Publications of Rodrigo Barquera

Li, Q.; Chen, J.; Faux, P.; Delgado, M. E.; Bonfante, B.; Fuentes-Guajardo, M.; Mendoza-Revilla, J.; Chacón-Duque, J. C.; Hurtado, M.; Villegas, V. et al.; Granja, V.; Jaramillo, C.; Arias, W.; Barquera, R.; Everardo-Martínez, P.; Sánchez-Quinto, M.; Gómez-Valdés, J.; Villamil-Ramírez, H.; de Cerqueira, C. C. S.; Hünemeier, T.; Ramallo, V.; Wu, S.; Du, S.; Giardina, A.; Paria, S. S.; Khokan, M. R.; Gonzalez-José, R.; Schüler-Faccini, L.; Bortolini, M.-C.; Acuña-Alonzo, V.; Canizales-Quinteros, S.; Gallo, C.; Poletti, G.; Rojas, W.; Rothhammer, F.; Navarro, N.; Wang, S.; Adhikari, K.; Ruiz-Linares, A.: Automatic landmarking identifies new loci associated with face morphology and implicates Neanderthal introgression in human nasal shape. Communications Biology 6, 481 (2023)

Regino-Zamarripa, N. E.; Ramírez-Martínez, G.; Jiménez-Álvarez, L. A.; Cruz-Lagunas, A.; Gómez-García, I. A.; Ignacio-Cortés, S.; Márquez-García, J. E.; Pacheco-Hernández, L. M.; Ramírez-Noyola, J. A.; Barquera, R. et al.; Mendoza-Milla, C.; Luna-Rivero, C.; Domínguez-Cherit, J. G.; Ramírez-Rangel, R.; Rodríguez-Reyna, T. S.; Hernández-Cárdenas, C. M.; Choreño-Parra, J. A.; León-Ávila, G.; Zúñiga, J.: Differential leukocyte expression of IFITM1 and IFITM3 in patients with severe pandemic influenza A(H1N1) and COVID-19. Journal of interferon & cytokine research 42 (8), 2022.0036, pp. 430 - 443 (2022)

Childebayeva, A.; Rohrlach, A. B.; Barquera Lozano, R. J.; Rivollat, M.; Aron, F.; Szolek, A.; Kohlbacher, O.; Nicklisch, N.; Alt, K. W.; Gronenborn, D. et al.; Meller, H.; Friederich, S.; Prüfer, K.; Deguilloux, M.-F.; Krause, J.; Haak, W.: Population genetics and signatures of selection in Early Neolithic european farmers. Molecular Biology and Evolution 39 (6), msac108, pp. 1 - 17 (2022)

Chen, Y.; André, M.; Adhikari, K.; Blin, M.; Bonfante, B.; Mendoza-Revilla, J.; Fuentes-Guajardo, M.; Palmal, S.; Chacón-Duque, J.C.; Hurtado, M. et al.; Villegas, V.; Granja, V.; Jaramillo, C.; Arias, W.; Barquera Lozano, R. J.; Everardo-Martínez, P.; Gómez-Valdés, J.; Villamil-Ramírez, H.; de Cerqueira, C.C.S.; Hünemeier, T.; Ramallo, V.; Gonzalez-José, R.; Schüler-Faccini, L.; Bortolini, M.-C.; Acuña-Alonzo, V.; Canizales-Quinteros, S.; Gallo, C.; Poletti, G.; Bedoya, G.; Rothhammer, F.; Balding, D.; Tobin, D.J.; Wang, S.; Faux, P.; Ruiz-Linares, A.: A genome-wide association study identifies novel gene associations with facial skin wrinkling and mole count in Latin Americans. British Journal of Dermatology 185 (5), 20436, pp. 988 - 998 (2021)

Immel, A.; Key, F. M.; Szolek, A.; Barquera, R.; Robinson, M. K.; Harrison, G. F.; Palmer, W. H.; Spyrou, M. A.; Susat, J.; Krause-Kyora, B. et al.; Bos, K. I.; Forrest, S.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Sauter, J.; Solloch, U.; Schmidt, A. H.; Schuenemann, V. J.; Reiter, E.; Kairies, M. S.; Weiß, R.; Arnold, S.; Wahl, J.; Hollenbach, J. A.; Kohlbacher, O.; Herbig, A.; Norman, P. J.; Krause, J.: Analysis of genomic DNA from medieval plague victims suggests long-term effect of Yersinia pestis on human immunity genes. Molecular Biology and Evolution 38 (10), msab147, pp. 4059 - 4076 (2021)

