Publications of Stephen Clayton

Begg, T.; Schmidt, A.; Kocher, A.; Larmuseau, M. H.D.; Runfeldt, G.; Maier, P. A.; Wilson, J. D.; Barquera, R.; Maj, C.; Szolek, A. et al.; Sager, M.; Clayton, S.; Peltzer, A.; Hui, R.; Ronge, J.; Reiter, E.; Freund, C.; Burri Promerová, M.; Aron, F.; Tiliakou, A.; Osborn, J.; Behar, D. M.; Boecker, M.; Brandt, G.; Cleynen, I.; Strassburg, C.; Prüfer, K.; Kühnert, D.; Meredith, W. R.; Nöthen, M. M.; Attenborough, R. D.; Kivisild, T.; Krause, J.: Genomic analyses of hair from Ludwig van Beethoven. Current Biology 33 (8), 2023.02.041, pp. 1431 - 1447.e22 (2023)

Fellows Yates, J. A.; Lamnidis, T. C.; Borry, M.; Andrades Valtueña, A.; Fagernäs, Z.; Clayton, S.; Garcia, M. U.; Neukamm, J.; Peltzer, A.: Reproducible, portable, and efficient ancient genome reconstruction with nf-core/eager. PeerJ, e10947 (2021)

Adalid-Sáinz, C.; Barquera, R.; Crawford, M. H.; Lona-Sánchez, A.; Clayton, S.; Arrieta-Bolaños, E.; Delgado-Aguirre, H.; González-Medina, L.; Pacheco-Ubaldo, H.; Hernández-Zaragoza, D. I. et al.; Bravo-Acevedo, A.; Escareño-Montiel, N.; Morán-Martínez, J.; González-Martínez, M. d. R.; Jaramillo-Rodríguez, Y.; Salgado-Adame, A.; la Cruz, F. J.-d.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in three populations from Coahuila, Mexico: Torreón, Saltillo and rural Coahuila. Human Immunology 81 (9), pp. 492 - 495 (2020)

Barquera, R.; Bravo-Acevedo, A.; Clayton, S.; Munguía, T. J. R.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Adalid-Sáinz, C.; Arrieta-Bolaños, E.; Aquino-Rubio, G.; González-Martínez, M. d. R.; Lona-Sánchez, A. et al.; Martínez-Álvarez, J. C.; Arrazola-García, M. A.; Delgado-Aguirre, H.; González-Medina, L.; Pacheco-Ubaldo, H.; Juárez-Barreto, V.; Benítez-Arvizu, G.; Escareño-Montiel, N.; la Cruz, F. J.-d.; Jaramillo-Rodríguez, Y.; Salgado-Adame, A.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Nuevo León, Mexico: Monterrey and rural Nuevo León. Human Immunology 81 (9), 2019.06.003, pp. 516 - 518 (2020)

Barquera, R.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Bravo-Acevedo, A.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Acuña-Alonzo, V.; Martínez-Álvarez, J. C.; López-Gil, C.; Adalid-Sáinz, C.; Vega-Martínez, M. d. R. et al.; Escobedo-Ruíz, A.; Juárez-Cortés, E. D.; Immel, A.; Pacheco-Ubaldo, H.; González-Medina, L.; Lona-Sánchez, A.; Lara-Riegos, J.; Sánchez-Fernández, M. G. d. J.; Díaz-López, R.; Guizar-López, G. U.; Medina-Escobedo, C. E.; Arrazola-García, M. A.; Montiel-Hernández, G. D.; Hernández-Hernández, O.; la Cruz, R.-d.; Rocío, F. d.; Juárez-Nicolás, F.; Pantoja-Torres, J. A.; Rodríguez-Munguía, T. J.; Juárez-Barreto, V.; Delgado-Aguirre, H.; Escutia-González, A. B.; Goné-Vázquez, I.; Benítez-Arvizu, G.; Arellano-Prado, F. P.; García-Arias, V. E.; Rodríguez-López, M. E.; Méndez-Mani, P.; García-Álvarez, R.; González-Martínez, M. d. R.; Aquino-Rubio, G.; Escareño-Montiel, N.; Vázquez-Castillo, T. V.; Uribe-Duarte, M. G.; Ruíz-Corral, M. d. J.; Ortega-Yáñez, A.; Bernal-Felipe, N.; Gómez-Navarro, B.; Arriaga-Perea, A. J.; Martínez-Bezies, V.; Macías-Medrano, R. M.; Aguilar-Campos, J. A.; Solís-Martínez, R.; Serrano-Osuna, R.; Sandoval-Sandoval, M. J.; Jaramillo-Rodríguez, Y.; Salgado-Adame, A.; Juárez-de la Cruz, F.; Novelo-Garza, B.; Pavón-Vargas, M. d. l. Á.; Salgado-Galicia, N.; Bortolini, M. C.; Gallo, C.; Bedoya, G.; Rothhammer, F.; González-José, R.; Ruiz-Linares, A.; Canizales-Quinteros, S.; Romero-Hidalgo, S.; Krause, J.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: The immunogenetic diversity of the HLA system in Mexico correlates with underlying population genetic structure. Human Immunology 81 (9), 2020.06.008, pp. 461 - 474 (2020)

