salazar-García, D. C.; Shishlina, N.; Erdal, Y. S.; Hallgren, F.; Boyadzhiev, Y.; Boyadzhiev, K.; Küßner, M.; Sayer, D.; Onkamo, P.; Skeates, R.; Rojo-Guerra, M.; Buzhilova, A.; Khussainova, E.; Djansugurova, L. B.; Beisenov, A. Z.; Samashev, Z.; Massy, K.; Mannino, M.; Moiseyev, V.; Mannermaa, K.; Balanovsky, O.; Deguilloux, M.-F.; Reinhold, S.; Hansen, S.; Kitov, E. P.; Dobeš, M.; Ernée, M.; Meller, H.; Alt, K. W.; Prüfer, K.; Warinner, C. G.; Schiffels, S.; Stockhammer, P. W.; Bos, K. I.; Posth, C.; Herbig, A.; Haak, W.; Krause, J.; Kühnert, D.: Ten millennia of hepatitis B virus evolution. Science 374 (6564), abi5658, pp. 182 - 188 (2021)
5.
Journal Article
Posth, C.; Zaro, V.; Spyrou, M. A.; Vai, S.; Gnecchi Ruscone, G. A.; Modi, A.; Peltzer, A.; Mötsch, A.; Nägele, K.; Vågene, Å. J. et al.; Nelson, E. A.; Radzeviciute, R.; Freund, C.; Bondioli, L. M.; Cappuccini, L.; Frenzel, H.; Pacciani, E.; Boschin, F.; Capecchi, G.; Martini, I.; Moroni, A.; Ricci, S.; Sperduti, A.; Turchetti, M. A.; Riga, A.; Zavattaro, M.; Zifferero, A.; Heyne, H. O.; Fernández-Domínguez, E.; Kroonen, G. J.; McCormick, M.; Haak, W.; Lari, M.; Barbujani, G.; Bondioli, L.; Bos, K. I.; Caramelli, D.; Krause, J.: The origin and legacy of the Etruscans through a 2000-year archeogenomic time transect. Science Advances 7 (39), eabi7673, pp. 1 - 13 (2021)
6.
Journal Article
Papac, L.; Ernée, M.; Dobeš, M.; Langová, M.; Rohrlach, A. B.; Aron, F.; Neumann, G.; Spyrou, M. A.; Rohland, N.; Velemínský, P. et al.; Kuna, M.; Brzobohatá, H.; Culleton, B.; Daněček, D.; Danielisová, A.; Dobisíková, M.; Hložek, J.; Kennett, D. J.; Klementová, J.; Kostka, M.; Krištuf, P.; Kuchařík, M.; Hlavová, J. K.; Limburský, P.; Malyková, D.; Mattiello, L.; Petriščáková, M. P.; Průchová, E.; Stránská, P.; Smejtek, L.; Šumberová, J. Š.; Švejcar, O.; Trefný, M.; Vávra, M.; Kolář, J.; Volker , H.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Reich, D.; Schiffels, S.; Haak, W.: Dynamic changes in genomic and social structures in third millennium BCE central Europe. Science Advances 7 (35), 6941 (2021)
7.
Journal Article
Prüfer, K.; Posth, C.; Yu, H.; Stoessel, A.; Spyrou, M. A.; Deviese, T.; Mattonai, M.; Ribechini, E.; Higham, T.; Velemínský, P. et al.; Brůžek, J.; Krause, J.: A genome sequence from a modern human skull over 45,000 years old from Zlatý kůň in Czechia. Nature Ecology & Evolution, s41559-021-01443-x (2021)
8.
