-
Startseite
-
Archäogenetik
-
Johannes Krause
- Publikationen
-
1.
-
2.
Posth, C.; Wißing, C.; Kitagawa, K.; Pagani, L.; Holstein, L. v.; Racimo, F.; Wehrberger, K.; Conard, N. J.; Kind, C. J.; Bocherens, H. et al.; Krause, J.: Deeply divergent archaic mitochondrial genome provides lower time boundary for African gene flow into Neanderthals. Nature Communications (2017)
-
3.
Schuenemann, V. J.; Peltzer, A.; Welte, B.; Pelt, W. P. v.; Molak, M.; Wang, C.-C.; Furtwängler, A.; Urban, C.; Reiter, E.; Nieselt, K. et al.; Teßmann, B.; Francken, M.; Harvati, K.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.: Ancient Egyptian mummy genomes suggest an increase of Sub-Saharan African ancestry in post-Roman periods. Nature Communications (2017)
-
4.
-
5.
Yao, H.-B.; Wang, C.-C.; Wang, J.; Tao, X.; Shang, L.; Wen, S.-Q.; Du, Q.; Deng, Q.; Xu, B.; Huang, Y. et al.; Wang, H.-D.; Li, S.; Cong, B.; Ma, L.; Jin, L.; Krause, J.; Li, H.: Genetic structure of Tibetan populations in Gansu revealed by forensic STR loci. Scientific Reports (2017)
-
6.
Arora, N.; Schuenemann, V. J.; Jäger, G.; Peltzer, A.; Seitz, A.; Herbig, A.; Strouhal, M.; Grillová, L.; Sánchez-Busó, L.; Kühnert, D. et al.; Bos, K. I.; Davis, L. R.; Mikalová, L.; Bruisten, S.; Komericki, P.; French, P.; Grant, P. R.; Pando, M. A.; Vaulet, L. G.; Fermepin, M. R.; Martinez, A.; Centurion Lara, A.; Giacani, L.; Norris, S. J.; Šmajs, D.; Bosshard, P. P.; González-Candelas, F.; Nieselt, K.; Krause, J.; Bagheri, H. C.: Origin of modern syphilis and emergence of a pandemic Treponema pallidum cluster. Nature Microbiology (2016)
-
7.
Bos, K.; Herbig, A.; Sahl, J.; Waglechner, N.; Fourment, M.; Forrest, S. A.; Klunk, J.; Schuenemann, V. J.; Poinar, D.; Kuch, M. et al.; Golding, G. B.; Dutour, O.; Keim, P.; Wagner, D. M.; Holmes, E. C.; Krause, J.; Poinar, H. N.: Eighteenth century Yersinia pestis genomes reveal the long-term persistence of an historical plague focus. eLife (2016)
-
8.
Feldman, M.; Harbeck, M.; Keller, M.; Spyrou, M. A.; Rott, A.; Trautmann, B.; Scholz, H. C.; Päffgen, B.; Peters, J.; McCormick, M. et al.; Bos, K. I.; Herbig, A.; Krause, J.: A high-coverage Yersinia pestis genome from a 6th-century Justinianic plague victim. Molecular Biology and Evolution
33 (11), S. 2911 - 2923 (2016)
-
9.
Fu, Q.; Posth, C.; Hajdinjak, M.; Petr, M.; Mallick, S.; Fernandes , D.; Furtwängler , A.; Haak, W.; Meyer, M.; Mittnik, A. et al.; Nickel, B.; Peltzer, A.; Rohland, N.; Slon, V.; Talamo, S.; Lazaridis, I.; Lipson, M.; Mathieson, I.; Schiffels, S.; Skoglund, P.; Derevianko, A. P.; Drozdov, N.; Slavinsky, V.; Tsybankov, A.; Cremonesi, R. G.; Mallegni, F.; Gély, B.; Vacca, E.; Morales, M. R. G.; Straus, L. G.; Neugebauer-Maresch, C.; Teschler-Nicola, M.; Constantin, S.; Moldovan, O. T.; Benazzi, S.; Peresani, M.; Coppola, D.; Lari, M.; Ricci, S.; Ronchitelli, A.; Valentin, F.; Thevenet, C.; Wehrberger, K.; Grigorescu, K.; Rougier, H.; Crevecoeur, I.; Flas, D.; Semal, P.; Mannino, M. A.; Cupillard, C.; Bocherens, H.; Conard, N. J.; Harvati, K.; Moiseyev, V.; Drucker, D. G.; Svoboda, J.; Richards, M. P.; Caramelli, D.; Pinhasi, R.; Kelso, J.; Patterson, N.; Krause, J.; Pääbo, S.; Reich, D.: The genetic history of Ice Age Europe. Nature
534 (7606), 17993, S. 200 - 205 (2016)
-
10.
Gogarten , J. F.; Düx, A.; Schuenemann, V. J.; Nowak, K.; Boesch, C.; Wittig, R. M.; Krause, J.; Calvignac-Spencer, S.; Leendertz, F. H.: Tools for opening new chapters in the book of Treponema pallidum evolutionary history. Clinical Microbiology and Infection
22 (11), S. 916 - 921 (2016)
-
11.
Immel, A.; Le Cabec, A.; Bonazzi, M.; Herbig, A.; Temming, H.; Schuenemann, V. J.; Bos, K. I.; Langbein, F.; Harvati, K.; Bridault, A. et al.; Pion, G.; Julien, M.-A.; Krotova, O.; Conard, N. J.; Münzel, S. C.; Drucker, D. G.; Viola, B.; Hublin, J.-J.; Tafforeau, P.; Krause, J.: Effect of X-ray irradiation on ancient DNA in sub-fossil bones: guidelines for safe X-ray imaging. Scientific Reports (2016)
-
12.
-
13.
