Publications of Stephan Schiffels

Journal Article (28)

21.
Journal Article
Haak, W.; Schiffels, S.: Möglichkeiten und Grenzen molekulargenetischer Untersuchungen in den Geschichtswissenschaften. NTM: Zeitschrift für Geschichte der Wissenschaften, Technik und Medizin 26 (3), pp. 310 - 324 (2018)
22.
Journal Article
Potter, B. A.; Baichtal, J. F.; Beaudoin, A. B.; Fehren-Schmitz, L.; Haynes, C. V.; Holliday, V. T.; Holmes, C. E.; Ives, J. W.; Kelly, R. L.; Llamas, B. et al.; Malhi, R. S.; Miller, D. S.; Reich, D.; Reuther, J. D.; Schiffels, S.; Surovell, T. A.: Current evidence allows multiple models for the peopling of the Americas. Science Advances 4 (8), eaat5473 (2018)
23.
Journal Article
Loosdrecht, M. S. v. d.; Bouzouggar, A.; Humphrey, L.; Posth, C.; Barton, N.; Aximu-Petri, A.; Nickel, B.; Nagel, S.; Talbi, E. H.; Hajraoui, M. A. E. et al.; Amzazi, S.; Hublin, J.-J.; Pääbo, S.; Schiffels, S.; Meyer, M.; Haak, W.; Jeong, C.; Krause, J.: Pleistocene North African genomes link near Eastern and sub-Saharan African human populations. Science 360 (6388), pp. 548 - 552 (2018)
24.
Journal Article
Mittnik, A.; Wang, C.-C.; Pfrengle, S.; Daubaras, M.; Zariņa, G.; Hallgren, F.; Allmäe, R.; Khartanovich, V.; Moiseyev, V.; Tõrv, M. et al.; Furtwängler, A.; Andrades Valtueña, A.; Feldman, M.; Economou, C.; Oinonen, M.; Vasks, A.; Balanovska, E.; Reich, D.; Jankauskas, R.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.: The genetic prehistory of the Baltic Sea region. Nature Communications 9, 442 (2018)
25.
Journal Article
Schuenemann, V. J.; Peltzer, A.; Welte, B.; Pelt, W. P. v.; Molak, M.; Wang, C.-C.; Furtwängler, A.; Urban, C.; Reiter, E.; Nieselt, K. et al.; Teßmann, B.; Francken, M.; Harvati, K.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.: Ancient Egyptian mummy genomes suggest an increase of Sub-Saharan African ancestry in post-Roman periods. Nature Communications 8, 15694 (2017)
26.
Journal Article
Malaspinas, A.-S.; Westaway, M. C.; Muller, C.; Sousa, V. C.; Lao, O.; Alves, I.; Bergström, A.; Athanasiadis, G.; Cheng, J. Y.; Crawford, J. E. et al.; Heupink, T. H.; Macholdt, E.; Peischl, S.; Rasmussen, S.; Schiffels, S.; Subramanian, S.; Wright, J. L.; Albrechtsen, A.; Barbieri, C.; Dupanloup, I.; Eriksson, A.; Margaryan, A.; Moltke, I.; Pugach, I.; Korneliussen, T. S.; Levkivskyi, I. P.; Moreno-Mayar, J. V.; Ni, S.; Racimo, F.; Sikora, M.; Xue, Y.; Aghakhanian, F. A.; Brucato, N.; Brunak, S.; Campos, P. F.; Clark, W.; Ellingvåg, S.; Fourmile, G.; Gerbault, P.; Injie, D.; Koki, G.; Leavesley, M.; Logan, B.; Lynch, A.; Matisoo-Smith, E. A.; McAllister, P. J.; Mentzer, A. J.; Metspalu, M.; Migliano, A. B.; Murgha, L.; Phipps, M. E.; Pomat, W.; Reynolds, D.; Ricaut, F.-X.; Siba, P.; Thomas, M. G.; Wales, T.; Ma’run Wall, C.; Oppenheimer, S. J.; Tyler-Smith, C.; Durbin, R.; Dortch, J.; Manica, A.; Schierup, M. H.; Foley, R. A.; Mirazón Lahr, M.; Bowern, C.; Wall, J. D.; Mailund, T.; Stoneking, M.; Nielsen, R.; Sandhu, M. S.; Excoffier, L.; Lambert, D. M.; Willerslev, E.: A genomic history of Aboriginal Australia. Nature 538 (7624), pp. 207 - 214 (2016)
27.
Journal Article
Fu, Q.; Posth, C.; Hajdinjak, M.; Petr, M.; Mallick, S.; Fernandes , D.; Furtwängler , A.; Haak, W.; Meyer, M.; Mittnik, A. et al.; Nickel, B.; Peltzer, A.; Rohland, N.; Slon, V.; Talamo, S.; Lazaridis, I.; Lipson, M.; Mathieson, I.; Schiffels, S.; Skoglund, P.; Derevianko, A. P.; Drozdov, N.; Slavinsky, V.; Tsybankov, A.; Cremonesi, R. G.; Mallegni, F.; Gély, B.; Vacca, E.; Morales, M. R. G.; Straus, L. G.; Neugebauer-Maresch, C.; Teschler-Nicola, M.; Constantin, S.; Moldovan, O. T.; Benazzi, S.; Peresani, M.; Coppola, D.; Lari, M.; Ricci, S.; Ronchitelli, A.; Valentin, F.; Thevenet, C.; Wehrberger, K.; Grigorescu, K.; Rougier, H.; Crevecoeur, I.; Flas, D.; Semal, P.; Mannino, M. A.; Cupillard, C.; Bocherens, H.; Conard, N. J.; Harvati, K.; Moiseyev, V.; Drucker, D. G.; Svoboda, J.; Richards, M. P.; Caramelli, D.; Pinhasi, R.; Kelso, J.; Patterson, N.; Krause, J.; Pääbo, S.; Reich, D.: The genetic history of Ice Age Europe. Nature 534 (7606), 17993, pp. 200 - 205 (2016)
28.
Journal Article
Schiffels, S.; Haak, W.; Paajanen, P.; Llamas, B.; Popescu, E.; Loe, L.; Clarke, R.; Lyons, A.; Mortimer, R.; Sayer, D. et al.; Tyler-Smith, C.; Cooper, A.; Durbin, R.: Iron Age and Anglo-Saxon genomes from East England reveal British migration history. Nature Communications 7, 10408 (2016)