Journal Article
Gnecchi-Ruscone, G. A.; Khussainova, E.; Kahbatkyzy, N.; Musralina, L.; Spyrou, M. A.; Bianco, R. A.; Radzeviciute, R.; Martins, N. F. G.; Freund, C.; Iksan, O. et al.; Garshin, A.; Zhaniyazov, Z.; Bekmanov, B.; Kitov, E.; Samashev, Z.; Beisenov, A.; Berezina, N.; Berezin, Y.; Bíró, A. Z.; Évinger, S.; Bissembaev, A.; Akhatov, G.; Mamedov, A.; Onggaruly, A.; Voyakin, D.; Chotbayev, A.; Kariyev, Y.; Buzhilova, A.; Djansugurova, L.; Jeong, C.; Krause, J.: Ancient genomic time transect from the Central Asian Steppe unravels the history of the Scythians. Science Advances 7 (13), eabe4414 (2021)
9.
Journal Article
Fellows Yates, J. A.; Andrades Valtueña, A.; Vågene, A. J.; Cribdon, B.; Velsko, I. M.; Borry, M.; Bravo-López, M. J.; Fernandez-Guerra, A.; Green, E. J.; Ramachandran, S. L. et al.; Heintzman, P. D.; Spyrou, M. A.; Hübner, A.; Gancz, A. S.; Hider, J.; Allshouse, A. F.; Warinner, C.: Community-curated and standardised metadata of published ancient metagenomic samples with AncientMetagenomeDir. Scientific Data 8 (1), 31, pp. 1 - 8 (2021)
10.
Journal Article
Giffin, K.; Lankapalli, A. K.; Sabin, S.; Spyrou, M. A.; Posth, C.; Kozakaitė, J.; Friedrich, R.; Miliauskienė, Ž.; Jankauskas, R.; Herbig, A. et al.; Bos, K. I.: A treponemal genome from an historic plague victim supports a recent emergence of yaws and its presence in 15th century Europe. Scientific Reports 10 (1), 9499 (2020)
11.
Journal Article
Yu, H.; Spyrou, M. A.; Karapetian, M.; Shnaider, S.; Radzeviciute, R.; Nägele, K.; Neumann, G. U.; Penske, S. E.; Zech, J.; Lucas, M. et al.; LeRoux, P.; Roberts, P.; Pavlenok, G.; Buzhilova, A.; Posth, C.; Jeong, C.; Krause, J.: Paleolithic to Bronze Age Siberians reveal connections with first Americans and across Eurasia. Cell 181 (6), 2020.04.037, pp. 1232 - 1245.e20 (2020)
12.
Journal Article
Key, F. M.; Posth, C.; Esquivel Gomez, L. R.; Hübler, R.; Spyrou, M. A.; Neumann, G. U.; Furtwängler, A.; Sabin, S.; Burri Promerová, M.; Wissgott, A. et al.; Lankapalli, A. K.; Vågene, Å. J.; Meyer, M.; Nagel, S.; Tukhbatova, R.; Khokhlov, A.; Chizhevsky, A.; Hansen, S.; Belinsky, A. B.; Kalmykov, A.; Kantorovich, A. R.; Maslov, V. E.; Stockhammer, P. W.; Vai, S.; Zavattaro, M.; Riga, A.; Caramelli, D.; Skeates, R.; Beckett, J.; Gradoli, M. G.; Steuri, N.; Hafner, A.; Ramstein, M.; Siebke, I.; Lösch, S.; Erdal, Y. S.; Alikhan, N.-F.; Zhou, Z.; Achtman, M.; Bos, K.; Reinhold, S.; Haak, W.; Kühnert, D.; Herbig, A.; Krause, J.: Emergence of human-adapted Salmonella enterica is linked to the Neolithization process. Nature Ecology & Evolution 4 (3), pp. 324 - 333 (2020)
13.