Lazaridis, I.; Nadel, D.; Rollefson, G.; Merrett, D. C.; Rohland, N.; Mallick, S.; Fernandes, D.; Novak, M.; Gamarra, B.; Sirak, K. et al.; Connell, S.; Stewardson, K.; Harney, E.; Fu, Q.; Gonzalez-Fortes, G.; Jones, E. R.; Roodenberg, S. A.; Lengyel, G.; Bocquentin, F.; Gasparian, B.; Monge, J. M.; Gregg, M.; Eshed, V.; Mizrahi, A.-S.; Meiklejohn, C.; Gerritsen, F.; Bejenaru, L.; Blüher, M.; Campbell, A.; Cavalleri, G.; Comas, D.; Froguel, P.; Gilbert, E.; Kerr, S. M.; Kovacs, P.; Krause, J.; McGettigan, D.; Merrigan, M.; Merriwether, D. A.; O'Reilly, S.; Richards, M. B.; Semino, O.; Shamoon-Pour, M.; Stefanescu, G.; Stumvoll, M.; Tönjes, A.; Torroni, A.; Wilson, J. F.; Yengo, L.; Hovhannisyan, N. A.; Patterson, N.; Pinhasi, R.; Reich, .: Genomic insights into the origin of farming in the ancient Near East. Nature
536 (7617), S. 419 - 424 (2016)
-
14.
Maixner, F.; Krause-Kyora, B.; Turaev, D.; Herbig, A.; Hoopmann, M. R.; Hallows, J. L.; Kusebauch, U.; Vigl, E. E.; Malfertheiner, P.; Megraud, F. et al.; O’Sullivan, N.; Cipollini, G.; Coia, V.; Samadelli, M.; Engstrand, L.; Linz, B.; Moritz, R. L.; Grimm, R.; Krause, J.; Nebel, A.; Moodley, Y.; Rattei, T.; Zink, A.: The 5300-year-old Helicobacter pylori genome of the Iceman. Science
351 (6269), S. 162 - 165 (2016)
-
15.
Mascher, M.; Schuenemann, V.J.; Davidovich, U.; Marom, N.; Himmelbach, A.; Hübner, S.; Korol, A.; David, M.; Reiter, E.; Riehl, S. et al.; Schreiber, M.; Vohr, S.H.; Green, R.E.; Dawson, I.K.; Russell, J.; Kilian, B.; Muehlbauer, G.J.; Waugh, R.; Fahima, T.; Krause, J.; Weiss, E.; Stein, N.: Genomic analysis of 6,000-year-old cultivated grain illuminates the domestication history of barley. Nature Genetics
48 (9), S. 1089 - 1095 (2016)
-
16.
Mittnik, A.; Wang, C.-C.; Svoboda, J.; Krause, J.: A molecular approach to the sexing of the triple burial at the upper paleolithic site of Dolní Věstonice. PLoS One (2016)
-
17.
Peltzer, A.; Jager, G.; Herbig, A.; Seitz, A.; Kniep, C.; Krause, J.; Nieselt, K.: EAGER: efficient ancient genome reconstruction. Genome Biology
17, 60 (2016)
-
18.
Posth, C.; Renaud, G.; Mittnik, A.; Dorothée G., D.; Rougier, H.; Cupillard, C.; Valentin, F.; Thevenet, C.; Anja, F.; Wißing, C. et al.; Francken, M.; Malina, M.; Bolus, M.; Lari, M.; Gigli, E.; Capecchi, G.; Crevecoeur, I.; Beauval, C.; Flas, D.; Germonpré, M.; Plicht, J. v. d.; Cottiaux, R.; Gély, B.; Ronchitelli, A.; Wehrberger, K.; Grigourescu, D.; Svoboda, J.; Semal, P.; Caramelli, D.; HervéBocherens, H.; Harvati, K.; Conard, N. J.; Haak, W.; Powell, A.; Krause, J.: Pleistocene mitochondrial genomes suggest a single major dispersal of non-Africans and late glacial population turnover in Europe. Current Biology
26 (6), S. 827 - 833 (2016)
-
19.
Rougier, H.; Crevecoeur, I.; Beauval, C.; Posth, C.; Flas, D.; Wissing, C.; Furtwängler, A.; Germonpré, M.; Gómez-Olivencia, A.; Semal, P. et al.; van der Plicht, J.; Bocherens, H.; Krause, J.: Neandertal cannibalism and Neandertal bones used as tools in Northern Europe. Scientific Reports (2016)
-
20.
Skoglund, P.; Posth, C.; Sirak, K.; Spriggs, M.; Valentin, F.; Bedford, S.; Clark, G. A.; Reepmeyer, C.; Petchey, F.; Fernandes, D. et al.; Fu, Q.; Harney, E.; Lipson, M.; Mallick, S.; Novak, M.; Rohland, N.; Stewardson, K.; Abdullah, S.; Cox, M. P.; Friedlaender, F. R.; Friedlaender, J. S.; Kivisild, T.; Koki, G.; Kusuma, P.; Merriwether, D. A.; Ricaut, F.-X.; Wee, J. T. S.; Patterson, N.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Reich, D.: Genomic insights into the peopling of the Southwest Pacific. Nature
538 (7626), 19844, S. 510 - 518 (2016)
-
21.
Soubrier, J.; Gower, G.; Chen, K.; Richards, S. M.; Llamas, B.; Mitchell, K. J.; Ho, S. Y. W.; Kosintsev, P.; Lee, M. S. Y.; Baryshnikov, G. et al.; Bollongino, R.; Bover, P.; Burger, J.; Chivall, D.; Crégut-Bonnoure, E.; Decker, J. E.; Doronichev, V. B.; Douka, K.; Fordham, D. A.; Fontana, F.; Fritz, C.; Glimmerveen, J.; Golovanova, L. V.; Groves, C.; Guerreschi, A.; Haak, W.; Higham, T.; Hofman-Kamińska, E.; Immel, A.; Julien, M.-A.; Krause, J.; Krotova, O.; Langbein, F.; Larson, G.; Rohrlach, A.; Scheu, A.; Schnabel, R. D.; Taylor, J. F.; Tokarska, M.; Tosello, G.; Plicht, J. v. d.; Loenen, A. v.; Vigne, J.-D.; Wooley, O.; Orlando, L.; Kowalczyk, R.; Shapiro, B.; Cooper, A.: Early cave art and ancient DNA record the origin of European bison. Nature Communications (2016)
-
22.