Kocher, A.; Papac, L.; Barquera Lozano, R. J.; Key, F. M.; Spyrou, M. A.; Hübler, R.; Rohrlach, A. B.; Aron, F.; Stahl, R.; Wissgott, A. et al.; van Bömmel, F.; Pfefferkorn, M.; Mittnik, A.; Villalba-Mouco, V.; Neumann, G.; Rivollat, M.; Loosdrecht, M. S. v. d.; Majander, K.; Tukhbatova, R. I.; Musralina, L.; Ghalichi, A.; Penske, S. E.; Sabin, S.; Michel, M.; Gretzinger, J.; Nelson, E. A.; Ferraz da Silva, T.; Nägele, K.; Parker, C. E.; Keller, M.; Guevara, E.; Feldman, M.; Eisenmann, S.; Skourtanioti, E.; Giffin, K.; Gnecchi Ruscone, G. A.; Friederich, S.; Schimmenti, V.; Khartanovich, V.; Karapetian, M. K.; Chaplygin, M. S.; Kufterin, V. V.; Khokhlov, A. A.; Chizhevsky, A. A.; Stashenkov, D. A.; Kochkina, A. F.; Tejedor-Rodríguez, C.; de Lagrán, Í. G.-M.; Arcusa-Magallón, H.; Garrido-Pena, R.; Royo-Guillén, J. I.; Novácek, J.; Rottier, S.; Kacki, S.; Saintot, S.; Kaverzneva, E.; Belinskiy, A. B.; Velemínský, P.; Limburský, P.; Kostka, M.; Loe, L.; Popescu, E.; Clarke, R.; Lyons, A.; Mortimer, R.; Sajantila, A.; de Armas, Y. C.; Godoy, S. T. H.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Pearson, J.; Binder, D.; Lefranc, P.; Kantorovich, A. R.; Maslov, V. E.; Lai, L.; Zoledziewska, M.; Beckett, J. F.; Langová, M.; Danielisová, A.; Ingman, T.; Atiénzar, G. G.; de Ibáñez, M. P. M.; Romero, A.; Sperduti, A.; Beckett, S.; Salter, S. J.; Zilivinskaya, E. D.; Vasilev, D. V.; von Heyking, K.; Burger, R. L.; Salazar, L. C.; Amkreutz, L.; Navruzbekov, M.; Rosenstock, E.; Alonso-Fernández, C.; Slavchev, V.; Kalmykov, A. A.; Atabiev, B. C.; Batieva, E.; Calmet, M. A.; Llamas, B.; Schultz, M.; Krauß, R.; Jiménez-Echevarría, J.; Francken, M.; Shnaider, S.; de Knijff, P.; Altena, E.; de Vijver, K. V.; Fehren-Schmitz, L.; Tung, T. A.; Lösch, S.; Dobrovolskaya, M.; Makarov, N.; Read, C.; Twest, M. V.; Sagona, C.; Ramsl, P. C.; Akar, M.; Yener, K. A.; Ballestero, E. C.; Cucca, F.; Mazzarello, V.; Utrilla, P.; Rademaker, K.; Fernández-Domínguez, E.; Baird, D.; Semal, P.; Márquez-Morfín, L.; Roksandic, M.; Steiner, H.; Salazar-García, D. C.; Shishlina, N.; Erdal, Y. S.; Hallgren, F.; Boyadzhiev, Y.; Boyadzhiev, K.; Küßner, M.; Sayer, D.; Onkamo, P.; Skeates, R.; Rojo-Guerra, M.; Buzhilova, A.; Khussainova, E.; Djansugurova, L. B.; Beisenov, A. Z.; Samashev, Z.; Massy, K.; Mannino, M.; Moiseyev, V.; Mannermaa, K.; Balanovsky, O.; Deguilloux, M.-F.; Reinhold, S.; Hansen, S.; Kitov, E. P.; Dobeš, M.; Ernée, M.; Meller, H.; Alt, K. W.; Prüfer, K.; Warinner, C. G.; Schiffels, S.; Stockhammer, P. W.; Bos, K. I.; Posth, C.; Herbig, A.; Haak, W.; Krause, J.; Kühnert, D.: Ten millennia of hepatitis B virus evolution. Science 374 (6564), abi5658, pp. 182 - 188 (2021)