Book Chapter (2)

29.
Book Chapter
Schiffels, S.; Wang, K.: MSMC and MSMC2: the multiple sequentially markovian coalescent. In: Statistical population genomics, II.7, pp. 147 - 165 (Ed. Dutheil, J. Y.). Humana, New York, NY (2020)
30.
Book Chapter
Schiffels, S.; Sayer, D.: Investigating Anglo-Saxon migration history with ancient and modern DNA. In: Migration und Integration von der Urgeschichte bis zum Mittelalter: 9. Mitteldeutscher Archäologentag vom 20.-22. Oktober 2016 in Halle (Saale) (Ed. Meller, H.). Landesamt für Denkmalpflege und Archäologie Sachsen-Anhalt, Landesmuseum für Vorgeschichte, Halle (Saale) (2017)

Thesis - PhD (2)

31.
Thesis - PhD
Lamnidis, T. C.: Exploring the effects of migration and admixture on human populations through time, using ancient DNA. Dissertation, 166 pp., Friedrich Schiller University Jena, Faculty of Life Sciences [hosting institution], Jena (2021)
32.
Thesis - PhD
Wang, K.: Investigating human population structure through time with new computational methods and ancient DNA data. Dissertation, 225 pp., Friedrich Schiller University, Faculty of Biosciences, Jena (2021)

Working Paper (6)