Spyrou, M. A.; Tukhbatova, R. I.; Feldman, M.; Drath, J.; Kacki, S.; Heredia, J. B. d.; Arnold, S.; Sitdikov, A. G.; Castex, D.; Wahl, J. et al.; Gazimzyanov, I. R.; Nurgaliev, D. K.; Herbig, A.; Bos, K. I.; Krause, J.: Historical Y. pestis genomes reveal the European Black Death as the source of ancient and modern plague pandemics. Cell Host & Microbe
19 (6), S. 874 - 881 (2016)
-
23.
Weiß, C. L.; Schuenemann, V. J.; Devos, J.; Shirsekar, G.; Reiter, E.; Gould, B. A.; Stinchcombe, J. R.; Krause, J.; Burbano, H. A.: Temporal patterns of damage and decay kinetics of DNA retrieved from plant herbarium specimens. Royal Society Open Science (2016)
-
24.
Bos, K. I.; Jaeger, G.; Schuenemann, V. J.; Vagene, A. J.; Spyrou, M. A.; Herbig, A.; Nieselt, K.; Krause, J.: Parallel detection of ancient pathogens via array-based DNA capture. Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B: Biological Sciences
370 (1660), 20130375 (2015)
-
25.
Haak, W.; Lazaridis, I.; Patterson, N.; Rohland, N.; Mallick, S.; Llamas, B.; Brandt, G.; Nordenfelt, S.; Harney, E.; Stewardson, K. et al.; Fu, Q.; Mittnik, A.; Bánffy, E.; Economou, C.; Francken, M.; Friederich, S.; Pena, R. G.; Hallgren, F.; Khartanovich, V.; Khokhlov, A.; Kunst, M.; Kuznetsov, P.; Meller, H.; Mochalov, O.; Moiseyev, V.; Nicklisch, N.; Pichler, S. L.; Risch, R.; Guerra, M. A. R.; Roth, C.; Szécsényi-Nagy, A.; Wahl, J.; Meyer, M.; Krause, J.; Brown, D.; Anthony, D.; Cooper, A.; Alt, K. W.; Reich, D.: Massive migration from the steppe was a source for Indo-European languages in Europe. Nature
522 (7555), S. 207 - 211 (2015)
-
26.
Harkins, K. M.; Buikstra, J. E.; Campbell, T.; Bos, K. I.; Johnson, E. D.; Krause, J.; Stone, A. C.: Screening ancient tuberculosis with qPCR: challenges and opportunities. Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B: Biological Sciences
370 (1660), 20130622 (2015)
-
27.
Immel, A.; Drucker, D. G.; Bonazzi, M.; Jahnke, T. K.; Munzel, S. C.; Schuenemann, V. J.; Herbig, A.; Kind, C.-J.; Krause, J.: Mitochondrial genomes of giant deers suggest their late survival in Central Europe. Scientific Reports (2015)
-
28.
Krause, J.: Ancient human migrations. Die Kunde
64, S. 87 - 99 (2015)
-
29.
Mathieson, I.; Lazaridis, I.; Rohland, N.; Mallick, S.; Patterson, N.; Roodenberg, S. A.; Harney, E.; Stewardson, K.; Fernandes, D.; Novak, M. et al.; Sirak, K.; Gamba, C.; Jones, E. R.; Llamas, B.; Dryomov, S.; Pickrell, J.; Arsuaga, J. L.; de Castro, J. M. B.; Carbonell, E.; Gerritsen, F.; Khokhlov, A.; Kuznetsov, P.; Lozano, M.; Meller, H.; Mochalov, O.; Moiseyev, V.; Guerra, M. A. R.; Roodenberg, J.; Vergès, J. M.; Krause, J.; Cooper, A.; Alt, K. W.; Brown, D.; Anthony, D.; Lalueza-Fox, C.; Haak, W.; Pinhas, R.; Reich, D.: Genome-wide patterns of selection in 230 ancient Eurasians. Nature
528, S. 499 - 503 (2015)
-
30.
Shafer, A. B. A.; Wolf, J. B. W.; Alves, P. C.; Bergstrom, L.; Bruford, M. W.; Brannstrom, I.; Colling, G.; Dalen, L.; De Meester, L.; Ekblom, R. et al.; Fawcett, K. D.; Fior, S.; Hajibabaei, M.; Hill, J. A.; Hoezel, A. R.; Hoglund, J.; Jensen, E. L.; Krause, J.; Kristensen, T. N.; Kruetzen, M.; McKay, J. K.; Norman, A. J.; Ogden, R.; Osterling, E. M.; Ouborg, N. J.; Piccolo, J.; Popovic, D.; Primmer, C. R.; Reed, F. A.; Roumet, M.; Salmona, J.; Schenekar, T.; Schwartz, M. K.; Segelbacher, G.; Senn, H.; Thaulow, J.; Valtonen, M.; Veale, A.; Vergeer, P.; Vijay, N.; Vila, C.; Weissensteiner, M.; Wennerstrom, L.; Wheat, C. W.; Zielinski, P.: Genomics and the challenging translation into conservation practice. Trends in Ecology and Evolution
30 (2), S. 78 - 87 (2015)
-
31.
Singh, P.; Benjak, A.; Schuenemann, V. J.; Herbig, A.; Avanzi, C.; Busso, P.; Nieselt, K.; Krause, J.; Vera-Cabrera, L.; Cole, S. T.: Insight into the evolution and origin of leprosy bacilli from the genome sequence of Mycobacterium lepromatosis. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA
112 (14), S. 4459 - 4464 (2015)
-
32.