León-Mimila, P.; Villamil-Ramírez, H.; Macias-Kauffer, L. R.; Jacobo-Albavera, L.; López-Contreras, B. E.; Posadas-Sánchez, R.; Posadas-Romero, C.; Romero-Hidalgo, S.; Morán-Ramos, S.; Domínguez-Pérez, M. et al.; Olivares-Arevalo, M.; Lopez-Montoya, P.; Nieto-Guerra, R.; Acuña-Alonzo, V.; Macín-Pérez, G.; Barquera-Lozano, R.; Del-Río-Navarro, B. E.; González-González, I.; Campos-Pérez, F.; Gómez-Pérez, F.; Valdés, V. J.; Sampieri, A.; Reyes-García, J. G.; Carrasco-Portugal, M. d. C.; Flores-Murrieta, F. J.; Aguilar-Salinas, C. A.; Vargas-Alarcón, G.; Shih, D.; Meikle, P. J.; Calkin, A. C.; Drew, B. G.; Vaca, L.; Lusis, A. J.; Huertas-Vazquez, A.; Villarreal-Molina, T.; Canizales-Quinteros, S.: Genome-Wide Association Study Identifies a Functional SIDT2 Variant Associated With HDL-C (High-Density Lipoprotein Cholesterol) Levels and Premature Coronary Artery Disease. Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology: an Official Journal of the American Heart Association 41 (9), 120.315391, pp. 2494 - 2508 (2021)

Bonfante, B.; Faux, P.; Navarro, N.; Mendoza-Revilla, J.; Dubied, M.; Montillot, C.; Wentworth, E.; Poloni, L.; Varón-González, C.; Jones, P. et al.; Xiong, Z.; Fuentes-Guajardo, M.; Palmal, S.; Chacón-Duque, J. C.; Hurtado, M.; Villegas, V.; Granja, V.; Jaramillo, C.; Arias, W.; Barquera, R.; Everardo-Martínez, P.; Sánchez-Quinto, M.; Gómez-Valdés, J.; Villamil-Ramírez, H.; Cerqueira, C. C. S.; Hünemeier, T.; Ramallo, V.; Liu, F.; Weinberg, S. M.; Shaffer, J. R.; Stergiakouli, E.; Howe, L. J.; Hysi, P. G.; Spector, T. D.; Gonzalez-José, R.; Schüler-Faccini, L.; Bortolini, M.-C.; Acuña-Alonzo, V.; Canizales-Quinteros, S.; Gallo, C.; Poletti, G.; Bedoya, G.; Rothhammer, F.; Thauvin-Robinet, C.; Faivre, L.; Costedoat, C.; Balding, D.; Cox, T.; Kayser, M.; Duplomb, L.; Yalcin, B.; Cotney, J.; Adhikari, K.; Ruiz-Linares, A.: A GWAS in Latin Americans identifies novel face shape loci, implicating VPS13B and a Denisovan introgressed region in facial variation. Science Advances 7 (6), eabc6160, pp. 1 - 18 (2021)

Immel, A.; Pierini, F.; Rinne, C.; Meadows, J.; Barquera, R.; Szolek, A.; Susat, J.; Böhme, L.; Dose, J.; Bonczarowska, J. et al.; Drummer, C.; Fuchs, K.; Ellinghaus, D.; Kässens, J. C.; Furholt, M.; Kohlbacher, O.; Schade-Lindig, S.; Franke, A.; Schreiber, S.; Krause, J.; Müller, J.; Lenz, T. L.; Nebel, A.; Krause-Kyora, B.: Genome-wide study of a Neolithic Wartberg grave community reveals distinct HLA variation and hunter-gatherer ancestry. Communications Biology 4 (1), 113 (2021)

Adalid-Sáinz, C.; Barquera, R.; Crawford, M. H.; Lona-Sánchez, A.; Clayton, S.; Arrieta-Bolaños, E.; Delgado-Aguirre, H.; González-Medina, L.; Pacheco-Ubaldo, H.; Hernández-Zaragoza, D. I. et al.; Bravo-Acevedo, A.; Escareño-Montiel, N.; Morán-Martínez, J.; González-Martínez, M. d. R.; Jaramillo-Rodríguez, Y.; Salgado-Adame, A.; la Cruz, F. J.-d.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in three populations from Coahuila, Mexico: Torreón, Saltillo and rural Coahuila. Human Immunology 81 (9), pp. 492 - 495 (2020)