33.
Working Paper
Jeong, C.; Balanovsky, O.; Lukianova, E.; Kahbatkyzy, N.; Flegontov, P.; Zaporozhchenko, V.; Immel, A.; Wang, C.-C.; Ixan, O.; Khussainova, E. et al.; Bekmanov, B.; Zaibert, V.; Lavryashina, M.; Pocheshkhova, E.; Yusupov, Y.; Agdzhoyan, A.; Sergey, K.; Bukin, A.; Nymadawa, P.; Churnosov, M.; Skhalyakho, R.; Daragan, D.; Bogunov, Y.; Bogunova, A.; Shtrunov, A.; Dubova, N.; Zhabagin, M.; Yepiskoposyan, L.; Churakov, V.; Pislegin, N.; Damba, L.; Saroyants, L.; Dibirova, K.; Artamentova, L.; Utevska, O.; Idrisov, E.; Kamenshchikova, E.; Evseeva, I.; Metspalu, M.; Robbeets, M.; Djansugurova, L.; Balanovska, E.; Schiffels, S.; Haak, W.; Reich, D.; Krause, J.: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia. bioRxiv, 327122 (2018)
34.
Working Paper
Wang, C.-C.; Reinhold, S. R.; Kalmykov, A.; Wissgott, A.; Brandt, G.; Jeong, C.; Cheronet, O.; Ferry, M.; Harney, E.; Keating, D. et al.; Mallick, S.; Rohland, N.; Stewardson, K.; Kantorovich, A. R.; Maslov, V. E.; Petrenko, V. G.; Erlikh, V. R.; Atabiev, B. C.; Magomedov, R. G.; Kohl, P. L.; Alt, K. W.; Pichler, S. L.; Gerling, C.; Meller, H.; Vardanyan, B.; Yeganyan, L.; Rezepkin, A. D.; Mariaschk, D.; Berezina, N. Y.; Gresky, J.; Fuchs, K.; Knipper, C.; Schiffels, S.; Balanovska, E.; Balanovsky, O.; Mathieson, I.; Higham, T.; Berezin, Y. B.; Buzhilova, A. P.; Trifonov, V.; Pinhasi, R.; Belinskiy, A. B.; Reich, D.; Hansen, S.; Krause, J.; Haak, W.: The genetic prehistory of the Greater Caucasus. bioRxiv, 322347 (2018), 30 pp.
35.
Working Paper
Lamnidis, T. C.; Majander, K.; Jeong, C.; Salmela, E.; Wessman, A.; Moiseyev, V.; Khartanovich, V.; Balanovsky, O.; Ongyerth, M.; Weihmann, A. et al.; Sajantila, A.; Kelso, J.; Pääbo, S.; Onkamo, P.; Haak, W.; Krause, J.; Schiffels, S.: Ancient Fennoscandian genomes reveal origin and spread of Siberian ancestry in Europe. bioRxiv, 285437 (2018), 25 pp.
36.
Working Paper
Potter, B. A.; Beaudoin, A. B.; Haynes, C. V.; Holliday, V. T.; Holmes, C. E.; Ives, J. W.; Kelly, R.; Llamas, B.; Malhi, R.; Miller, S. et al.; Reich, D.; Reuther, J. D.; Schiffels, S.; Surovell, T.: Arrival routes of first Americans uncertain. Science 359 (6381) pp. 1224 - 1225 (2018), 2 pp.
37.
Working Paper
Mittnik, A.; Wang, C.-C.; Pfrengle, S.; Daubaras, M.; Zariņa, G.; Hallgren, F.; Allmäe, R.; Khartanovich, V.; Moiseyev, V.; Furtwängler, A. et al.; Andrades Valtueña, A.; Feldman, M.; Economou, C.; Oinonen, M.; Vasks, A.; Tõrv, M.; Balanovsky, O.; Reich, D.; Jankauskas, R.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.: The genetic history of Northern Europe. bioRxiv, 113241 (2017), 26 pp.
38.
Working Paper
Flegontov, P.; Altinisik, N. E.; Changmai, P.; Vajda, E. J.; Krause, J.; Schiffels, S.: Na-Dene populations descend from the Paleo-Eskimo migration into America. bioRxiv, 074476 (2016), 26 pp.

Other (1)

39.
Other
Loosdrecht, M. S. v. d.; Mannino, M. A.; Talamo, S.; Villalba-Mouco, V.; Posth, C.; Aron, F.; Brandt, G.; Burri, M.; Freund, C.; Radzeviciute, R. et al.; Stahl, R.; Wissgott, A.; Klausnitzer, L.; Nagel, S.; Meyer, M.; Tagliacozzo, A.; Piperno, M.; Tusa, S.; Collina, C.; Schimmenti, V.; Salvo, R. D.; Prüfer, K.; Hublin, J.-J.; Schiffels, S.; Jeong, C.; Haak, W.; Krause, J.: Genomic and dietary transitions during the Mesolithic and Early Neolithic in Sicily, bioRxiv, (2020)

Preprint (2)

40.
Preprint
Schiffels, S.; Mustonen, V.; Lässig, M.: The asexual genome of Drosophila. (2017)
Go to Editor View