Stockhammer, P. W.; Massy, K.; Knipper, C.; Friedrich, R.; Kromer, B.; Lindauer, S.; Radosavljević, J.; Wittenborn, F.; Krause, J.: Rewriting the Central European Early Bronze Age chronology: Evidence from large-scale radiocarbon dating. PLoS One (2015)
-
33.
Bos, K. I.; Harkins, K. M.; Herbig, A.; Coscolla, M.; Weber, N.; Comas, I.; Forrest, S. A.; Bryant, J. M.; Harris, S. R.; Schuenemann, V. J. et al.; Campbell, T. J.; Majander, K.; Wilbur, A. K.; Guichon, R. A.; Steadman, D. L. W.; Cook, D. C.; Niemann, S.; Behr, M. A.; Zumarraga, M.; Bastida, R.; Huson, D.; Nieselt, K.; Young, D.; Parkhill, J.; Buikstra, J. E.; Gagneux, S.; Stone, A. C.; Krause, J.: Pre-Columbian mycobacterial genomes reveal seals as a source of New World human tuberculosis. Nature
514 (7523), S. 494 - 497 (2014)
-
34.
Krause, J.: Die molekulare Stammesgeschichte des Menschen: Steckt in uns allen ein kleiner Neandertaler? Senckenberg: Natur, Forschung, Museum; das Senckenberg-Wissenschaftsmagazin
144 (7/8), S. 274 - 277 (2014)
-
35.
Lazaridis, I.; Patterson, N.; Mittnik, A.; Renaud, G.; Mallick, S.; Kirsanow, K.; Sudmant, P. H.; Schraiber, J. G.; Castellano, S.; Lipson, M. et al.; Berger, B.; Economou, C.; Bollongino, R.; Fu, Q.; Bos, K. I.; Nordenfelt, S.; Li, H.; de Filippo, C.; Pruefer, K.; Sawyer, S.; Posth, C.; Haak, W.; Hallgren, F.; Fornander, E.; Rohland, N.; Delsate, D.; Francken, M.; Guinet, J.-M.; Wahl, J.; Ayodo, G.; Babiker, H. A.; Bailliet, G.; Balanovska, E.; Balanovsky, O.; Barrantes, R.; Bedoya, G.; Ben-Ami, H.; Bene, J.; Berrada, F.; Bravi, C. M.; Brisighelli, F.; Busby, G. B. J.; Cali, F.; Churnosov, M.; Cole, D. E. C.; Corach, D.; Damba, L.; van Driem, G.; Dryomov, S.; Dugoujon, J.-M.; Fedorova, S. A.; Romero, I. G.; Gubina, M.; Hammer, M.; Henn, B. M.; Hervig, T.; Hodoglugil, U.; Jha, A. R.; Karachanak-Yankova, S.; Khusainova, R.; Khusnutdinova, E.; Kittles, R.; Kivisild, T.; Klitz, W.; Kucinskas, V.; Kushniarevich, A.; Laredj, L.; Litvinov, S.; Loukidis, T.; Mahley, R. W.; Melegh, B.; Metspalu, E.; Molina, J.; Mountain, J.; Nakkalajarvi, K.; Nesheva, D.; Nyambo, T.; Osipova, L.; Parik, J.; Platonov, F.; Posukh, O.; Romano, V.; Rothhammer, F.; Rudan, I.; Ruizbakiev, R.; Sahakyan, H.; Sajantila, A.; Salas, A.; Starikovskaya, E. B.; Tarekegn, A.; Toncheva, D.; Turdikulova, S.; Uktveryte, I.; Utevska, O.; Vasquez, R.; Villena, M.; Voevoda, M.; Winkler, C. A.; Yepiskoposyan, L.; Zalloua, P.; Zemunik, T.; Cooper, A.; Capelli, C.; Thomas, M. G.; Ruiz-Linares, A.; Tishkoff, S. A.; Singh, L.; Thangaraj, K.; Villems, R.; Comas, D.; Sukernik, R.; Metspalu, M.; Meyer, M.; Eichler, E. E.; Burger, J.; Slatkin, M.; Paeaebo, S.; Kelso, J.; Reich, D.; Krause, J.: Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Nature
513 (7518), S. 409 - 413 (2014)
-
36.
Mendum, T. A.; Schuenemann, V. J.; Roffey, S.; Taylor, G. M.; Wu, H.; Singh, P.; Tucker, K.; Hinds, J.; Cole, S. T.; Kierzek, A. M. et al.; Nieselt, K.; Krause, J.; Stewart, G. R.: Mycobacterium leprae genomes from a British medieval leprosy hospital: towards understanding an ancient epidemic. BMC Genomics (2014)
-
37.
Schünemann, V. J.; Krause, J.: Wo der Mensch auf den Hund kam: Genetische Untersuchungen deuten darauf hin, dass der Ursprung der Domestikation in Europa liegt. Senckenberg: Natur, Forschung, Museum; das Senckenberg-Wissenschaftsmagazin
144 (7/8), S. 278 - 281 (2014)
-
38.
Skoglund, P.; Northoff, B. H.; Shunkov, M. V.; Derevianko, A. P.; Paabo, S.; Krause, J.; Jakobsson, M.: Separating endogenous ancient DNA from modern day contamination in a Siberian Neandertal. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
111 (6), S. 2229 - 2234 (2014)
-
39.
Yoshida, K.; Burbano, H. A.; Krause, J.; Thines, M.; Weigel, D.; Kamoun, S.: Mining herbaria for plant pathogen genomes: Back to the future. PLoS Pathogens (2014)
-
40.