Barquera, R.; Bravo-Acevedo, A.; Clayton, S.; Munguía, T. J. R.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Adalid-Sáinz, C.; Arrieta-Bolaños, E.; Aquino-Rubio, G.; González-Martínez, M. d. R.; Lona-Sánchez, A. et al.; Martínez-Álvarez, J. C.; Arrazola-García, M. A.; Delgado-Aguirre, H.; González-Medina, L.; Pacheco-Ubaldo, H.; Juárez-Barreto, V.; Benítez-Arvizu, G.; Escareño-Montiel, N.; la Cruz, F. J.-d.; Jaramillo-Rodríguez, Y.; Salgado-Adame, A.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Nuevo León, Mexico: Monterrey and rural Nuevo León. Human Immunology 81 (9), 2019.06.003, pp. 516 - 518 (2020)

Barquera, R.; Collen, E.; Di, D.; Buhler, S.; Teixeira, J.; Llamas, B.; Nunes, J. M.; Sanchez-Mazas, A.: Binding affinities of 438 HLA proteins to complete proteomes of seven pandemic viruses and distributions of strongest and weakest HLA peptide binders in populations worldwide. HLA Immune Response Genetics 96 (3), 13956, pp. 277 - 298 (2020)

Barquera, R.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Bravo-Acevedo, A.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Acuña-Alonzo, V.; Martínez-Álvarez, J. C.; López-Gil, C.; Adalid-Sáinz, C.; Vega-Martínez, M. d. R. et al.; Escobedo-Ruíz, A.; Juárez-Cortés, E. D.; Immel, A.; Pacheco-Ubaldo, H.; González-Medina, L.; Lona-Sánchez, A.; Lara-Riegos, J.; Sánchez-Fernández, M. G. d. J.; Díaz-López, R.; Guizar-López, G. U.; Medina-Escobedo, C. E.; Arrazola-García, M. A.; Montiel-Hernández, G. D.; Hernández-Hernández, O.; la Cruz, R.-d.; Rocío, F. d.; Juárez-Nicolás, F.; Pantoja-Torres, J. A.; Rodríguez-Munguía, T. J.; Juárez-Barreto, V.; Delgado-Aguirre, H.; Escutia-González, A. B.; Goné-Vázquez, I.; Benítez-Arvizu, G.; Arellano-Prado, F. P.; García-Arias, V. E.; Rodríguez-López, M. E.; Méndez-Mani, P.; García-Álvarez, R.; González-Martínez, M. d. R.; Aquino-Rubio, G.; Escareño-Montiel, N.; Vázquez-Castillo, T. V.; Uribe-Duarte, M. G.; Ruíz-Corral, M. d. J.; Ortega-Yáñez, A.; Bernal-Felipe, N.; Gómez-Navarro, B.; Arriaga-Perea, A. J.; Martínez-Bezies, V.; Macías-Medrano, R. M.; Aguilar-Campos, J. A.; Solís-Martínez, R.; Serrano-Osuna, R.; Sandoval-Sandoval, M. J.; Jaramillo-Rodríguez, Y.; Salgado-Adame, A.; Juárez-de la Cruz, F.; Novelo-Garza, B.; Pavón-Vargas, M. d. l. Á.; Salgado-Galicia, N.; Bortolini, M. C.; Gallo, C.; Bedoya, G.; Rothhammer, F.; González-José, R.; Ruiz-Linares, A.; Canizales-Quinteros, S.; Romero-Hidalgo, S.; Krause, J.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: The immunogenetic diversity of the HLA system in Mexico correlates with underlying population genetic structure. Human Immunology 81 (9), 2020.06.008, pp. 461 - 474 (2020)

Barquera, R.; Juárez-Nicolás, F.; Martínez-Álvarez, J. C.; Ponnendai-Shanmugavel, K. S.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Vázquez-Castillo, T. V.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Solís-Martínez, R.; Ortega-Yáñez, A. et al.; Arrazola-García, M. A.; Immel, A.; Bravo-Acevedo, A.; Vega-Martínez, M. d. R.; Benítez-Arvizu, G.; García-Álvarez, R.; Martínez-Bezies, V.; Escutia-González, A.; Juárez-Barreto, V.; Salgado-Galicia, N.; Novelo-Garza, B.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Chiapas, Mexico: Tuxtla Gutiérrez and rural Chiapas. Human Immunology 81 (9), pp. 563 - 565 (2020)

Barquera, R.; Lara-Riegos, J.; Ponnendai-Shanmugavel, K. S.; Immel, A.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Solís-Martínez, R.; Bravo-Acevedo, A.; Vázquez-Castillo, T. V.; Hernández-Zaragoza, D. I. et al.; Vega-Martínez, M. d. R.; Salgado-Galicia, N.; Medina-Escobedo, C. E.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Campeche, Mexico: Campeche city and rural Campeche. Human Immunology 81 (9), pp. 566 - 568 (2020)