Journal Article
Spyrou, M. A.; Keller, M.; Tukhbatova, R. I.; Scheib, C. L.; Nelson, E. A.; Andrades Valtueña, A.; Neumann, G.; Walker, D.; Alterauge, A.; Carty, N. et al.; Cessford, C.; Fetz, H.; Gourvennec, M.; Hartle, R.; Henderson, M.; von Heyking, K.; Inskip, S. A.; Kacki, S.; Key, F. M.; Knox, E. L.; Later, C.; Maheshwari-Aplin, P.; Peters, J.; Robb, J. E.; Schreiber, J.; Kivisild, T.; Castex, D.; Lösch, S.; Harbeck, M.; Herbig, A.; Bos, K. I.; Krause, J.: Phylogeography of the second plague pandemic revealed through analysis of historical Yersinia pestis genomes. Nature Communications 10 (1), 4470 (2019)
14.
Journal Article
Bos, K. I.; Kühnert, D.; Herbig, A.; Esquivel Gomez, L. R.; Andrades Valtueña, A.; Barquera Lozano, R. J.; Giffin, K.; Lankapalli, A. K.; Nelson, E. A.; Sabin, S. et al.; Spyrou, M. A.; Krause, J.: Paleomicrobiology: Diagnosis and Evolution of Ancient Pathogens. Annual Review of Microbiology 73 (1), pp. 639 - 666 (2019)
15.
Journal Article
Keller, M.; Spyrou, M. A.; Scheib, C. L.; Neumann, G.; Kröpelin, A.; Haas-Gebhard, B.; Päffgen, B.; Haberstroh, J.; Lacomba, A. R.; Raynaud, C. et al.; Cessford, C.; Durand, R.; Stadler, P.; Nägele, K.; Bates, J. S.; Trautmann, B.; Inskip, S. A.; Peters, J.; Robb, J. E.; Kivisild, T.; Castex, D.; McCormick, M.; Bos, K. I.; Harbeck, M.; Herbig, A.; Krause, J.: Ancient Yersinia pestis genomes from across Western Europe reveal early diversification during the First Pandemic (541–750). Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 116 (25), pp. 12363 - 12372 (2019)
16.
Journal Article
Spyrou, M. A.; Bos, K. I.; Herbig, A.; Krause, J.: Ancient pathogen genomics as an emerging tool for infectious disease research. Nature Reviews Genetics 20, pp. 323 - 340 (2019)
17.
Journal Article
Spyrou, M. A.; Tukhbatova, R. I.; Wang, C.-C.; Andrades Valtueña, A.; Lankapalli, A. K.; Kondrashin, V. V.; Tsybin, V. A.; Khokhlov, A.; Kühnert, D.; Herbig, A. et al.; Bos, K. I.; Krause, J.: Analysis of 3800-year-old Yersinia pestis genomes suggests Bronze Age origin for bubonic plague. Nature Communications 9, 2234 (2018)
18.
Journal Article
Vågene, Å. J.; Herbig, A.; Campana, M. G.; García, R.; M., N.; Warinner, C.; Sabin, S.; Spyrou, M. A.; Andrades Valtueña, A.; Huson, D. et al.; Tuross, N.; Bos, K. I.; Krause, J.: Salmonella enterica genomes from victims of a major sixteenth-century epidemic in Mexico. Nature Ecology & Evolution 2 (3), pp. 520 - 528 (2018)
19.
Journal Article
Spyrou, M. A.; Bos, K. I.: Tracking Ancient Plagues. Natural History 125 (9), pp. 18 - 20 (2017)
20.
Journal Article
Andrades Valtueña, A.; Mittnik, A.; Key, F. M.; Haak, W.; Allmäe, R.; Belinskij, A.; Daubaras, M.; Feldman, M.; Jankauskas, R.; Janković, I. et al.; Massy, K.; Novak, M.; Pfrengle, S.; Reinhold, S.; Šlaus, M.; Spyrou, M. A.; Szécsényi-Nagy, A.; Tõrv, M.; Hansen, S.; Bos, K. I.; Stockhammer, P. W.; Herbig, A.; Krause, J.: The Stone Age plague and its persistence in Eurasia. Current Biology 27 (23), pp. 3683 - 3691 (2017)
Go to Editor View