Zink, A.; Wann, L. S.; Thompson, R. C.; Keller, A.; Maixner, F.; Allam, A. H.; Finch, C. E.; Frohlich, B.; Kaplan, H.; Lombardi, G. P. et al.; Sutherland, M. L.; Sutherland, J. D.; Watson, L.; Cox, S. L.; Miyamoto, M. I.; Narula, J.; Stewart, A. F.R.; Thomas, G. S.; Krause, J.: Genomic correlates of atherosclerosis in ancient humans. Global Heart (2014)
-
41.
Fu, Q.; Mittnik, A.; Johnson, P. L. F.; Bos, K. I.; Lari, M.; Bollongino, R.; Sun, C.; Giemsch, L.; Schmitz, R.; Burger, J. et al.; Ronchitelli, A. M.; Martini, F.; Cremonesi, R. G.; Svoboda, J.; Bauer, P.; Caramelli, D.; Castellano, S.; Reich, D.; Paeaebo, S.; Krause, J.: A revised timescale for human evolution based on ancient mitochondrial genomes. Current Biology
23 (7), S. 553 - 559 (2013)
-
42.
Guschanski, K.; Krause, J.; Sawyer, S.; Valente, L. M.; Bailey, S.; Finstermeier, K.; Sabin, R.; Gilissen, E.; Sonet, G.; Nagy, Z. T. et al.; Lenglet, G.; Mayer, F.; Savolainen, V.: Next-generation museomics disentangles one of the largest primate radiations. Systematic Biology
62 (4), S. 539 - 554 (2013)
-
43.
Schuenemann, V. J.; Singh, P.; Mendum, T. A.; Krause-Kyora, B.; Jaeger, G.; Bos, K.; Herbig, A.; Economou, C.; Benjak, A.; Busso, P. et al.; Nebel, A.; Boldsen, J. L.; Kjellstrom, A.; Wu, H.; Stewart, G. R.; Taylor, G. M.; Bauer, P.; Lee, O. Y. -.; Wu, H. H. T.; Minnikin, D. E.; Besra, G. S.; Tucker, K.; Roffey, S.; Sow, S. O.; Cole, S. T.; Nieselt, K.; Krause, J.: Genome-wide comparison of medieval and modern Mycobacterium leprae. Science
341 (6142), S. 179 - 183 (2013)
-
44.
Thalmann, O.; Shapiro, B.; Chi, P.; Schuenemann, V. J.; Sawyer, S.; Greenfield, D. L.; Germonpré, M. B.; Sablin, M. V.; López-Giráldez, F.; Domingo-Roura, X. et al.; Napierala, H.; Uerpmann, H.-P.; Loponte, D. M.; Acosta, A. A.; Giemsch, L.; Schmitz, R. W.; Worthington, B.; Buikstra, J. E.; Druzhkova, A.; Graphodatsky, A. S.; Ovodov, N. D.; Wahlberg, N.; Freedman, A. H.; Schweizer, R. M.; Koepfli, K.-P.; Leonard, J. A.; Meyer, M.; Krause, J.; Pääbo, S.; Green, R. E.; Wayne, R. K.: Complete mitochondrial genomes of ancient canids suggest a European origin of domestic dogs. Science
342 (6160), S. 871 - 874 (2013)
-
45.
Yoshida, K.; Schuenemann, V. J.; Cano, L. M.; Pais, M.; Mishra, B.; Sharma, R.; Lanz, C.; Martin, F. N.; Kamoun, S.; Krause, J. et al.; Thines, M.; Weigel, D.; Burbano, H. A.: The rise and fall of the Phytophthora infestans lineage that triggered the Irish potato famine. eLife (2013)
-
46.
-
47.
Fu, Q.; Rudan, P.; Paeaebo, S.; Krause, J.: Complete mitochondrial genomes reveal neolithic expansion into Europe. PLoS One (2012)
-
48.
Krause, J.: Human origins and the search for “Missing Links”. PLoS Biology (2012)
-
49.
Sawyer, S.; Krause, J.; Guschanski, K.; Savolainen, V.; Päabo, S.: Temporal patterns of nucleotide misincorporations and DNA fragmentation in ancient DNA. PLoS One (2012)
-
50.
Bos, K. I.; Schuenemann, V. J.; Golding, G. B.; Burbano, H. A.; Waglechner, N.; Coombes, B. K.; McPhee, J. B.; DeWitte, S. N.; Meyer, M.; Schmedes, S. et al.; Wood, J.; Earn, D. J. D.; Herring, D. A.; Bauer, P.; Poinar, H. N.; Krause, J.: A draft genome of Yersinia pestis from victims of the Black Death. Nature
478 (7370), S. 506 - 510 (2011)
-
51.
Jordan, S.; Krause, J.; Prager, A.; Mitrovic, M.; Jonjic, S.; Koszinowski, U. H.; Adler, B.: Virus progeny of murine Cytomegalovirus bacterial artificial chromosome pSM3fr show reduced growth in salivary glands due to a fixed mutation of MCK-2. Journal of Virology
85 (19), S. 10346 - 10353 (2011)
-
52.
Schuenemann, V. J.; Bos, K. I.; DeWitte, S.; Schmedes, S.; Jamieson, J.; Mittnik, A.; Forrest, S.; Coombes, B. K.; Wood, J. W.; Earn, D. J. D. et al.; White, W.; Krause, J.; Poinar, H. N.: Targeted enrichment of ancient pathogens yielding the pPCP1 plasmid of Yersinia pestis from victims of the Black Death. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
108 (38), S. E746 - E752 (2011)
-
53.
Stoneking, M.; Krause, J.: Learning about human population history from ancient and modern genomes. Nature Reviews Genetics
12 (9), S. 603 - 614 (2011)
-
54.
-
55.
Burbano, H. A.; Hodges, E.; Green, R. E.; Briggs, A. W.; Krause, J.; Meyer, M.; Good, J. M.; Maricic, T.; Johnson, P. L. F.; Xuan, Z. et al.; Rooks, M.; Bhattacharjee, A.; Brizuela, L.; Albert, F. W.; Rasilla, M. d. l.; Fortea, J.; Rosas, A.; Lachmann, M.; Hannon, G. J.; Pääbo, S.: Targeted investigation of the Neandertal genome by array-based sequence capture. Science
328 (5979), S. 723 - 725 (2010)
-
56.