Barquera, R.; López-Gil, C.; Acuña-Alonzo, V.; Vega-Martínez, M. d. R.; Rodríguez-Munguía, T. J.; Martínez-Álvarez, J. C.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; la Cruz, F. d. R. R.-d.; Hernández-Zaragoza, D. I. et al.; Bravo-Acevedo, A.; Benítez-Arvizu, G.; Arrazola-García, M. A.; Aquino-Rubio, G.; Juárez-Barreto, V.; Méndez-Mani, P.; Vázquez-Castillo, T. V.; Salgado-Galicia, N.; Solís-Martínez, R.; de Pavón-Vargas, M. l. Á.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in seven populations from Veracruz, Mexico: Veracruz city, Coatzacoalcos, Córdoba, Orizaba, Poza Rica, Xalapa and rural Veracruz. Human Immunology 81 (9), pp. 531 - 534 (2020)

Barquera, R.; Martínez-Álvarez, J. C.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Bravo-Acevedo, A.; Juárez-Nicolás, F.; Arriaga-Perea, A. J.; Vega-Martínez, M. d. R.; Ortega-Yáñez, A.; Benítez-Arvizu, G.; Arrieta-Bolaños, E. et al.; Clayton, S.; Juárez-Cortés, E. D.; López-Gil, C.; García-Álvarez, R.; Arrazola-García, M. A.; Martínez-Bezies, V.; Juárez-Barreto, V.; la Cruz, F. d. R. R.-d.; Macías-Medrano, R. M.; Méndez-Mani, P.; Escutia-González, A.; Montiel-Hernández, G. D.; Immel, A.; de Pavón-Vargas, M. l. Á.; Salgado-Galicia, N.; Novelo-Garza, B.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in six populations from Mexico City Metropolitan Area, Mexico: Mexico City North, Mexico City South, Mexico City East, Mexico City West, Mexico City Center and rural Mexico City. Human Immunology 81 (9), pp. 539 - 543 (2020)

Barquera, R.; Martínez-Álvarez, J. C.; Trejo-Ordoz, A. V.; de Pavón-Vargas, M. l. Á.; Vega-Martínez, M. d. R.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Ortega-Yáñez, A.; Juárez-Cortés, E. D.; Juárez-Nicolás, F. et al.; López-Gil, C.; Immel, A.; Arrazola-García, M. A.; Juárez-Barreto, V.; Benítez-Arvizu, G.; Arriaga-Perea, A. J.; Martínez-Bezies, V.; Macías-Medrano, R. M.; la Cruz, F. d. R. R.-d.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Bravo-Acevedo, A.; Méndez-Mani, P.; Escutia-González, A. B.; Montiel-Hernández, G. D.; García-Álvarez, R.; Salgado-Galicia, N.; Novelo-Garza, B.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Hidalgo, Mexico: Pachuca and rural Hidalgo. Human Immunology 81 (9), pp. 535 - 538 (2020)

de Pavón-Vargas, M. l. Á.; Crawford, M. H.; Barquera, R.; López-Gil, C.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Bravo-Acevedo, A.; la Cruz, F. d. R. R.-d.; Méndez-Mani, P. et al.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in two populations from Tlaxcala, Mexico: Tlaxcala city and rural Tlaxcala. Human Immunology 81 (9), pp. 544 - 546 (2020)

Escobedo-Ruíz, A.; Barquera, R.; González-Martín, A.; Millán, J. M. A.-S.; Uribe-Duarte, M. G.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Clayton, S.; Arrieta-Bolaños, E.; de Ruíz-Corral, M. J.; Goné-Vázquez, I. et al.; Arellano-Prado, F. P.; Martínez-Álvarez, J. C.; García-Arias, V. E.; Rodríguez-López, M. E.; Bravo-Acevedo, A.; de Sánchez-Fernández, M. G. J.; Aguilar-Campos, J. A.; Gómez-Navarro, B.; Sandoval-Sandoval, M. J.; Serrano-Osuna, R.; Yunis, E. J.; Zúñiga, J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: Genetic diversity of HLA system in four populations from Baja California, Mexico: Mexicali, La Paz, Tijuana and rural Baja California. Human Immunology 81 (9), 2019.06.007, pp. 475 - 477 (2020)