Barquera, R.; Juárez-Nicolás, F.; Martínez-Álvarez, J. C.; Ponnendai-Shanmugavel, K. S.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Vázquez-Castillo, T. V.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Solís-Martínez, R.; Ortega-Yáñez, A. et al.; Arrazola-García, M. A.; Immel, A.; Bravo-Acevedo, A.; Vega-Martínez, M. d. R.; Benítez-Arvizu, G.; García-Álvarez, R.; Martínez-Bezies, V.; Escutia-González, A.; Juárez-Barreto, V.; Salgado-Galicia, N.; Novelo-Garza, B.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Chiapas, Mexico: Tuxtla Gutiérrez and rural Chiapas. Human Immunology 81 (9), pp. 563 - 565 (2020)

Barquera, R.; Lara-Riegos, J.; Ponnendai-Shanmugavel, K. S.; Immel, A.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Solís-Martínez, R.; Bravo-Acevedo, A.; Vázquez-Castillo, T. V.; Hernández-Zaragoza, D. I. et al.; Vega-Martínez, M. d. R.; Salgado-Galicia, N.; Medina-Escobedo, C. E.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Campeche, Mexico: Campeche city and rural Campeche. Human Immunology 81 (9), pp. 566 - 568 (2020)

Barquera, R.; López-Gil, C.; Acuña-Alonzo, V.; Vega-Martínez, M. d. R.; Rodríguez-Munguía, T. J.; Martínez-Álvarez, J. C.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; la Cruz, F. d. R. R.-d.; Hernández-Zaragoza, D. I. et al.; Bravo-Acevedo, A.; Benítez-Arvizu, G.; Arrazola-García, M. A.; Aquino-Rubio, G.; Juárez-Barreto, V.; Méndez-Mani, P.; Vázquez-Castillo, T. V.; Salgado-Galicia, N.; Solís-Martínez, R.; de Pavón-Vargas, M. l. Á.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in seven populations from Veracruz, Mexico: Veracruz city, Coatzacoalcos, Córdoba, Orizaba, Poza Rica, Xalapa and rural Veracruz. Human Immunology 81 (9), pp. 531 - 534 (2020)

Barquera, R.; Martínez-Álvarez, J. C.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Bravo-Acevedo, A.; Juárez-Nicolás, F.; Arriaga-Perea, A. J.; Vega-Martínez, M. d. R.; Ortega-Yáñez, A.; Benítez-Arvizu, G.; Arrieta-Bolaños, E. et al.; Clayton, S.; Juárez-Cortés, E. D.; López-Gil, C.; García-Álvarez, R.; Arrazola-García, M. A.; Martínez-Bezies, V.; Juárez-Barreto, V.; la Cruz, F. d. R. R.-d.; Macías-Medrano, R. M.; Méndez-Mani, P.; Escutia-González, A.; Montiel-Hernández, G. D.; Immel, A.; de Pavón-Vargas, M. l. Á.; Salgado-Galicia, N.; Novelo-Garza, B.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in six populations from Mexico City Metropolitan Area, Mexico: Mexico City North, Mexico City South, Mexico City East, Mexico City West, Mexico City Center and rural Mexico City. Human Immunology 81 (9), pp. 539 - 543 (2020)

Barquera, R.; Martínez-Álvarez, J. C.; Trejo-Ordoz, A. V.; de Pavón-Vargas, M. l. Á.; Vega-Martínez, M. d. R.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Ortega-Yáñez, A.; Juárez-Cortés, E. D.; Juárez-Nicolás, F. et al.; López-Gil, C.; Immel, A.; Arrazola-García, M. A.; Juárez-Barreto, V.; Benítez-Arvizu, G.; Arriaga-Perea, A. J.; Martínez-Bezies, V.; Macías-Medrano, R. M.; la Cruz, F. d. R. R.-d.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Bravo-Acevedo, A.; Méndez-Mani, P.; Escutia-González, A. B.; Montiel-Hernández, G. D.; García-Álvarez, R.; Salgado-Galicia, N.; Novelo-Garza, B.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Hidalgo, Mexico: Pachuca and rural Hidalgo. Human Immunology 81 (9), pp. 535 - 538 (2020)

de Pavón-Vargas, M. l. Á.; Crawford, M. H.; Barquera, R.; López-Gil, C.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Bravo-Acevedo, A.; la Cruz, F. d. R. R.-d.; Méndez-Mani, P. et al.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Tlaxcala, Mexico: Tlaxcala city and rural Tlaxcala. Human Immunology 81 (9), pp. 544 - 546 (2020)