Green, R. E.; Krause, J.; Briggs, A. W.; Maricic, T.; Stenzel, U.; Kircher, M.; Patterson, N.; Li, H.; Zhai, W.; Fritz, M. H.-Y. et al.; Hansen, N. F.; Durand, E. Y.; Malaspinas, A.-S.; Jensen, J. D.; Marques-Bonet, T.; Alkan, C.; Prüfer, K.; Meyer, M.; Burbano, H. A.; Good, J. M.; Schultz, R.; Aximu-Petri, A.; Butthoff, A.; Höber, B.; Höffner, B.; Siegemund, M.; Weihmann, A.; Nusbaum, C.; Lander, E. S.; Russ, C.; Novod, N.; Affourtit, J.; Egholm, M.; Verna, C.; Rudan, P.; Brajkovic, D.; Kucan, Z.; Gusic, I.; Doronichev, V. B.; Golovanova, L. V.; Lalueza-Fox, C.; Rasilla, M. d. l.; Fortea, J.; Rosas, A.; Schmitz, R. W.; Johnson, P. L. F.; Eichler, E. E.; Falush, D.; Birney, E.; Mullikin, J. C.; Slatkin, M.; Nielsen, R.; Kelso, J.; Reich, D.; Lachmann, M.; Päabo, S.: A draft sequence of the Neandertal genome. Science
328 (5979), S. 710 - 722 (2010)
-
57.
-
58.
-
59.
Krause, J.: From genes to genomes: what is new in ancient DNA? Mitteilungen der Gesellschaft für Urgeschichte
19, S. 11 - 34 (2010)
-
60.
Reich, D.; Green, R. E.; Kircher, M.; Krause, J.; Patterson, N.; Durand, E. Y.; Viola, B.; Briggs, A. W.; Stenzel, U.; Johnson, P. L. F. et al.; Maricic, T.; Good, J. M.; Marques-Bonet, T.; Alkan, C.; Fu, Q.; Mallick, S.; Li, H.; Meyer, M.; Eichler, E. E.; Stoneking, M.; Richards, M.; Talamo, S.; Shunkov, M. V.; Derevianko, A. P.; Hublin, J.-J.; Kelso, J.; Slatkin, M.; Pääbo, S.: Genetic history of an archaic hominin group from Denisova cave in Siberia. Nature
468 (7327), S. 1053 - 1060 (2010)
-
61.
Briggs, A. W.; Good, J. M.; Green, R. E.; Krause, J.; Maricic, T.; Stenzel, U.; Lalueza-Fox, C.; Rudan, P.; Brajkovic, D.; Kucan, Z. et al.; Gusic, I.; Schmitz, R.; Doronichev, V. B.; Golovanova, L. V.; de la Rasilla, M.; Fortea, J.; Rosas, A.; Paeaebo, S.: Targeted retrieval and analysis of five Neandertal mtDNA genomes. Science
325 (5938), S. 318 - 321 (2009)
-
62.
Briggs, A. W.; Good, J. M.; Green, R. E.; Krause, J.; Maricic, T.; Stenzel, U.; Paabo, S.: Primer extension capture: targeted sequence retrieval from heavily degraded DNA sources (Videodocumentation). Journal of visualized experiments : JoVE (31), S. 1573 - 1573 (2009)
-
63.
-
64.
-
65.
Green, R. E.; Malaspinas, A.-S.; Krause, J.; Briggs, A. W.; Johnson, P. L. F.; Uhler, C.; Meyer, M.; Good, J. M.; Maricic, T.; Stenzel, U. et al.; Pruefer, K.; Siebauer, M.; Burbano, H. A.; Ronan, M.; Rothberg, J. M.; Egholm, M.; Rudan, P.; Brajkovic, D.; Kucan, Z.; Gusic, I.; Wikstrom, M.; Laakkonen, L.; Kelso, J.; Slatkin, M.; Paeaebo, S.: A complete Neandertal mitochondrial genome sequence determined by high-throughput sequencing. Cell
134 (3), S. 416 - 426 (2008)
-
66.
Krause, J.; Unger, T.; Nocon, A.; Malaspinas, A.-S.; Kolokotronis, S.-O.; Stiller, M.; Soibelzon, L.; Spriggs, H.; Dear, P. H.; Briggs, A. W. et al.; Bray, S. C. E.; O'Brien, S. J.; Rabeder, G.; Matheus, P.; Cooper, A.; Slatkin, M.; Paeaebo, S.; Hofreiter, M.: Mitochondrial genomes reveal an explosive radiation of extinct and extant bears near the Miocene-Pliocene boundary. BMC Evolutionary Biology (2008)
-
67.
Lalueza-Fox, C.; Gigli, E.; de la Rasilla, M.; Fortea, J.; Rosas, A.; Bertranpetit, J.; Krause, J.: Genetic characterization of the ABO blood group in Neandertals. BMC Evolutionary Biology (2008)
-
68.
-
69.
Briggs, A. W.; Stenzel, U.; Johnson, P. L. F.; Green, R. E.; Kelso, J.; Pruefer, K.; Meyer, M.; Krause, J.; Ronan, M. T.; Lachmann, M. et al.; Paeaebo, S.: Patterns of damage in genomic DNA sequences from a Neandertal. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
104 (37), S. 14616 - 14621 (2007)
-
70.
Krause, J.; Lalueza-Fox, C.; Orlando, L.; Enard, W.; Green, R. E.; Burbano, H. A.; Hublin, J.-J.; Hanni, C.; Fortea, J.; de la Rasilla, M. et al.; Bertranpetit, J.; Rosas, A.; Paabo, S.: The derived FOXP2 variant of modern humans was shared with Neandertals. Current Biology
17 (21), S. 1908 - 1912 (2007)
-
71.
Krause, J.; Orlando, L.; Serre, D.; Viola, B.; Pruefer, K.; Richards, M. P.; Hublin, J.-J.; Haenni, C.; Derevianko, A. P.; Paeaebo, S.: Neanderthals in central Asia and Siberia. Nature
449 (7164), S. 902 - 904 (2007)
-
72.
Green, R. E.; Krause, J.; Ptak, S. E.; Briggs, A. W.; Ronan, M. T.; Simons, J. F.; Du, L.; Egholm, M.; Rothberg, J. M.; Paunovic, M. et al.; Paeaebo, S.: Analysis of one million base pairs of Neanderthal DNA. Nature
444 (7117), S. 330 - 336 (2006)
-
73.
Krause, J.; Dear, P. H.; Pollack, J. L.; Slatkin, M.; Spriggs, H.; Barnes, I.; Lister, A. M.; Ebersberger, I.; Paabo, S.; Hofreiter, M.: Multiplex amplification of the mammoth mitochondrial genome and the evolution of Elephantidae. Nature
439 (7077), S. 724 - 727 (2006)
-
74.
Lalueza-Fox, C.; Krause, J.; Caramelli, D.; Catalano, G.; Milani, L.; Sampietro, M. L.; Calafell, F.; Martinez-Maza, C.; Bastir, M.; Garcia-Tabernero, A. et al.; de la Rasilla, M.; Fortea, J.; Paabo, S.; Bertranpetit, J.; Rosas, A.: Mitochondrial DNA of an Iberian Neandertal suggests a population affinity with other European neandertals. Current Biology
16 (16), S. R629 - R630 (2006)
-
75.
Noonan, J. P.; Coop, G.; Kudaravalli, S.; Smith, D.; Krause, J.; Alessi, J.; Platt, D.; Paabo, S.; Pritchard, J. K.; Rubin, E. M.: Sequencing and analysis of Neanderthal genomic DNA. Science
314 (5802), S. 1113 - 1118 (2006)
-
76.
Roempler, H.; Dear, P. H.; Krause, J.; Meyer, M.; Rohland, N.; Schoeneberg, T.; Spriggs, H.; Stiller, M.; Hofreiter, M.: Multiplex amplification of ancient DNA. Nature Protocols
1 (2), S. 720 - 728 (2006)
-
77.
Heissig, F.; Krause, J.; Bryk, J.; Khaitovich, P.; Enard, W.; Paabo, S.: Functional analysis of human and chimpanzee promoters. Genome Biology (2005)
-
78.
Noonan, J.; Hofreiter, M.; Smith, D.; Priest, J.; Rohland, N.; Rabeder, G.; Krause, J.; Detter, J.; Paabo, S.; Rubin, E.: Genomic sequencing of Pleistocene cave bears. Science
309 (5734), S. 597 - 600 (2005)
-
79.
Paabo, S.; Poinar, H.; Serre, D.; Jaenicke-Despres, V.; Hebler, J.; Rohland, N.; Kuch, M.; Krause, J.; Vigilant, L.; Hofreiter, M.: Genetic analyses from ancient DNA. Annual Review of Genetics
38, S. 645 - 679 (2004)
-
80.
Krause, J.: Ancient human migrations. In:
Migration : [Österreichischer Wissenschaftstag 2011], S. 45 - 64 (Hg. Neck, R.; Schmidinger, H.). Böhlau, Wien (2013)
-
81.
Stockhammer, P. W.; Massy, K.; Knipper, C.; Friedrich, R.; Kromer, B.; Lindauer, S.; Radosavljević, J.; Pernicka, E.; Krause, J.: Kontinuität und Wandel vom Endneolithikum zur frühen Bronzezeit in der Region Augsburg. In: 2200 BC - Ein Klimasturz als Ursache für den Zerfall der Alten Welt? 7. Mitteldeutscher Archäologentag vom 23. bis 26. Oktober 2014 in Halle (Saale), Bd.
12, 2, S. 617 - 642 (Hg. Meller, H.). 7. Mitteldeutscher Archäologentag vom 23. bis 26. Oktober 2014 in Halle (Saale), Halle (Saale), 23. Oktober 2014 - 26. Oktober 2014. (2015)
-
82.
-
83.
Gokhman, D.; Agranat-Tamir, L.; Housman, G.; Nissim-Rafinia, M.; Nieves-Colón, M.; Gu, H.; Ferrando-Bernal, M.; Gelabert, P.; Lipende, I.; Quillen, E. E. et al.; Meissner, A.; Stone, A. C.; Pusey, A. E.; Mjungu, D.; Kandel, L.; Liebergall, M.; Prada, M. E.; Vidal, J. M.; Krause, J.; Yakir, B.; Pääbo, S.; Reich, D.; Lalueza-Fox, C.; Marques-Bonet, T.; Meshorer, E.; Carmel, L.: Recent regulatory changes shaped human facial and vocal anatomy. (2017)
-
84.
Herbig, A.; Maixner, F.; Bos, K. I.; Zink, A.; Krause, J.; Huson, D. H.: MALT: Fast alignment and analysis of metagenomic DNA sequence data applied to the Tyrolean Iceman. (2017)
-
85.
Knauf, S.; Gogarten, J.; Schuenemann, V. J.; Nys, H. M. D.; Duex, A.; Strouhal, M.; Mikalova, L.; Bos, K. I.; Armstrong, R.; Batamuzi, E. K. et al.; Chuma, I. S.; Davoust, B.; Diatta, G.; Fyumagwa, R. D.; Kazwala, R. R.; Keyyu, J. D.; Lejora, I. A. V.; Levasseur, A.; Liu, H.; Mayhew, M. A.; Mediannikov, O.; Raoult, D.; Wittig, R. M.; Roos, C.; Leendertz, F. H.; Smajs, D.; Nieselt, K.; Krause, J.; Calvignac-Spencer, S.: African nonhuman primates are infected with the Yaws bacterium Treponema pallidum subsp. pertenue. (2017)
-
86.