Escobedo-Ruíz, A.; Barquera, R.; González-Martín, A.; Millán, J. M. A.-S.; Uribe-Duarte, M. G.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Clayton, S.; Arrieta-Bolaños, E.; de Ruíz-Corral, M. J.; Goné-Vázquez, I. et al.; Arellano-Prado, F. P.; Martínez-Álvarez, J. C.; García-Arias, V. E.; Rodríguez-López, M. E.; Bravo-Acevedo, A.; de Sánchez-Fernández, M. G. J.; Aguilar-Campos, J. A.; Gómez-Navarro, B.; Sandoval-Sandoval, M. J.; Serrano-Osuna, R.; Yunis, E. J.; Zúñiga, J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in four populations from Baja California, Mexico: Mexicali, La Paz, Tijuana and rural Baja California. Human Immunology 81 (9), 2019.06.007, pp. 475 - 477 (2020)

Gil, C. L.; Barquera, R.; de Pavón-Vargas, M. l. Á.; la Cruz, F. d. R. R.-d.; Méndez-Mani, P.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Bravo-Acevedo, A.; Zúñiga, J. et al.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Puebla, Mexico: Puebla city and rural Puebla. Human Immunology 81 (9), pp. 547 - 549 (2020)

Goné-Vázquez, I.; Barquera, R.; Arellano-Prado, F. P.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Escobedo-Ruíz, A.; Clayton, S.; Arrieta-Bolaños, E.; García-Arias, V. E.; Rodríguez-López, M. E.; Bravo-Acevedo, A. et al.; de Sánchez-Fernández, M. G. J.; Sandoval-Sandoval, M. J.; Gómez-Navarro, B.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Nayarit, Mexico: Tepic and rural Nayarit. Human Immunology 81 (9), 2019.06.008, pp. 499 - 501 (2020)

Hernández-Hernández, O.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Barquera, R.; Warinner, C. G.; López-Gil, C.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Bravo-Acevedo, A.; la Cruz, F. d. R. R.-d.; Méndez-Mani, P. et al.; de Pavón-Vargas, M. l. Á.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Oaxaca, Mexico: Oaxaca city and rural Oaxaca. Human Immunology 81 (9), pp. 553 - 556 (2020)

Hernández-Zaragoza, D. I.; Rodríguez-Munguía, T. J.; Barquera, R.; Adalid-Sáinz, C.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Pacheco-Ubaldo, H.; González-Medina, L.; Lona-Sánchez, A.; Bravo-Acevedo, A. et al.; Aquino-Rubio, G.; González-Martínez, M. d. R.; Delgado-Aguirre, H.; Escareño-Montiel, N.; Jaramillo-Rodríguez, Y.; Salgado-Adame, A.; la Cruz, F. J.-d.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from San Luis Potosí, Mexico: San Luis Potosí City and rural San Luis Potosí. Human Immunology 81 (9), pp. 522 - 524 (2020)

Lara-Riegos, J.; Barquera, R.; Castillo-Chávez, O. d.; Medina-Escobedo, C. E.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Ponnandai-Shanmugavel, K. S.; Bravo-Acevedo, A.; Zúñiga, J. et al.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Yucatán, Mexico: Mérida and rural Yucatán. Human Immunology 81 (9), pp. 569 - 572 (2020)

Medina-Escobedo, C. E.; Barquera, R.; Ponnandai-Shanmugavel, K. S.; Lara-Riegos, J.; Bravo-Acevedo, A.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J. et al.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Quintana Roo, Mexico: Cancún and rural Quintana Roo. Human Immunology 81 (9), pp. 573 - 575 (2020)

Ortega-Yáñez, A.; Barquera, R.; Curiel-Giles, L.; Martínez-Álvarez, J. C.; Macías-Medrano, R. M.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Bravo-Acevedo, A.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Immel, A. et al.; Vega-Martínez, M. d. R.; Benítez-Arvizu, G.; Arrazola-García, M. A.; Arriaga-Perea, A. J.; Juárez-Cortés, E. D.; Juárez-Barreto, V.; Salgado-Galicia, N.; Novelo-Garza, B.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Morelos, Mexico: Cuernavaca and rural Morelos. Human Immunology 81 (9), pp. 557 - 559 (2020)

Pacheco-Ubaldo, H.; Adalid-Sáinz, C.; Barquera, R.; Clayton, S.; Arrieta-Bolaños, E.; Delgado-Aguirre, H.; González-Medina, L.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Escareño-Montiel, N.; Morán-Martínez, J. et al.; Bravo-Acevedo, A.; Lona-Sánchez, A.; González-Martínez, M. d. R.; Jaramillo-Rodríguez, Y.; Salgado-Adame, A.; la Cruz, F. J.-d.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in three populations from Chihuahua, Mexico: Chihuahua City, Ciudad Juárez and rural Chihuahua. Human Immunology 81 (9), 2019.05.014, pp. 485 - 488 (2020)