Mittnik, A.; Wang, C.-C.; Pfrengle, S.; Daubaras, M.; Zariņa, G.; Hallgren, F.; Allmäe, R.; Khartanovich, V.; Moiseyev, V.; Furtwängler, A. et al.; Andrades Valtueña, A.; Feldman, M.; Economou, C.; Oinonen, M.; Vasks, A.; Tõrv, M.; Balanovsky, O.; Reich, D.; Jankauskas, R.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.: The genetic history of Northern Europe. (2017)
-
87.
Szecsenyi-Nagy, A.; Roth, C.; Brandt, G.; Rihuete-Herrada, C.; Tejedor-Rodriguez, C.; Held, P.; Garcia-Martinez-de-Lagran, I.; Magallon Arcusa, H.; Zesch, S.; Knipper, C. et al.; Banffy, E.; Friedrich, S.; Meller, H.; Bueno-Ramirez, P.; Barroso Bermejo, R.; de Balbin Behrmann, R.; Herrero-Coral, A. M.; Flores Fernandez, R.; Alonso Fernandez, C.; Jimenez Echevarria, J.; Rindlisbacher, L.; Oliart, C.; Fregeiro, M.-I.; Soriano, I.; Vincente, O.; Mico, R.; Lull, V.; Soler Diaz, J.; Lopez Padilla, J. A.; Roca Togores de Munoz, C.; Hernandez Perez, M. S.; Jover Maestre, F. J.; Lomba Maurandi, J.; Aviles Fernandez, A.; Lillios, K. T.; Silva, A. M.; Magalhaes Ramalho, M.; Oosterbeek, L. M.; Cunha, C.; Waterman, A. J.; Roig Buxo, J.; Martinez, A.; Ponce Martinez, J.; Hunt Ortiz, M.; Mejias-Gracia, J. C.; Pecero Espin, J. C.; Cruz-Aunon Briones, R.; Tome, T.; Carmona Ballestero, E.; Cardoso, J. L.; Araujo, A. C.; Liesau von Lettow-Vorbeck, C.; Blasco Bosqued, C.; Rios Mendoza, P.; Pujante, A.; Royo-Guillen, J. I.; Esquembre Bevia, M. A.; Dos Santos Goncalves, V. M.; Parreira, R.; Moran Hernandez, E.; Mendez Izquierdo, E.; Vega de Miguel, J.; Menduina Garcia, R.; Martinez Calvo, V.; Lopez Jimenez, O.; Krause, J.; Pichler, S. L.; Garrido-Pena, R.; Kunst, M.; Risch, R.; Rojo-Guerra, M. A.; Haak, W.; Alt, K. W.: The maternal genetic make-up of the Iberian Peninsula between the Neolithic and the Early Bronze Age. (2017)
-
88.
Vågene, Å. J.; Campana, M. G.; García, N. M. R.; Warinner, C. G.; Spyrou, M. A.; Andrades Valtueña, A.; Huson, D.; Tuross, N.; Herbig, A.; Bos, K. I. et al.; Krause, J.: Salmonella enterica genomes recovered from victims of a major 16th century epidemic in Mexico. (2017)
-
89.
Andrades Valtueña, A.; Mittnik, A.; Massy, K.; Allmae, R.; Daubaras, M.; Jankauskas, R.; Torv, M.; Pfrengle, S.; Spyrou, M. A.; Feldman, M. et al.; Haak, W.; Bos, K. I.; Stockhammer, P. W.; Herbig, A.; Krause, J.: The Stone Age plague: 1000 years of Persistence in Eurasia. (2016)
-
90.
Exposito-Alonso, M.; Becker, C.; Schuenemann, V. J.; Reiter, E.; Setzer, C.; Slovak, R.; Brachi, B.; Hagmann, J.; Grimm, D. G.; Jiahui, C. et al.; Busch, W.; Bergelson, J.; Ness, R. W.; Krause, J.; Burbano, H. A.; Weigel, D.: The rate and effect of de novo mutations in a colonizing lineage of Arabidopsis thaliana. (2016)
-
91.
Flegontov, P.; Altinisik, N. E.; Changmai, P.; Vajda, E. J.; Krause, J.; Schiffels, S.: Na-Dene populations descend from the Paleo-Eskimo migration into America. (2016)
-
92.
Lazaridis, I.; Nadel, D.; Rollefson, G.; Merrett, D. C.; Rohland, N.; Mallick, S.; Fernandes, D.; Novak, M.; Gamarra, B.; Sirak, K. et al.; Connell, S.; Stewardson, K.; Harney, E.; Fu, Q.; Gonzalez-Fortes, G.; Alpaslan Roodenberg, S.; Lengyel, G.; Bocquentin, F.; Gasparian, B.; Monge, J. M.; Gregg, M.; Eshed, V.; Mizrahi, A.-S.; Meiklejohn, C.; Gerritsen, F.; Bejenaru, L.; Blueher, M.; Campbell, A.; Cavalleri, G.; Comas, D.; Froguel, P.; Gilbert, E.; Kerr, S. M.; Kovacs, P.; Krause, J.; McGettigan, D.; Merrigan, M.; Merriwether, D. A.; O'Reilly, S.; Richards, M. B.; Semino, O.; Shamoon-Pour, M.; Stefanescu, G.; Stumvoll, M.; Tonjes, A.; Torroni, A.; Wilson, J. F.; Yengo, L.; Hovhannisyan, N. A.; Patterson, N.; Pinhasi, R.; Reich, D.: The genetic structure of the world's first farmers. (2016)
-
93.
Krause, J.: Der Europäer ist auch genetisch ein Potpourri, (2016)
https://www.shh.mpg.de/Johannes-Krause-Publikationen
